D类β-内酰胺酶抑制剂的理论研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-15页 |
| ·引言 | 第9-10页 |
| ·β-内酰胺酶和抑制剂的研究现状 | 第10-13页 |
| ·β-内酰胺酶的分类 | 第10-11页 |
| ·β-内酰胺酶的结构和特点 | 第11-12页 |
| ·β-内酰胺酶抑制剂的研究进展 | 第12-13页 |
| ·研究意义及创新之处 | 第13-15页 |
| 第2章 理论基础及计算方法 | 第15-21页 |
| ·分子对接理论 | 第15页 |
| ·分子对接的分类 | 第15-16页 |
| ·几种有代表性的对接方法 | 第16页 |
| ·分子对接中的重要问题 | 第16-17页 |
| ·配体和受体相互作用的类型 | 第17页 |
| ·溶剂效应 | 第17-18页 |
| ·分子动力学模拟 | 第18-20页 |
| ·分子力场及其分类 | 第18-20页 |
| ·MM/PBSA 的计算方法 | 第20页 |
| ·本章小结 | 第20-21页 |
| 第3章 D类β-内酰胺酶和小分子抑制剂的选取 | 第21-26页 |
| ·D 类β-内酰胺酶的选取和实验准备 | 第21-23页 |
| ·D 类β-内酰胺酶的选取 | 第21-22页 |
| ·D 类β-内酰胺酶晶体结构的实验准备 | 第22-23页 |
| ·小分子抑制剂的选取 | 第23-25页 |
| ·本章小结 | 第25-26页 |
| 第4章 分子对接计算 | 第26-32页 |
| ·引言 | 第26页 |
| ·计算步骤 | 第26页 |
| ·分子对接结果 | 第26-31页 |
| ·本章小结 | 第31-32页 |
| 第5章 分子动力学模拟及结合自由能计算 | 第32-44页 |
| ·引言 | 第32页 |
| ·实验步骤及参数设置 | 第32-34页 |
| ·结果与讨论 | 第34-42页 |
| ·OXA-1 和小分子 a 复合物体系 | 第34-36页 |
| ·OXA-1 和小分子 b 复合物体系 | 第36-38页 |
| ·OXA-1 和小分子 c 复合物体系 | 第38-40页 |
| ·OXA-1 和小分子 d 复合物体系 | 第40-42页 |
| ·本章小结 | 第42-44页 |
| 结论 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-49页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第49-50页 |
| 致谢 | 第50页 |
