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人类基因组中血清反应因子(SRF)潜在顺式作用元件搜索及其特征研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-9页
第一章 文献综述第9-19页
   ·MADS 蛋白质家族第9-12页
     ·MADS 蛋白质家族的空间特征第10页
     ·MADS 蛋白质家族的生物学功能第10-11页
     ·MADS 蛋白质家族的DNA 结合片段第11-12页
   ·血清反应因子(SRF)及其结合序列第12-14页
     ·血清反应因子(SRF)相关背景知识第12-13页
     ·SRF 结合的顺势作用元件(CArG-box)相关背景知识第13页
     ·关于血清反应因子及其顺势作用元件的研究近况第13-14页
   ·与本研究相关的实验方法第14-18页
     ·基于微阵列技术的染色体免疫共沉淀技术(Chip-on-chip)第14-15页
     ·生物信息学在转录调控因子的顺式作用元件研究过程中的发展第15-18页
   ·选题的目的、意义及创新点第18-19页
第二章 CArG-box 的搜索及统计分析第19-29页
   ·实验流程第19页
   ·具体实验步骤第19-29页
     ·下载人类全基因数据第19-22页
     ·下载Chip-on-chip 数据集第22-25页
     ·剪切人类去基因组第25页
     ·剪切数据准确性验证第25-26页
     ·搜索潜在CArG-box第26-28页
     ·潜在CArG-box 的统计学分析第28-29页
第三章 实验结果第29-33页
   ·实验结果第29-33页
     ·潜在CArG-box 的搜索结果第29页
     ·四种细胞系已知功能CArG-box 搜索结果第29-30页
     ·靶片段位于荒漠区和不同片段含有CArG-box 数量的统计结果第30-31页
     ·对潜在CArG-box 序列特征的统计分析结果第31页
     ·对潜在CArG-box 内部个位点碱基分布的统计分析结果第31-33页
第四章 实验结论与讨论第33-35页
参考文献第35-38页
致谢第38-39页
作者简介第39页

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