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纤维发育相关基因的SNP研究与棉花蔗糖合酶基因片段的克隆及表达分析

中文摘要第1-8页
英文摘要第8-9页
本文所用主要缩写词第9-10页
第一部分 文献综述第10-35页
 1 棉纤维细胞的分化与发育第11-13页
  1.1 纤维细胞的分化、突起第11-12页
  1.2 纤维细胞的伸长或初生壁合成第12页
  1.3 次生壁的合成第12-13页
  1.4 脱水成熟第13页
 2 纤维发育相关基因的研究进展第13-22页
  2.1 纤维分化相关基因第13-15页
  2.2 纤维伸长相关基因第15-19页
   2.2.1 与液泡膨压有关的基因表达第15-16页
   2.2.2 与细胞质骨架有关的基因表达第16-17页
   2.2.3 与细胞壁有关的基因表达第17-19页
  2.3 纤维初生伸长与次生加厚重叠期的基因表达第19页
  2.4 纤维细胞次生壁合成相关基因第19-22页
  2.5 纤维成熟相关基因第22页
 3 植物SNP研究进展第22-29页
  3.1 SNP的定义及特点第23页
  3.2 SNP的发现方法第23-25页
   3.2.1 PCR产物直接测序法第23-24页
   3.2.2 电子SNP(eSNP)法第24-25页
  3.3 SNP的基因分型技术第25-26页
   3.3.1 非序列特异性的SNP检测第25页
   3.3.2 序列特异性的SNP检测第25-26页
  3.4 SNP的应用第26-29页
   3.4.1 遗传图谱的构建第27页
   3.4.2 性状作图与基因定位第27-28页
   3.4.3 植物多样性与系统进化研究第28-29页
 4 四倍体棉种的起源与进化第29-35页
  4.1 棉属的分类第29-30页
  4.2 四倍体棉种的起源第30-31页
  4.3 四倍体棉种的分子进化研究第31-35页
   4.3.1 利用分子标记技术研究四倍体棉种的进化第31-32页
   4.3.2 利用基因组重复序列研究四倍体棉种的进化第32-33页
   4.3.3 利用核基因序列研究四倍体棉种的进化第33-35页
第二部分 研究报告第35-66页
 一、纤维发育相关基因的SNP研究第35-52页
  1 材料与方法第35-39页
   1.1 材料第35-36页
   1.2 方法第36-39页
    1.2.1 DNA提取方法第36页
    1.2.2 引物设计第36-38页
    1.2.3 PCR扩增第38页
    1.2.4 PCR产物回收、亚克隆及测序第38-39页
    1.2.5 序列分析第39页
  2 结果与分析第39-50页
   2.1 纤维发育相关基因引物在棉花基因组中的扩增结果第39-41页
   2.2 序列聚类分析结果及序列变异分析第41-48页
    2.2.1 能够区分四倍体扩增产物A、D基因组归属的基因第41-46页
    2.2.2 不能够区分四倍体扩增产物A、D基因组归属的基因第46-48页
   2.3 陆地棉高强纤维品系间的SNPs第48-50页
  3 讨论第50-52页
   3.1 四倍体棉种的基因进化第50-51页
   3.2 SNPs用于性状作图与基因定位第51-52页
 二、棉花蔗糖合酶基因片段的克隆与表达分析第52-66页
  1 材料与方法第52-56页
   1.1 材料第52-53页
    1.1.1 试验材料第52-53页
    1.1.2 试剂与器皿第53页
   1.2 方法第53-56页
    1.2.1 DNA的提取第53页
    1.2.2 TAIL-PCR反应体系与程序第53-54页
    1.2.3 片段回收、亚克隆与测序第54-55页
    1.2.4 总RNA的提取及DNase Ⅰ消化第55页
    1.2.5 mRNA逆转录反应第55页
    1.2.6 RT-PCR第55页
    1.2.7 序列分析第55-56页
  2 结果与分析第56-63页
   2.1 利用TAIL-PCR进行基因组步移结果第56-58页
   2.2 拼接片段的序列分析结果第58-62页
   2.3 GhSUSA1的RT-PCR分析第62-63页
  3 讨论第63-66页
   3.1 TAIL-PCR在棉花基因组中步移的效率问题第63-64页
   3.2 GhSUSA1序列不完整的原因探讨第64页
   3.3 GhSUSA1在纤维发育过程中的可能作用第64-66页
全文结论第66-109页

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