| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 1. 绪论 | 第10-37页 |
| ·地质微生物研究进展 | 第10-28页 |
| ·地质微生物学定义 | 第10页 |
| ·地质微生物学研究方向 | 第10-11页 |
| ·地质微生物学研究方法 | 第11-17页 |
| ·地质微生物学新进展 | 第17-28页 |
| ·国际大洋钻探计划(ODP)及中国大陆科学钻探工程(CCSD)简介 | 第28-29页 |
| ·中国大陆科学钻探地质微生物学研究进展 | 第29-35页 |
| ·CCSD27 个岩心样品的DAPI 分析结果与深度对照 | 第30-32页 |
| ·CCSD 地温梯度 | 第32-34页 |
| ·CCSD 岩心样品微生物丰度分布 | 第34页 |
| ·CCSD 岩心样品微生物多样性研究 | 第34-35页 |
| ·前人研究的缺陷 | 第35页 |
| ·研究目的及意义 | 第35-37页 |
| ·界定生物圈下限 | 第35-36页 |
| ·可能发现新菌种资源 | 第36页 |
| ·推动矿床地质微生物学的发展 | 第36页 |
| ·新物种新用途 | 第36-37页 |
| 2. 材料与方法 | 第37-62页 |
| ·实验材料 | 第37-39页 |
| ·主要试剂 | 第37-38页 |
| ·主要实验仪器设备 | 第38-39页 |
| ·实验方法 | 第39-42页 |
| ·采样及样品处理 | 第39-41页 |
| ·地化分析 | 第41-42页 |
| ·微生物培养分离 | 第42-50页 |
| ·富集培养基设计及培养条件 | 第43-49页 |
| ·分离 | 第49-50页 |
| ·微生物种属鉴定 | 第50-56页 |
| ·形态：荧光显微镜、SEM/TEM | 第53-54页 |
| ·革兰氏染色 | 第54页 |
| ·G +C 含量测定 | 第54-55页 |
| ·种属:16S rRNA 基因测序 | 第55-56页 |
| ·微生物生理生化指标测试 | 第56-58页 |
| ·蛋白质量测定指示生物量 | 第56-57页 |
| ·生长温度范围曲线 | 第57页 |
| ·生长pH 范围测定 | 第57页 |
| ·耐受盐度范围 | 第57页 |
| ·抗生素抗性测定 | 第57-58页 |
| ·微生物功能指标测试 | 第58-62页 |
| ·产H_2S 及CH_4 的测定 | 第58页 |
| ·分离的菌株与各种矿物氧化还原作用测试 | 第58-62页 |
| 3. 结果 | 第62-84页 |
| ·地化指标 | 第62页 |
| ·可分离微生物菌种鉴定 | 第62-64页 |
| ·生理生化指标 | 第64-72页 |
| ·蛋白质量测定指示生物量 | 第64-65页 |
| ·生长温度范围曲线 | 第65-68页 |
| ·生长pH 范围测定 | 第68-70页 |
| ·抗生素抗性测定 | 第70-71页 |
| ·生长所需碳源测定 | 第71-72页 |
| ·微生物功能指标测试 | 第72-84页 |
| ·产H_2S 及CH_4 的测定 | 第72页 |
| ·分离的菌株与各种矿物氧化还原作用测试 | 第72-76页 |
| ·普通光镜与扫描电镜（SEM）的形态测定结果 | 第76-77页 |
| ·透射电镜（TEM）的形态测定结果 | 第77-79页 |
| ·G+C 含量测定 | 第79页 |
| ·分离的菌株与NAu-2 的氧化还原反应 | 第79-80页 |
| ·分离的厌氧菌对钒的还原作用的测定结果 | 第80-81页 |
| ·分离的厌氧菌对针铁矿的还原作用的测定结果 | 第81-84页 |
| 4. 讨论分析 | 第84-90页 |
| ·培养基的设计 | 第84-88页 |
| ·嗜碱、铁还原的特性 | 第88页 |
| ·指示意义 | 第88-90页 |
| 5 结论与展望 | 第90-92页 |
| ·本研究结论 | 第90页 |
| ·极端环境地质微生物的应用前景 | 第90-92页 |
| 致谢 | 第92-94页 |
| 参考文献 | 第94-99页 |
| 附录 | 第99-122页 |
| 1.发表的文章 | 第99-100页 |
| ·S rRNA 测序结果 | 第100-119页 |
| 3.TEM 和SEM 图版 | 第119-122页 |
| 个人简历 | 第122页 |