| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-14页 |
| 1 蜜蜂分工研究进展 | 第9页 |
| 2 表观遗传学与DNA甲基化 | 第9-12页 |
| 3 sir2,ash2,hdac1研究进展 | 第12页 |
| 4 DNA甲基化研究方法 | 第12-13页 |
| 5 DGE | 第13页 |
| 6 本论文的研究内容 | 第13-14页 |
| 第二章 工蜂分工全基因组甲基化图谱分析 | 第14-24页 |
| 1 引言 | 第14页 |
| 2 材料与方法 | 第14-18页 |
| ·实验材料 | 第14-15页 |
| ·实验蜜蜂 | 第14页 |
| ·实验器材与试剂 | 第14-15页 |
| ·实验方法 | 第15-18页 |
| ·DNA提取与MeDIP-seq | 第15-16页 |
| ·碱基质量值的筛选与clean reads的获取 | 第16页 |
| ·MeDIP-Seq序列与西方蜜蜂基因组比对 | 第16页 |
| ·甲基化差异基因元件 | 第16-17页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析与KEGG Pathway显著性富集分析 | 第17-18页 |
| 3 结果 | 第18-23页 |
| ·MeDIP-seq总体比对分析DNA甲基化结果 | 第18-19页 |
| ·DNA甲基化在转录起始位点附近的分布 | 第19页 |
| ·reads在重复区域的分布情况 | 第19-20页 |
| ·peak在各基因元件上的覆盖度 | 第20-22页 |
| ·各样品之间甲基化差异基因 | 第22页 |
| ·GO功能富集与KEGG通路分析 | 第22-23页 |
| 4 讨论 | 第23-24页 |
| 第三章 工蜂分工数字基因表达谱比较 | 第24-36页 |
| 1 引言 | 第24页 |
| 2 材料与方法 | 第24-26页 |
| ·实验材料 | 第24页 |
| ·实验蜜蜂 | 第24页 |
| ·实验器材与试剂 | 第24页 |
| ·实验方法 | 第24-26页 |
| ·创建DGE文库并测序 | 第24-25页 |
| ·碱基质量值的筛选与clean tags的获取 | 第25页 |
| ·DGE标签与西方蜜蜂基因组与转录组数据库比对分析 | 第25-26页 |
| ·差异表达基因 | 第26页 |
| ·Gene Ontology功能显著性富集分析与KEGG Pathway显著性富集分析 | 第26页 |
| 3 结果 | 第26-34页 |
| ·测序结果统计 | 第26-27页 |
| ·测序质量评估 | 第27-30页 |
| ·测序饱和度分析 | 第30页 |
| ·DGE标签的分布 | 第30-32页 |
| ·样品间差异表达的基因 | 第32-33页 |
| ·GO功能富集分析与KEGG通路分析 | 第33-34页 |
| 4 讨论 | 第34-36页 |
| 第四章 sir2,hdac1与ash2在雌性蜜蜂中的表达分析 | 第36-41页 |
| 1 引言 | 第36页 |
| 2 材料与方法 | 第36-39页 |
| ·实验材料 | 第36-37页 |
| ·实验蜂群 | 第36-37页 |
| ·实验试剂及仪器 | 第37页 |
| ·实验方法 | 第37-38页 |
| ·RNA的提取与cDNA的合成 | 第37页 |
| ·引物设计与实时定量PCR | 第37-38页 |
| ·数据分析 | 第38-39页 |
| 3 结果 | 第39-40页 |
| 4. 讨论 | 第40-41页 |
| 第五章 结论与展望 | 第41-42页 |
| 1 主要结论 | 第41页 |
| 2 研究展望 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-46页 |
| 附件1 甲基化上调下调基因元件 | 第46-50页 |
| 攻读硕士期间发表论文情况 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51页 |
