| 摘要 | 第1-14页 |
| Abstract | 第14-17页 |
| 文献综述 | 第17-30页 |
| 1 植物与病原真菌互作的研究进展 | 第17-23页 |
| ·植物与病原真菌互作的形态和细胞学基础 | 第17-19页 |
| ·植物与病原真菌互作的生理代谢基础 | 第19-20页 |
| ·植物与病原真菌互作的分子基础 | 第20-23页 |
| 2 甘蔗黑穗病菌小种分化与甘蔗抗黑穗病机制研究进展 | 第23-28页 |
| ·甘蔗黑穗病菌小种分化研究进展 | 第23-24页 |
| ·甘蔗对黑穗病的形态和细胞学抗性 | 第24-26页 |
| ·甘蔗对黑穗病的生理生化抗性 | 第26-27页 |
| ·甘蔗对黑穗病的分子水平抗性 | 第27-28页 |
| 3 本研究的目的、意义与研究内容 | 第28-30页 |
| ·目的及意义 | 第28-29页 |
| ·研究内容 | 第29-30页 |
| 第一章 甘蔗黑穗病菌(Ustilago scitaminea Syd.)的分子多样性研究 | 第30-56页 |
| 1 前言 | 第30-32页 |
| 2 材料和方法 | 第32-34页 |
| ·分离物来源 | 第32页 |
| ·DNA的提取 | 第32页 |
| ·甘蔗黑粉菌鉴定 | 第32-33页 |
| ·RAPD分析 | 第33页 |
| ·SRAP分析 | 第33页 |
| ·ITS-PCR分析 | 第33页 |
| ·数据处理 | 第33-34页 |
| ·RAPD和SRAP的数据分析 | 第34页 |
| ·序列分析 | 第34页 |
| 3 结果和分析 | 第34-50页 |
| ·黑粉菌鉴定 | 第34-35页 |
| ·DNA提取效果检测 | 第34-35页 |
| ·黑粉菌鉴定 | 第35页 |
| ·RAPD分析 | 第35-40页 |
| ·RAPD扩增图谱分析 | 第35-37页 |
| ·供试分离物的RAPD相异性 | 第37-39页 |
| ·供试分离物的RAPD亲缘关系 | 第39-40页 |
| ·SRAP分析 | 第40-44页 |
| ·SRAP图谱分析 | 第40-41页 |
| ·供试分离物的SRAP相异性 | 第41-43页 |
| ·供试分离物的SRAP亲缘关系 | 第43-44页 |
| ·RAPD和SRAP综合分析 | 第44-46页 |
| ·ITS分析 | 第46-50页 |
| 4 讨论和结论 | 第50-54页 |
| ·甘蔗黑穗病菌的分子分化同其地理来源和寄主品种间的关系 | 第50-52页 |
| ·甘蔗黑穗病菌的分子分化同其地理来源的关系 | 第50-51页 |
| ·甘蔗黑穗病菌的分子分化同其寄主品种的关系 | 第51-52页 |
| ·ITS序列分析在甘蔗黑穗病菌小种分化研究中的应用 | 第52-53页 |
| ·甘蔗黑穗病菌的小种分化 | 第53-54页 |
| 5 研究展望 | 第54-56页 |
| 第二章 甘蔗与黑穗病菌互作的基因差异表达研究 | 第56-78页 |
| 1 前言 | 第56-57页 |
| 2 材料与方法 | 第57-63页 |
| ·供试材料 | 第57页 |
| ·植物材料 | 第57页 |
| ·生化试剂 | 第57页 |
| ·研究方法 | 第57-63页 |
| ·病原菌接种方法 | 第57页 |
| ·cDNA芯片杂交 | 第57-62页 |
| ·总RNA的提取和纯化 | 第57-58页 |
| ·RNA线性放大 | 第58-60页 |
| ·荧光探针的制备 | 第60页 |
| ·荧光探针的纯化 | 第60页 |
| ·荧光探针的定量 | 第60-61页 |
| ·芯片杂交 | 第61页 |
| ·芯片洗涤 | 第61页 |
| ·cDNA芯片杂交的数据分析 | 第61-62页 |
| ·cDNA克隆测序及序列分析 | 第62页 |
| ·实时荧光定量PCR验证芯片杂交数据 | 第62-63页 |
| 3 结果与分析 | 第63-70页 |
| ·cDNA芯片杂交效果 | 第63-64页 |
| ·甘蔗与黑穗病菌互作后上调表达EST的筛选与功能分类 | 第64-66页 |
| ·cDNA芯片杂交结果的定量PCR验证 | 第66-70页 |
| 4 讨论与结论 | 第70-77页 |
| ·斑茅旱胁迫cDNA芯片用于研究甘蔗与黑穗病菌互作基因差异表达的可行性 | 第70-72页 |
| ·甘蔗与黑穗病菌互作差异表达基因的功能及其作用模式 | 第72-77页 |
| ·蛋白质合成与修饰相关基因及其功能 | 第72-73页 |
| ·碳水化合物代谢相关基因及其功能 | 第73页 |
| ·细胞信号转导相关基因及其功能 | 第73-74页 |
| ·转录相关基因及其功能 | 第74页 |
| ·核酸代谢相关基因及其功能 | 第74-75页 |
| ·离子转运相关基因及其功能 | 第75页 |
| ·甘蔗与黑穗病菌互作中起其它作用的基因及其功能 | 第75-77页 |
| 5 基因组学与蛋白组学的综合应用 | 第77-78页 |
| 第三章 甘蔗与黑穗病菌互作的差异蛋白分析 | 第78-95页 |
| 1 前言 | 第78-79页 |
| 2 材料与方法 | 第79-81页 |
| ·供试材料 | 第79页 |
| ·试验方法 | 第79-81页 |
| ·病原菌接种 | 第79页 |
| ·叶片全蛋白提取 | 第79页 |
| ·蛋白裂解和含量测定 | 第79页 |
| ·第一向等电聚焦 | 第79-80页 |
| ·第二向SDS-PEGE | 第80页 |
| ·差异蛋白的胶内酶解 | 第80-81页 |
| ·质谱分析与数据库检索 | 第81页 |
| 3 结果与分析 | 第81-90页 |
| ·黑穗病菌胁迫下甘蔗叶片蛋白质双向电泳图谱分析 | 第81-83页 |
| ·差异表达蛋白质点的MALDI-TOF-TOF/MS分析 | 第83-90页 |
| 4 讨论和结论 | 第90-94页 |
| 5 研究展望 | 第94-95页 |
| 第四章 甘蔗抗病基因类似物的分离 | 第95-114页 |
| 1 前言 | 第95-96页 |
| 2 材料与方法 | 第96-104页 |
| ·材料 | 第96-97页 |
| ·植物材料 | 第96页 |
| ·供试菌株和质粒 | 第96页 |
| ·引物序列 | 第96-97页 |
| ·主要分子生物学及生化试剂 | 第97页 |
| ·方法 | 第97-104页 |
| ·RNA提取 | 第97页 |
| ·cDNA合成 | 第97-98页 |
| ·DNA提取方法 | 第98-99页 |
| ·PCR反应体系与程序 | 第99-100页 |
| ·目的片段的克隆 | 第100-101页 |
| ·目的片段的回收 | 第100页 |
| ·目的片段的连接和转化 | 第100-101页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第101页 |
| ·阳性克隆鉴定 | 第101-102页 |
| ·PCR鉴定 | 第101页 |
| ·酶切鉴定 | 第101-102页 |
| ·甘蔗抗病基因类似物多样性及进化关系分析方法 | 第102-103页 |
| ·PIC基因功能的定量PCR分析 | 第103-104页 |
| ·材料培养及处理 | 第103页 |
| ·总RNA的提取 | 第103页 |
| ·定量PCR分析 | 第103-104页 |
| 3 结果与分析 | 第104-111页 |
| ·甘蔗NBS类RGA的分离与鉴定 | 第104-105页 |
| ·甘蔗RGA编码氨基酸序列的比对及聚类分析 | 第105-108页 |
| ·甘蔗PIC基因的表达分析 | 第108-111页 |
| ·PIC基因和25S rRNA基因的定量PCR分析效果 | 第108-109页 |
| ·PIC基因在不同处理条件下的表达分析 | 第109-111页 |
| ·PIC基因在甘蔗根、茎和叶片中的表达情况 | 第111页 |
| 4 讨论与结论 | 第111-113页 |
| 5 研究展望 | 第113-114页 |
| 第五章 甘蔗抗病相关基因SNLR的克隆与表达分析 | 第114-131页 |
| 1 前言 | 第114页 |
| 2 材料与方法 | 第114-118页 |
| ·植物材料和处理 | 第114页 |
| ·试剂、载体及菌株 | 第114-115页 |
| ·研究方法 | 第115-118页 |
| ·SNLR基因3'和5'端的克隆 | 第115-117页 |
| ·RACE引物 | 第115页 |
| ·3'RACE扩增 | 第115-116页 |
| ·5'RACE扩增 | 第116-117页 |
| ·目的片段的克隆与鉴定 | 第117页 |
| ·SNLR基因的表达特点分析 | 第117-118页 |
| ·总RNA的提取 | 第117页 |
| ·定量PCR分析 | 第117-118页 |
| 3 结果与分析 | 第118-127页 |
| ·甘蔗SNLR基因cDNA全长克隆及序列分析 | 第118-120页 |
| ·甘蔗SNLR基因编码蛋白质氨基酸的结构分析 | 第120-122页 |
| ·甘蔗SNLR基因所编码的蛋白质氨基酸保守结构分析 | 第120页 |
| ·甘蔗SNLR基因所编码的蛋白质产物的疏水性分析 | 第120-121页 |
| ·甘蔗SNLR基因所编码的蛋白产物的二级结构分析 | 第121-122页 |
| ·甘蔗SNLR基因的系统进化分析 | 第122-123页 |
| ·甘蔗SNLR基因的表达特性 | 第123-127页 |
| ·SNLR基因和25S rRNA基因的PCR分析效果 | 第123-124页 |
| ·不同外源胁迫因素对甘蔗SNLR基因表达的影响 | 第124-126页 |
| ·SNLR基因在甘蔗根、茎和叶片中的表达情况 | 第126-127页 |
| 4 讨论与结论 | 第127-129页 |
| 5 研究展望 | 第129-131页 |
| 第六章 甘蔗黑穗病抗性评价分子标记的筛选与转化 | 第131-138页 |
| 1 前言 | 第131-132页 |
| 2 材料与方法 | 第132-133页 |
| ·材料 | 第132页 |
| ·植物材料 | 第132页 |
| ·主要试剂 | 第132页 |
| ·方法 | 第132-133页 |
| ·甘蔗抗黑穗病鉴定方法 | 第132页 |
| ·甘蔗DNA提取、抗感池制备和引物筛选 | 第132页 |
| ·RAPD反应体系与程序 | 第132-133页 |
| ·多态性DNA片段克隆与测序 | 第133页 |
| ·SCAR标记的转化与验证 | 第133页 |
| ·SCAR标记的应用 | 第133页 |
| 3 结果与分析 | 第133-136页 |
| ·甘蔗黑穗病抗性评价分子标记的筛选 | 第133-134页 |
| ·甘蔗黑穗病抗性评价分子标记的克隆与测序 | 第134-135页 |
| ·SCAR标记的转化与验证 | 第135页 |
| ·SCAR标记的应用 | 第135-136页 |
| 4 讨论和结论 | 第136-138页 |
| 第七章 结论与创新点 | 第138-140页 |
| 1 结论 | 第138页 |
| 2 创新点 | 第138-140页 |
| 参考文献 | 第140-156页 |
| 附录I 缩略词表 | 第156-157页 |
| 附录Ⅱ NBS类抗病基因类似物的氨基酸序列 | 第157-159页 |
| 附录Ⅲ SNLR基因全长序列 | 第159-163页 |
| 导师简历 | 第163-164页 |
| 个人简介 | 第164-165页 |
| 致谢 | 第165页 |
