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南极冰藻Chlamydomonas sp. ICE-L光修复酶基因及其修复DNA紫外损伤分子机制研究

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第一章 前言第12-28页
   ·南极极端环境概论第12-14页
     ·南极低温环境第12页
     ·南极强辐射环境第12页
     ·UVB辐射对冰藻的伤害第12-14页
   ·DNA损伤修复机制概述第14-17页
     ·切除修复第14-15页
     ·错配修复第15-16页
     ·光复活修复第16-17页
   ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L及其适应性研究第17-22页
     ·南极冰藻生态学和应用意义第17页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L基本特征第17-21页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L的适应机制第21-22页
   ·DNA光修复酶研究进展第22-26页
     ·DNA光修复酶的结构第22-23页
     ·DNA光修复酶的分类第23页
     ·DNA光修复酶的作用机理第23-25页
     ·光修复酶活性研究进展第25-26页
   ·本论文拟采用的研究路线、目的和意义第26-28页
     ·本论文拟采用的技术路线第26页
     ·本论文研究目的和意义第26-28页
第二章 南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L光修复酶基因PHR2的克隆与生物信息学分析第28-44页
   ·材料与方法第28-30页
     ·藻种第28页
     ·试剂、菌种和培养基第28-29页
     ·仪器及软件第29-30页
     ·引物设计及合成第30页
   ·试验方法第30-37页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L总RNA提取与鉴定第30-31页
     ·cDNA第一链的合成第31-32页
     ·cDNA特异片段的PCR扩增第32页
     ·目的片段的回收第32-33页
     ·目的片段与载体的连接第33-34页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备及转化第34页
     ·挑取单菌落进行阳性检测第34-35页
     ·cDNA的3’-和5’-端的RACE-PCR扩增第35-37页
     ·生物信息学分析第37页
   ·结果与分析第37-43页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L总RNA的提取鉴定第37-38页
     ·PHR2特异片段的测序结果与序列同源性分析第38-39页
     ·cDNA 3’-和5’-端的RACE-PCR扩增与鉴定第39-40页
     ·PHR2 cDNA和氨基酸序列分析第40-41页
     ·PHR2系统进化树分析第41-43页
   ·讨论与总结第43-44页
第三章 南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L PHR2表达调控第44-49页
   ·材料与方法第44-45页
     ·藻种第44页
     ·试剂和仪器第44页
     ·定量引物设计第44-45页
     ·数据处理第45页
   ·试验方法第45-46页
     ·胁迫诱导第45页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L总RNA提取及cDNA合成第45页
     ·实时荧光定量PCR反应体系第45-46页
   ·结果与分析第46-47页
     ·强光对PHR2基因的转录调控第46-47页
     ·紫外对PHR2基因的转录调控第47页
   ·讨论与总结第47-49页
第四章 南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L PHR2蛋白原核表达第49-60页
   ·材料与方法第49-50页
     ·菌株与质粒第49页
     ·质粒构建相关试剂第49-50页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳相关试剂第50页
   ·试验方法第50-55页
     ·引物设计与目的片段的扩增第50-51页
     ·表达载体pET-28a-PHR2的构建第51-53页
     ·表达菌株的诱导表达第53-54页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第54-55页
   ·结果与分析第55-58页
     ·PHR2基因ORF的扩增第55页
     ·质粒提取结果第55-56页
     ·菌落PCR筛选阳性克隆第56-57页
     ·PHR2蛋白的诱导表达第57-58页
   ·讨论与总结第58-60页
第五章 南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L PHR2光修复酶蛋白表达条件的优化第60-77页
   ·材料与方法第60-61页
     ·菌株与培养基第60-61页
     ·仪器、试剂及软件第61页
   ·试验方法第61-65页
     ·牛血清蛋白(BSA)标准曲线的绘制第61-62页
     ·单因素实验第62-64页
     ·响应面(RSM)设计和分析第64-65页
   ·结果与分析第65-75页
     ·单因素实验结果第65-68页
     ·响应面设计和分析第68-75页
     ·分析结果验证第75页
   ·讨论与总结第75-77页
第六章 南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L PHR2光修复酶蛋白的纯化鉴定及其体内外活性检测第77-88页
   ·材料与方法第77-78页
     ·菌株和培养基第77页
     ·仪器和试剂第77-78页
   ·试验方法第78-80页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L PHR2蛋白的纯化第78-79页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L PHR2蛋白的鉴定第79页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L光修复酶体内活性检测第79-80页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L光修复酶体外活性检测第80页
   ·结果与分析第80-86页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L PHR2蛋白的纯化第80-82页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L PHR2蛋白的鉴定第82-84页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L光修复酶体内活性检测第84-85页
     ·南极冰藻Chlamydomonas sp.ICE-L光修复酶体外活性检测第85-86页
   ·讨论与总结第86-88页
第七章 总结与后续工作计划第88-90页
   ·总结第88-89页
   ·后续工作计划第89-90页
参考文献第90-98页
硕士期间发表文章第98-100页
致谢第100页

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