| 中文摘要 | 第1-8页 |
| 英文摘要 | 第8-12页 |
| 第一部分 综述 | 第12-57页 |
| 1.尖吻蝮研究概述, | 第12-26页 |
| ·分类学及分布 | 第12-18页 |
| ·形态学研究 | 第18页 |
| ·生态学研究 | 第18-19页 |
| ·蛇毒及抗蛇毒蛋白研究 | 第19-24页 |
| ·濒危状况及人工繁育研究 | 第24-26页 |
| 2.亲缘地理学及其研究进展 | 第26-47页 |
| ·亲缘地理学的兴起 | 第26-29页 |
| ·亲缘地理学主要理论和方法,及应用实例 | 第29-47页 |
| ·采样 | 第30-33页 |
| ·遗传标记的选择 | 第33-34页 |
| ·分子系统发育分析(传统的亲缘重建) | 第34-41页 |
| ·多重序列的对位排列 | 第36页 |
| ·替代模型检验 | 第36-37页 |
| ·构建进化树 | 第37-38页 |
| ·进化树评估(系统发育的统计检验) | 第38页 |
| ·系统发育分析在亲缘地理学中的应用 | 第38-41页 |
| ·网状支系分析(网络图) | 第41-47页 |
| ·多棱椎网状图(Pyramids) | 第44-45页 |
| ·分裂网状图(Split decomposition) | 第45页 |
| ·中央连接网络图(Median-joining network) | 第45页 |
| ·最小跨度网络图(Mimimum spanning network) | 第45页 |
| ·统计简约网络图(Statistical parsimony network) | 第45-46页 |
| ·遗传距离网络图(Netting) | 第46-47页 |
| 3.保护遗传学及其研究进展 | 第47-57页 |
| ·确定进化显著性单元(Evolutionarily significant units,ESUs) | 第47-50页 |
| ·进化显著性单元的应用与评价 | 第50-52页 |
| ·AMOVA(Analysis of MOlecular VAriance)层次分析(hierarchical analysis) | 第52-55页 |
| ·单倍型多样性指数(h)和核苷酸多样性指数(π) | 第55-57页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第57-69页 |
| 1.采样 | 第57-59页 |
| 2.实验步骤 | 第59-64页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第59-62页 |
| ·酚—氯仿抽提法 | 第59-61页 |
| ·高盐浓度抽提法 | 第61-62页 |
| ·PCR(Polymerase Chain Reaction)扩增 | 第62-64页 |
| ·DNA纯化和回收 | 第64页 |
| ·测序 | 第64页 |
| 3.序列的初步分析和饱和性检验 | 第64-65页 |
| 4.系统发育分析 | 第65-66页 |
| ·二叉树重建方法 | 第65页 |
| ·确定核苷酸进化的最佳模型(Modeltest) | 第65页 |
| ·自展分析(bootstrap)和贝叶斯后验概率(posterior probability) | 第65-66页 |
| 5.种群统计学分析 | 第66-69页 |
| ·构建单倍型网络(TCS;statistical parsimony) | 第66页 |
| ·Mantel test:检验IBD假设(Isolation By Distance) | 第66页 |
| ·AMOVA层次分析(hierarchical analysis) | 第66-67页 |
| ·分子钟检验和测定扩张年代(dating expansions) | 第67-68页 |
| ·计算核苷酸多样性指数π(nucleotide diversity) | 第68-69页 |
| 第三部分 结果与分析 | 第69-84页 |
| 1.序列基本分析 | 第69-71页 |
| 2.饱和性检验 | 第71页 |
| 3.单倍型在种群中的分布 | 第71-74页 |
| 4.检验IBD模型的Mantel test | 第74-75页 |
| 5.系统发育重建 | 第75-77页 |
| 6.鉴别位点(diagnostic site) | 第77-79页 |
| 7.AMOVA层次分析 | 第79-80页 |
| 8.单倍型网络(Statistical parsimony network) | 第80-81页 |
| 9.不配对分布(mismatch distribution) | 第81页 |
| 10.核苷酸多样性(Nucleotide diversity) | 第81-84页 |
| 第四部分 讨论 | 第84-91页 |
| 1.起源及扩散 | 第84-86页 |
| 2.瓶颈与区域扩张 | 第86-87页 |
| 3.隔离和东西分化 | 第87-88页 |
| 4.保护管理 | 第88-91页 |
| 第五部分 结论 | 第91-93页 |
| 参考文献 | 第93-104页 |
| 博士期间第一作者的论文 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105-108页 |
