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阿扎霉素F3a生物合成相关基因的克隆和功能分析

摘要第1-15页
ABSTRACT第15-17页
第一章 文献综述第17-40页
   ·链霉菌简介第17-19页
     ·链霉菌形态及分类学定位第17-18页
     ·链霉菌染色体线型以及遗传不稳定性第18-19页
   ·抗生素生物合成的分子生物学研究进展第19-28页
     ·抗生素简介第19-20页
     ·抗生素合成的调控第20-22页
     ·抗生素生物合成基因簇的研究进展第22-24页
     ·链霉菌抗生素生物合成基因的功能分析第24-25页
     ·组合生物合成及其在聚酮合酶改造中的应用第25-28页
   ·天然产物与组合生物学第28-31页
     ·天然产物研究的现状第28-30页
     ·天然产物的组合生物学研究第30-31页
   ·链霉菌遗传操作系统第31-32页
     ·链霉菌遗传操作系统的建立第31-32页
     ·阿扎霉素产生菌遗传操作系统的建立和优化第32页
   ·阿扎霉素简介第32-35页
   ·腈水解酶超家族简介第35-39页
     ·腈水解酶超家族的生理学意义第35页
     ·腈水解酶超家族的分类第35-36页
     ·腈水解酶超家族的分类依据第36-38页
     ·腈水解酶超家族的应用第38-39页
   ·本课题的研究目的及意义第39-40页
第二章 实验材料和方法第40-54页
   ·实验材料第40-48页
     ·菌株第40-41页
     ·质粒第41-42页
     ·引物及其序列第42-44页
     ·培养基和化学试剂第44-46页
     ·表达蛋白第46-47页
     ·化合物底物第47-48页
   ·实验方法第48-54页
     ·链霉菌培养及菌种保藏第48页
     ·梯度平板法对链霉菌抗生素敏感性的测定第48-49页
     ·链霉菌-大肠杆菌属间接合转移第49页
     ·大肠杆菌质粒DNA的提取(普通质粒小提试剂盒)第49-50页
     ·DNA片段的回收(DNA纯化回收试剂盒)第50页
     ·链霉菌总DNA的少量提取第50-51页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第51页
     ·大肠杆菌转化实验第51页
     ·链霉菌质粒DNA的大量提取第51-52页
     ·阿扎霉素及其衍生物的快速提取第52页
     ·阿扎霉素及其衍生物的HPLC-MS检测分析第52页
     ·Azl13及其点突变蛋白分子量的LC-ESI-HRMS检测第52页
     ·生物信息学分析第52-53页
     ·Azl13芳基酰基酰胺酶活性产物的HPLC分析第53页
     ·阿扎霉素产生菌Streptomyces sp.211726的菌种保藏号和基因azl13Genebank序列登录号第53-54页
第三章 阿扎霉素产生菌Streptomyces sp.211726遗传操作系统的建立第54-64页
   ·引言第54-55页
   ·结果与分析第55-62页
     ·Streptomyces sp.211726培养条件的优化第55-56页
     ·Streptomyces sp.211726抗性敏感性测试第56-57页
     ·接合转移质粒的选择第57-59页
     ·基于菌丝体的接合转移系统第59-60页
     ·基于孢子的接合转移系统第60页
     ·pYH7接合转移子的验证第60-61页
     ·pSET152和pIB139接合转移子的验证第61-62页
   ·小结与讨论第62-64页
第四章 阿扎霉素生物合成基因簇的定位及鉴定第64-76页
   ·引言第64页
   ·结果与分析第64-74页
     ·阿扎霉素F系列化合物生物合成基因簇的生物信息学分析第64-70页
     ·阿扎霉素生物合成基因簇的确定第70-74页
   ·小结与讨论第74-76页
第五章 阿扎霉素F_(3a)生物合成基因簇边界的确定及基因功能分析第76-85页
   ·引言第76页
   ·结果与分析第76-84页
     ·阿扎霉素F_(3a)生物合成基因簇左边界的分析与确定第76-80页
     ·阿扎霉素F(3a)生物合成基因簇右边界的分析与确定第80-84页
   ·小结与讨论第84-85页
第六章 阿扎霉素F_(3a)生物合成基因簇中非PKS基因的功能研究和生物合成途径的推测第85-113页
   ·引言第85-88页
   ·结果与分析第88-111页
     ·azl13(酰胺酶同源基因)的体内敲除第88-91页
     ·Azl13(酰胺酶同源蛋白)的体外酶学催化第91-93页
     ·azl5(酰基转移酶同源基因)的体内敲除第93-97页
     ·azl6(TetR家族转录调控因子同源基因)体内敲除第97-100页
     ·azl7(α/β水解酶同源基因)体内敲除第100-103页
     ·azl10(纤维素结合蛋白同源基因)体内敲除第103-107页
     ·azl8 (HxlR家族转录调控同源基因)体内敲除第107-111页
   ·小结与讨论第111-113页
第七章 Azl13酶学功能分析第113-123页
   ·引言第113-114页
   ·结果与分析第114-122页
     ·azl13基因的克隆、蛋白表达和纯化第114-115页
     ·Azl13的温度和pH稳定性第115-117页
     ·Azl13的底物特异性第117-120页
     ·Azl13的酶抑制剂第120页
     ·Azl13活性位点的定点突变第120-122页
   ·小结与讨论第122-123页
第八章 总结与展望第123-126页
   ·本研究工作总结第123-124页
   ·本研究工作展望第124-126页
参考文献第126-132页
攻读博士期间的科研成果第132页
已申请的发明专利第132-133页
致谢第133-134页

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