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一种高通量的全基因组甲基化CpG岛富集方法的建立--MBD2b蛋白柱层析法

中文摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
中英文缩略词表第11-13页
第一章 前言第13-27页
   ·DNA 甲基化第13-19页
     ·DNA 甲基化的形式第13-14页
     ·DNA 甲基化与基因表达第14-15页
     ·DNA 甲基化与肿瘤第15-16页
     ·DNA 甲基化的研究方法第16-19页
   ·甲基化结合蛋白第19-21页
   ·用于甲基化检测的基因芯片技术第21-27页
     ·基因芯片的概念第21-22页
     ·基因芯片的种类第22页
     ·基因芯片的制备第22-24页
     ·基因芯片的应用第24页
     ·微阵列技术在甲基化DNA 中的应用第24-27页
第二章 MBD2b 蛋白的表达及纯化第27-44页
   ·材料和方法第28-39页
     ·实验材料,试剂及仪器第28-32页
     ·实验方法第32-39页
   ·结果第39-42页
     ·RNA 样本的纯度、浓度、完整性鉴定第39页
     ·MBD2b 基因的获得第39-40页
     ·pGEX-5X-1 质粒的制备第40-41页
     ·质粒酶切鉴定第41页
     ·菌落PCR 鉴定第41-42页
     ·基因克隆的鉴定第42页
     ·GST-MBD2b 融合蛋白表达纯化第42页
   ·讨论第42-44页
第三章:甲基化CPG 岛富集方法的建立第44-60页
   ·材料与方法第44-51页
     ·材料第44-45页
     ·实验方法第45-51页
   ·结果第51-58页
     ·基因组DNA 抽提第51-53页
     ·基因组DNA 超声破碎第53页
     ·GST-MBD2b 蛋白的甲基化 DNA 结合活性的验证第53-54页
     ·甲基化富集条件的优化第54-55页
     ·甲基化富集的影响因素第55-57页
     ·加linker 后扩增情况第57-58页
   ·讨论第58-60页
第四章:甲基化CPG 岛富集效率的评估第60-84页
   ·材料和方法第60-69页
     ·材料第60-61页
     ·方法第61-69页
   ·结果第69-82页
     ·Real Time PCR 检测第69-71页
     ·基因芯片检测第71-82页
   ·讨论第82-84页
第五章 结论第84-85页
参考文献第85-92页
致谢第92-93页
 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文第93-95页

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