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结核分枝杆菌旋转酶B亚基与DNA相互作用研究

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
1 前言第11-25页
   ·结核病与耐多药结核病的发病现状第11-13页
   ·DNA旋转酶的研究进展第13-18页
     ·DNA旋转酶的生物学意义及在拓扑异构酶分类中的地位第13-14页
     ·旋转酶的酶学模型与作用机制第14-16页
     ·旋转酶gyrB基因可以作为细菌分类和近缘种鉴定的依据第16页
     ·旋转酶作为抗生素的靶标及其耐药性第16-17页
     ·问题与展望第17-18页
   ·蛋白质与DNA相互作用的研究进展第18-25页
     ·体外研究方法第18-23页
       ·生物信息学的方法第18-19页
       ·凝胶阻滞技术(EMSA)第19-20页
       ·表面等离子共振(SPR)第20-21页
       ·荧光共振能量转移(FRET)第21-22页
       ·DNAse I足迹法(DNAse I Footprinting)第22-23页
       ·电镜观察复合物(Complex under EM)第23页
       ·紫外交联法(Cross Linking)第23页
     ·体内研究方法第23-25页
       ·酵母单杂交体系(Yeast-one-hybrid system)第23-24页
       ·免疫共沉淀(ChIP)第24-25页
2 研究目的与意义第25-26页
3 材料与方法第26-39页
   ·材料第26-30页
     ·培养基第26页
     ·质粒和菌株第26-28页
     ·单双链DNA第28-29页
     ·分子生物学试剂和常用试剂第29页
     ·实验仪器第29-30页
   ·方法第30-39页
     ·结核分枝杆菌旋转酶B亚基缺失突变体的构建第30-35页
       ·结核分枝杆菌旋转酶B亚基突变体基因片段的PCR扩增第30-32页
       ·PCR产物/酶切产物的回收和纯化第32-33页
       ·质粒的提取第33-34页
       ·大肠杆菌BL21感受态细胞的制备(氯化钙法)第34页
       ·目的片段与载体的连接第34页
       ·连接产物的转化第34-35页
       ·重组子的筛选和验证第35页
     ·结核分枝杆菌旋转酶B亚基缺失突变体蛋白的表达与纯化第35-37页
       ·蛋白的小量诱导表达第35页
       ·蛋白的大量表达与纯化第35-37页
     ·蛋白纯化缓冲液及SDS-PAGE电泳缓冲液第37页
     ·SDS-PAGE分析蛋白纯度及分子量第37-38页
     ·蛋白质浓度的测定第38页
     ·分析结核分枝杆菌旋转酶B亚基缺失突变体蛋白与DNA相互作用的EMSA 试验第38-39页
4 结果与分析第39-56页
   ·结核分枝杆菌旋转酶B亚基缺失突变体的构建第39-42页
     ·缺失突变体pET28a-gyrB_(278-714)和pET28a-gyrB_(1-631)表达载体的单双酶切验证第39-40页
     ·缺失突变体pET28a-gyrB_(463-714)表达载体的单双酶切验证第40-41页
     ·缺失突变体pET28a-gyrB_(1-542),pET28a-gyrB_(1-519),pET28a-gyrB_(1-500)和pET28a-gyrB_(1-482)单双酶切验证第41-42页
     ·缺失突变体pET28a-gyrB_(1-270),pET28a-gyrB_(271-480)和pET28a-gyrB_(485-714)的双酶切验证第42页
   ·结核分枝杆菌旋转酶B亚基缺失突变体亚蛋白的表达与纯化第42-48页
     ·GyrA亚基全长蛋白的表达和纯化第43页
     ·GyrB亚基全长蛋白的表达和纯化第43-44页
     ·GyrB_(278-714)亚蛋白的表达与纯化第44页
     ·GyrB_(1-631)亚蛋白的表达和纯化第44-45页
     ·GyrB_(1-462)亚蛋白的表达和纯化第45页
     ·GyrB_(463-714)亚蛋白的表达和纯化第45-46页
     ·GyrB_(1-482)亚蛋白的表达和纯化第46页
     ·GyrB_(ΔToprim)亚蛋白的表达和纯化第46-47页
     ·GyrB_(1-564)亚蛋白的表达和纯化第47页
     ·GyEB_(1-542),GyrB_(1-519),GyrB_(1_500)和GyrB_(1-482)亚蛋白的表达第47-48页
   ·结核分枝杆菌旋转酶B亚基缺失突变体与DNA相互作用的EMSA试验第48-56页
     ·结核分枝杆菌旋转酶B亚基缺失突变体与单链DNA的相互作用第48-51页
       ·B亚基全长与单链DNA的结合特性第48页
       ·GyrB_(1-462)与单链DNA的结合特性第48-49页
       ·GyrB_(1-482)与单链DNA的结合特性第49-50页
       ·GyrB_(463-714)与单链DNA的结合特性第50页
       ·GyrB_(278-714)与单链DNA的结合特性第50-51页
       ·GyrB_(1-631)与单链DNA的结合特性第51页
     ·结核分枝杆菌旋转酶B亚基缺失突变体与双链DNA的相互作用第51-56页
       ·B亚基全长与双链DNA的结合特性第51-52页
       ·GyrB_(1-462)与双链DNA的结合特性第52-53页
       ·GyrB_(1-482)与双链DNA的结合特性第53页
       ·GyrB_(278-714)与双链DNA的结合特性第53-54页
       ·GyrB_(1-631)与双链DNA的结合特性第54页
       ·GyrB_(1-564)与双链DNA的结合特性第54-55页
       ·GyrB_(463-714)与双链DNA的结合特性第55-56页
       ·GyrB_(Δ-Toprim)与双链DNA的结合特性第56页
5 讨论第56-58页
参考文献第58-63页
致谢第63-64页
附录第64-65页

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