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盐生杜氏藻EPSP合成酶基因的克隆、功能鉴定及其结构的光谱学性质分析

摘要第1-19页
ABSTRACT第19-23页
前言第23-26页
第一章 盐生杜氏藻EPSP合成酶基因的克隆第26-46页
 摘要第26-27页
 1. 材料与方法第27-36页
   ·实验材料第27-28页
     ·藻种第27页
     ·菌种第27页
     ·培养基及部分溶液第27-28页
     ·酶制剂和试剂盒第28页
     ·引物合成及测序第28页
     ·主要仪器第28页
   ·实验方法第28-36页
     ·盐藻EPSP合成酶基因EST序列的获得第28-29页
     ·盐藻总RNA的提取第29-30页
     ·扩增盐藻EPSP合成酶基因3’末端序列(3’RACE)第30-35页
       ·cDNA的合成第30-31页
       ·3’末端的第一轮扩增第31-32页
       ·巢式PCR第32页
       ·TA克隆及其验证第32-35页
     ·扩增盐藻EPSP合成酶基因5’末端序列第35-36页
       ·首链cDNA的合成第35页
       ·5’末端的第一轮扩增第35-36页
       ·巢式PCR第36页
       ·TA克隆及其验证第36页
 2 结果第36-41页
   ·盐藻总RNA的提取第36-37页
   ·3’RACE第37-39页
   ·5’RACE第39-41页
 3 讨论第41-45页
   ·盐藻总RNA的提取第41页
   ·cDNA末端快速扩增法(RACE)第41-45页
 小结第45-46页
第二章 盐生杜氏藻EPSP合成酶基因的序列及结构分析第46-64页
 摘要第46-47页
 1 分析方法第47-50页
   ·相似性搜索第47页
   ·序列阅读框分析第47页
   ·疏水性分析第47页
   ·BLOCKs分析和功能结构域的预测第47-48页
   ·叶绿体转运肽预测第48页
   ·二级结构预测第48页
   ·三级结构预测第48-49页
   ·多重序列比对第49-50页
   ·系统发育分析第50页
 2 分析结果第50-58页
   ·相似性搜索第50-51页
   ·序列开放阅读框分析第51-52页
   ·疏水性分析第52-53页
   ·BLOCKs分析和功能结构域预测第53页
   ·叶绿体转运肽预测第53-54页
   ·二级结构预测第54-55页
   ·三级结构预测第55-56页
   ·多重序列比对第56-58页
   ·系统发育分析第58页
 3 讨论第58-63页
 小结第63-64页
第三章 盐藻EPSP合成酶在大肠杆菌中的表达和纯化第64-82页
 摘要第64-65页
 1 实验材料第65-66页
   ·质粒和菌株第65页
   ·酶和主要试剂第65-66页
   ·培养基第66页
   ·引物合成及测序第66页
 2 实验方法第66-71页
   ·盐藻EPSP合成酶的原核表达第66-69页
     ·引物设计第66-67页
     ·盐藻EPSP合成酶基因片段扩增第67-68页
     ·重组表达载体的构建以及转化第68-69页
     ·重组蛋白的表达第69页
   ·重组盐藻EPSP合成酶的纯化第69-71页
     ·表达条件的优化第69-70页
       ·IPTG浓度的优化第69-70页
       ·诱导温度的优化第70页
     ·GST融合蛋白的纯化第70页
     ·去GST的重组蛋白的纯化第70-71页
   ·蛋白浓度的测定第71页
 3 结果第71-77页
   ·盐藻EPSP合成酶的原核表达第71-73页
   ·表达条件的优化第73-75页
   ·重组蛋白的纯化第75-77页
 4 讨论第77-81页
   ·融合表达系统第77-78页
   ·表达和酶切条件的优化第78-80页
   ·酶切方式的选择第80-81页
 小结第81-82页
第四章 盐藻EPSP合成酶的功能鉴定第82-96页
 摘要第82-83页
 1 实验材料和方法第83-85页
   ·实验材料第83页
     ·菌株第83页
     ·主要试剂第83页
     ·培养基第83页
   ·实验方法第83-85页
     ·转EPSP合成酶基因的大肠杆菌ER2799第83页
     ·体内功能互补实验第83-84页
     ·草甘膦抗性实验第84页
     ·EPSP合成酶表达量同草甘膦抗性的关系第84-85页
       ·通过诱导时间的变化来改变EPSP合成酶的表达量第84页
       ·通过IPTG浓度的变化来改变EPSP合成酶的表达量第84-85页
     ·芳香族氨基酸的互补作用第85页
 2 实验结果第85-92页
   ·转基因大肠杆菌ER2799的构建第85页
   ·功能互补第85-87页
   ·盐藻EPSP合成酶提高了大肠杆菌对草甘膦的抗性第87-89页
   ·盐藻EPSP合成酶的表达量与大肠杆菌草甘膦的抗性成正比第89-91页
     ·通过诱导时间的变化来改变EPSP合成酶的表达量第89-90页
     ·通过IPTG浓度的变化来改变EPSP合成酶的表达量第90-91页
   ·芳香族氨基酸的互补作用第91-92页
 3 讨论第92-95页
 小结第95-96页
第五章 盐藻EPSP合成酶与底物作用的光谱学性质分析第96-107页
 摘要第96-97页
 1 材料与方法第97页
   ·实验材料及仪器第97页
   ·荧光光谱测定第97页
 2 实验结果第97-98页
   ·EPSP合成酶结合了S3P和PEP后的荧光变化第97-98页
   ·草甘膦和磷离子对酶荧光光谱的影响第98页
 3 讨论第98-106页
   ·S3P对酶构象的影响第100-101页
   ·磷离子协助S3P导致酶构象的改变第101-102页
   ·不同波长下激发出的荧光光谱第102-104页
   ·一种可能的EPSP合成酶活性检测新方法第104-106页
 小结第106-107页
第六章 草甘膦耐受性盐藻的培育以及其产生草甘膦耐受性的原因第107-125页
 摘要第107-108页
 1 实验材料第108页
   ·藻种第108页
   ·试剂和试剂盒第108页
   ·引物合成及测序第108页
   ·主要仪器第108页
 2 实验方法第108-113页
   ·盐藻培养基及培养方法第108页
   ·草甘膦抑制下盐藻的生长曲线第108-109页
   ·草甘膦耐受性盐藻的培育第109页
   ·草甘膦的胁迫处理第109页
   ·盐藻总RNA的提取第109-110页
   ·反转录第110页
   ·引物设计第110-111页
   ·实时荧光定量PCR第111页
   ·实验结果的处理第111-113页
 3 实验结果第113-119页
   ·草甘膦抑制下盐藻的生长曲线第113页
   ·具有草甘膦耐受性的盐藻第113-114页
   ·草甘膦耐受性盐藻的EPSP合成酶基因的克隆第114-115页
   ·引物特异性的验证第115页
   ·标准曲线和溶解曲线第115-117页
   ·耐受不同浓度草甘膦盐藻体内EPSP合成酶的表达差异第117页
   ·草甘膦胁迫下盐藻EPSP合成酶的表达变化第117-119页
 4 讨论第119-124页
   ·草甘膦抗性获得的途径第119-121页
   ·盐藻细胞最佳光吸收波长的确定第121页
   ·实时荧光定量PCR第121-124页
 小结第124-125页
结论第125-127页
参考文献第127-133页
综述 莽草酸循环第133-154页
参考文献第154-174页
在读期间科研成果及获奖情况第174-175页
致谢第175-176页

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