| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 中英文缩略语 | 第15-16页 |
| 第一章 绪论 | 第16-30页 |
| 1.1 棉花黄萎病及其病原菌 | 第16-17页 |
| 1.2 大丽轮枝菌的侵染循环 | 第17-18页 |
| 1.3 黄萎病的发生与大田防治 | 第18-20页 |
| 1.4 大丽轮枝菌致病相关基因的挖掘 | 第20-22页 |
| 1.5 大丽轮枝菌的潜在致病因子 | 第22-25页 |
| 1.5.1 真菌疏水蛋白 | 第23页 |
| 1.5.2 碳水化合物活性酶 | 第23-25页 |
| 1.6 挖掘致病相关基因的研究方法 | 第25-28页 |
| 1.6.1 转录组测序(RNA-seq)技术 | 第25-27页 |
| 1.6.2 基因敲除技术 | 第27-28页 |
| 1.7 本研究的目的与意义 | 第28-30页 |
| 第二章 大丽轮枝菌侵染陆地棉早期的转录组分析 | 第30-46页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30-34页 |
| 2.1.1 材料与处理 | 第30页 |
| 2.1.2 RNA提取 | 第30-31页 |
| 2.1.3 转录组测序文库构建 | 第31页 |
| 2.1.4 样本间差异基因表达分析 | 第31页 |
| 2.1.5 基因注释与分类 | 第31-32页 |
| 2.1.6 富集分析 | 第32页 |
| 2.1.7 qRT-PCR分析 | 第32-34页 |
| 2.2 结果与分析 | 第34-39页 |
| 2.2.1 差异基因的表达分析和GO注释 | 第34页 |
| 2.2.2 潜在致病因子的表达分析 | 第34-37页 |
| 2.2.3 上调DEGs的 GO富集分析 | 第37页 |
| 2.2.4 上调DEGs的 KEGG通路分析 | 第37-38页 |
| 2.2.5 转录组测序数据的qRT-PCR验证 | 第38-39页 |
| 2.3 讨论 | 第39-41页 |
| 2.4 候选基因的选择及其基本特性分析 | 第41-45页 |
| 2.5 本章小结 | 第45-46页 |
| 第三章 Vdpl1和Vdcdpk1 基因缺失突变体的构建 | 第46-56页 |
| 3.1 材料与方法 | 第46-51页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第46页 |
| 3.1.2 大丽轮枝菌基因组DNA提取 | 第46-47页 |
| 3.1.3 目的片段的扩增 | 第47页 |
| 3.1.4 目的片段的回收 | 第47-48页 |
| 3.1.5 骨架载体线性化处理 | 第48-49页 |
| 3.1.6 重组反应 | 第49页 |
| 3.1.7 大肠杆菌转化 | 第49页 |
| 3.1.8 质粒提取 | 第49-50页 |
| 3.1.9 农杆菌感受态细胞的制备(CaCl2法) | 第50页 |
| 3.1.10 重组质粒导入农杆菌(冻融法) | 第50页 |
| 3.1.11 农杆菌介导的大丽轮枝菌转化 | 第50-51页 |
| 3.1.12 单孢分离 | 第51页 |
| 3.1.13 孢子计数 | 第51页 |
| 3.2 结果 | 第51-54页 |
| 3.2.1 利用无缝克隆技术构建基因敲除质粒 | 第51页 |
| 3.2.2 利用诱导培养基促进孢子的产生 | 第51-52页 |
| 3.2.3 基因敲除子的筛选与鉴定 | 第52-54页 |
| 3.3 讨论 | 第54-55页 |
| 3.4 本章小结 | 第55-56页 |
| 第四章 突变体Vd⊿pl1和Vd⊿cdpk1 的表型分析 | 第56-62页 |
| 4.1 材料与方法 | 第56-57页 |
| 4.1.1 材料 | 第56页 |
| 4.1.2 棉花幼苗的培养及孢子收集 | 第56页 |
| 4.1.3 致病力分析 | 第56页 |
| 4.1.4 生长表型分析 | 第56-57页 |
| 4.1.5 数据分析 | 第57页 |
| 4.2 结果 | 第57-60页 |
| 4.2.1 突变体的致病力分析 | 第57页 |
| 4.2.2 突变体在不同碳源培养基上的生长表型分析 | 第57-59页 |
| 4.2.3 突变体菌丝穿透能力的分析 | 第59-60页 |
| 4.3 讨论 | 第60-61页 |
| 4.4 本章小结 | 第61-62页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第62-64页 |
| 5.1 主要结论 | 第62-63页 |
| 5.2 论文创新点 | 第63页 |
| 5.3 展望 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-69页 |
| 附录1 .GO富集分析结果 | 第69-76页 |
| 附录2 .KEGG富集结果 | 第76-78页 |
| 附录3 .本研究使用的培养基及试剂 | 第78-79页 |
| 附录4 .基因序列 | 第79-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第81-83页 |
