| 摘要 | 第1-3页 |
| Abstract | 第3-6页 |
| 引言 | 第6-7页 |
| 第一章 资料与方法 | 第7-13页 |
| ·病人一般资料 | 第7-9页 |
| ·样本收集 | 第9页 |
| ·实验试剂及实验仪器 | 第9页 |
| ·实验试剂 | 第9页 |
| ·实验仪器 | 第9页 |
| ·样品DNA提取 | 第9-10页 |
| ·16SrRNA基因扩增 | 第10页 |
| ·文库检测与454测序 | 第10-11页 |
| ·文库样品检测与纯化 | 第10页 |
| ·文库上机处理 | 第10-11页 |
| ·454测序 | 第11页 |
| ·物种分类与丰度分析 | 第11页 |
| ·获得OTU | 第11页 |
| ·基于OUT的物种组成和丰度分析 | 第11页 |
| ·样品复杂度分析 | 第11-12页 |
| ·单个样品复杂度分析 | 第11-12页 |
| ·样品间复杂度分析 | 第12页 |
| ·不同样品物种组成聚类分析 | 第12页 |
| ·样品间显著性差异分析 | 第12页 |
| ·统计学分析 | 第12-13页 |
| 第二章 结果 | 第13-23页 |
| ·丰富度与多样性分析 | 第13-14页 |
| ·各组肠道菌群结构概况 | 第14-18页 |
| ·癌、癌旁、正常和腺瘤组织肠道菌群结构在不同水平上的比较 | 第18-19页 |
| ·癌组织和粪便肠道菌群结构在不同水平上的比较 | 第19页 |
| ·细菌相对丰度与结直肠癌疾病进程的关系 | 第19-20页 |
| ·细菌相对丰度与距离结直肠癌肿瘤距离的关系 | 第20页 |
| ·细菌相对丰度与结直肠癌疾病状态的关系 | 第20-21页 |
| ·其他重要菌属的变化趋势 | 第21-23页 |
| 第三章 讨论 | 第23-25页 |
| 第四章 结论 | 第25-26页 |
| 参考文献 | 第26-31页 |
| 综述 | 第31-53页 |
| 参考文献 | 第40-53页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |