| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-8页 |
| 1 引言 | 第8-20页 |
| ·遗传多样性 | 第8-11页 |
| ·遗传多样性的内涵及其研究层次 | 第8-10页 |
| ·遗传多样性研究的理论和实践意义 | 第10-11页 |
| ·分子生物学研究方法 | 第11-12页 |
| ·线粒体基因分子系统学研究进展 | 第12-16页 |
| ·动物线粒体基因组的结构及基因成分 | 第13-14页 |
| ·分子系统学概况 | 第14页 |
| ·动物线粒体DNA的遗传系统及其研究方向 | 第14-16页 |
| ·大仓鼠，黑线仓鼠，黑线姬鼠，社鼠的研究现状 | 第16-19页 |
| ·大仓鼠的研究现状 | 第16页 |
| ·黑线仓鼠的研究现状 | 第16-17页 |
| ·黑线姬鼠的研究现状 | 第17-18页 |
| ·社鼠的研究现状 | 第18-19页 |
| ·研究目标 | 第19-20页 |
| 2 材料和方法 | 第20-30页 |
| ·试验材料 | 第20-23页 |
| ·样品采集和样本量 | 第20页 |
| ·药品和酶 | 第20-21页 |
| ·主要实验仪器 | 第21页 |
| ·菌株和质粒 | 第21-22页 |
| ·分析工具软件及网址 | 第22页 |
| ·溶液的配制 | 第22-23页 |
| ·研究方法 | 第23-30页 |
| ·基因组DNA及线粒体DNA的提取与检测 | 第23-24页 |
| ·基因组DNA的提取及质量检测 | 第23-24页 |
| ·线粒体DNA的提取 | 第24页 |
| ·线粒体控制区的克隆 | 第24-25页 |
| ·线粒体控制区的扩增反应体系 | 第24-25页 |
| ·PCR引物溶液的配制 | 第25页 |
| ·PCR反应条件的确定 | 第25页 |
| ·PCR产物鉴定 | 第25页 |
| ·PCR扩增片段的克隆测序 | 第25-30页 |
| ·目的片段的回收 | 第25-26页 |
| ·载体的制备 | 第26页 |
| ·连接反应 | 第26-27页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第27页 |
| ·转化 | 第27-28页 |
| ·质粒DNA的提取 | 第28-29页 |
| ·重组质粒的鉴定 | 第29页 |
| ·阳性克隆的测序 | 第29-30页 |
| 3 结果与分析 | 第30-49页 |
| ·基因组DNA的提取与鉴定 | 第30-31页 |
| ·线粒体控制区扩增结果 | 第31-34页 |
| ·大仓鼠线粒体控制区扩增结果 | 第31-32页 |
| ·黑线仓鼠线粒体控制区扩增结果 | 第32页 |
| ·黑线姬鼠线粒体控制区扩增结果 | 第32-33页 |
| ·社鼠线粒体控制区扩增结果 | 第33-34页 |
| ·目的片段的克隆和测序 | 第34-49页 |
| ·阳性克隆的鉴定 | 第34-35页 |
| ·测序结果 | 第35-43页 |
| ·大仓鼠控制区序列 | 第35-38页 |
| ·黑线仓鼠线粒体控制区序列 | 第38-40页 |
| ·黑线姬鼠线粒体控制区序列 | 第40-41页 |
| ·社鼠线粒体控制区序列 | 第41-43页 |
| ·序列同源性比较 | 第43-48页 |
| ·遗传距离 | 第48-49页 |
| 4 讨论 | 第49-54页 |
| ·研究方法的讨论 | 第49-51页 |
| ·线粒体DNA提取条件的优化 | 第49页 |
| ·材料的选择 | 第49页 |
| ·差速离心中离心力和离心时间的确定 | 第49页 |
| ·变性和复性的时间和条件选择 | 第49页 |
| ·抽提线粒体DNA的试剂选择 | 第49页 |
| ·提取线粒体DNA的温度 | 第49页 |
| ·PCR反应条件的优化 | 第49-51页 |
| ·引物 | 第49页 |
| ·模板 | 第49-50页 |
| ·退火温度 | 第50页 |
| ·Mg~(2+)、dNTP和引物浓度 | 第50-51页 |
| ·大仓鼠，黑线仓鼠，黑线姬鼠，社鼠亲缘关系及遗传多样性 | 第51-54页 |
| ·不同地理种群的遗传多态性 | 第51-52页 |
| ·大仓鼠地理种群的遗传多态性 | 第51页 |
| ·黑线仓鼠地理种群的遗传多态性 | 第51-52页 |
| ·黑线姬鼠地理种群的遗传多态性 | 第52页 |
| ·社鼠地理种群的遗传多态性 | 第52页 |
| ·大仓鼠，黑线仓鼠，黑线姬鼠，社鼠的系统进化分析 | 第52-54页 |
| 附录 | 第54-64页 |
| 参考文献 | 第64-74页 |
| 在读期间发表和完成的论文 | 第74-75页 |
| 致谢 | 第75页 |