| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 1. 文献综述 | 第10-17页 |
| ·MYB转录因子 | 第10-13页 |
| ·起源和结构 | 第10-11页 |
| ·玉米MYB转录因子 | 第11-12页 |
| ·MYB结合位点 | 第12-13页 |
| ·MYB相关逆境信号转导途径 | 第13-14页 |
| ·基因组规模的靶基因预测方法 | 第14-17页 |
| ·实验鉴定结合位点 | 第15-16页 |
| ·计算机建模预测 | 第16-17页 |
| ·研究目的及意义 | 第17页 |
| 2 材料和方法 | 第17-31页 |
| ·MYB转录因子结合位点预测 | 第17-22页 |
| ·检索已试验验证的转录因子靶基因 | 第17-19页 |
| ·下载拟南芥和玉米基因组及注释 | 第19-20页 |
| ·整理训练数据和待测数据 | 第20-21页 |
| ·HexDIFF算法转化序列为六聚体频率 | 第21页 |
| ·Lib-SVM预测转录因子结合位点 | 第21-22页 |
| ·GO富集分析预测结果 | 第22页 |
| ·MYB-IF25融合蛋白的原核表达和纯化 | 第22-27页 |
| ·实验材料 | 第22-23页 |
| ·试剂配制 | 第23页 |
| ·原核表达载体的构建 | 第23-25页 |
| ·MYB-IF25蛋白的表达与纯化 | 第25-27页 |
| ·MYB-IF25融合蛋白与DNA探针的体外结合试验 | 第27-31页 |
| ·仪器与试剂 | 第27页 |
| ·试剂配制 | 第27-28页 |
| ·DNA探针设计与合成 | 第28-29页 |
| ·凝胶阻滞迁移试验结合反应 | 第29-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-46页 |
| ·玉米B73基因组范围的MYB预测靶基因 | 第31-36页 |
| ·玉米B73启动子数据库 | 第31页 |
| ·预测结合位点 | 第31-32页 |
| ·预测靶基因 | 第32-34页 |
| ·预测靶基因的基因本位富集分析 | 第34-36页 |
| ·MYB-IF25融合蛋白的原核表达 | 第36-40页 |
| ·表达载体的构建 | 第36页 |
| ·目的片段的测序鉴定 | 第36页 |
| ·大肠杆菌BL21重组子的鉴定 | 第36-37页 |
| ·目的蛋白的试表达 | 第37-38页 |
| ·MYB-IF25蛋白在宿主菌中的表达分布 | 第38页 |
| ·MYB-IF25/6×His融合蛋白的纯化 | 第38-40页 |
| ·MYB-IF25融合蛋白与DNA探针体外结合试验 | 第40-46页 |
| ·与Bz2(-74)及其点突变探针的体外结合 | 第40-41页 |
| ·与Bz2(-74)侧翼序列点突变探针的体外结合 | 第41-42页 |
| ·与Bz2(-74)和Bz2(-106)的体外结合 | 第42页 |
| ·与机选预测结合位点的体外结合 | 第42-46页 |
| 4 讨论 | 第46-48页 |
| ·靶基因预测 | 第46页 |
| ·预测靶基因参与植物抗逆反应 | 第46-47页 |
| ·影响原核表达的几个重要因素 | 第47页 |
| ·预测结果的体外结合验证 | 第47-48页 |
| ·MYB结合位点可变性探讨 | 第48页 |
| 小结 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-52页 |
| 附录1 凝胶阻滞迁移探针合成 | 第52-54页 |
| 附录2 预测靶基因及功能描述 | 第54-65页 |
| 附录3 预测靶基因显著的GO注释(P≤0.05) | 第65-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
