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中国牛亚科家畜六个群体遗传多样性与遗传分化及其统计方法的研究

中文摘要第1-15页
英文摘要第15-21页
第一章 文献综述第21-56页
   ·遗传多样性与中国牛亚科家畜遗传资源概况第21-30页
     ·家畜的遗传多样性及其意义第21-23页
     ·中国牛亚科家畜的起源与驯化第23-28页
     ·中国牛亚科家畜遗传资源现状第28-30页
   ·牛亚科家畜遗传多样性与遗传分化研究-国外研究部分第30-40页
     ·牛亚科家畜形态外貌的差异第30-31页
     ·牛亚科家畜核型特征多样性第31-32页
     ·牛亚科家畜血液蛋白多样性第32-34页
     ·牛亚科家畜微卫星多态性第34-37页
     ·牛亚科家畜mtDNA遗传分化第37-39页
     ·牛亚科家畜核糖体DNA的遗传分化第39-40页
   ·中国牛亚科家畜遗传多样性研究第40-46页
     ·形态学水平的研究第40-41页
     ·染色体水平的研究第41-42页
     ·血液蛋白(酶)遗传多态性的研究第42-43页
     ·分子水平的研究第43-46页
   ·动物遗传多样性研究中的统计方法第46-51页
     ·群体遗传学一般统计学指标第46-47页
     ·Hardy-Weinberg平衡检验第47页
     ·连锁不平衡分析第47-48页
     ·基因流分析及遗传分化度量第48-49页
     ·遗传距离第49页
     ·系统树构建常用的两种方法—NJ法和UPGMA法第49-50页
     ·系统树构建准确性的评价第50页
     ·基于贝叶斯(Bayes)概率论的个体鉴定方法第50-51页
     ·Weitzman遗传多样性指标的计算第51页
   ·Weitzman遗传多样性及其应用第51-54页
     ·Weitzman遗传多样性的基本理论第51-53页
     ·基于Weitzman遗传多样性三种不同的保种经费优化模型第53页
     ·Weitzman遗传多样性在家畜遗传多样性研究中的应用与发展第53-54页
   ·本研究的目的和意义第54-56页
第二章 从血液蛋白多态和微卫星分析六个牛群体的遗传多样性与遗传分化第56-110页
   ·试验材料与方法第56-66页
     ·实验材料第56-57页
     ·实验方法第57-63页
     ·统计分析第63-66页
   ·结果第66-93页
     ·群体遗传变异水平第66-73页
     ·Hardy-Weinberg平衡检验第73-76页
     ·连锁不平衡分析第76-80页
     ·遗传分化度量与基因流分析第80-84页
     ·遗传距离及系统发生树的构建第84-92页
     ·分化时间第92-93页
   ·讨论第93-110页
     ·不同群体遗传结构及群体遗传变异水平第93-97页
     ·群体间遗传分化与亲缘关系第97-99页
     ·中原黄牛的形成与分化第99-100页
     ·牛亚科家畜不同种属间分化时间估计第100-101页
     ·微卫星和血液蛋白多态结果的差异第101-102页
     ·微卫星和血液蛋白多态对物种间遗传分化研究的有效性第102-110页
第三章 遗传距离对利用微卫星资料进行系统树构建和遗传分化估计的影响第110-127页
   ·材料与方法第111-113页
     ·各种遗传距离的度量第111-112页
     ·数据第112页
     ·聚类方法与系统树构建及其评价第112页
     ·(σμ)~2遗传距离和D_(TL)距离对分化时间的比较第112-113页
   ·结果第113-117页
     ·不同遗传距离、聚类方法及杂合度水平系统发生树的自举检验值第113-114页
     ·不同遗传距离、聚类方法及杂合度水平系统树的正确性第114-116页
     ·(σμ)~2遗传距离和D_(TL)距离对分化时间的比较第116-117页
   ·讨论第117-127页
     ·影响系统树构建和遗传分化估计准确性的因素第117-118页
     ·不同遗传距离的比较第118页
     ·聚类方法比较第118-119页
     ·(σμ)~2遗传距离和D_(TL)遗传距离与分化时间第119页
     ·微卫星的局限性第119-127页
第四章 基于贝叶斯概率论的相关软件在动物遗传多样性研究中的应用第127-135页
   ·材料与方法第127-128页
     ·数据第127页
     ·方法第127-128页
   ·结果第128-133页
     ·GENECLASS第128页
     ·STRUCTURE第128-131页
     ·BAPS第131-133页
   ·讨论第133-135页
     ·不同软件运算结果比较第133页
     ·分群数第133页
     ·运算时间第133-134页
     ·对资料的要求及其影响结果准确性的因素第134页
     ·STRUCTURE和BAPS运算结果与聚类分析的比较第134-135页
第五章 Weitzman遗传多样性及其在中国黄牛品种保护中的应用第135-154页
   ·本文所涉及的相关理论及公式第136-139页
     ·Weitzman遗传多样性的基本理论第136页
     ·三种不同的保种经费分配方式第136-139页
   ·材料与方法第139-140页
     ·品种与遗传距离测定第139页
     ·品种的灭绝概率第139-140页
     ·边际多样性分析指标的计算第140页
     ·保种经费分配优化过程基本参数的设置第140页
   ·结果第140-148页
     ·品种的灭绝概率第140-142页
     ·最大似然树第142页
     ·现实和将来的期望多样性第142页
     ·品种贡献率、边际多样性及保护潜力第142-144页
     ·不同模型下保种经费分配比例第144页
     ·不同保种经费分配方式投资回报率第144-148页
   ·讨论第148-154页
     ·品种灭绝概率的估计第148页
     ·最大似然树的构建第148-149页
     ·品种保护的标准第149-150页
     ·不同保种模型效果第150页
     ·品种保护的目标第150-151页
     ·Weitzman遗传多样性理论对目前我国家畜禽品种保存的指导作用第151-154页
全文结论第154-155页
参考文献第155-171页
致谢第171-174页
攻读博士期间发表论文目录第174-175页

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