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酿酒酵母辅酶A生物合成蛋白Cab2(磷酸泛酰半胱氨酸合成酶)结构生物学研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 综述第12-24页
    1.1 辅酶A简介第12-15页
    1.2 辅酶A的传统生物合成途径第15-18页
    1.3 酿酒酵母中的辅酶A生物合成途径第18-20页
    1.4 磷酸泛酰半胱氨酸合成酶(PPCS)研究进展第20-24页
第2章 蛋白的表达与纯化第24-36页
    2.1 实验试剂第24-25页
    2.2 酿酒酵母Cab2的基因第25-26页
    2.3 酿酒酵母CAB2基因的获取第26-27页
    2.4 Cab2-p28a重组质粒的构建第27-28页
    2.5 Cab2-p28a重组质粒的鉴定第28-29页
    2.6 Cab2突变体质粒的构建第29-30页
    2.7 相关蛋白的质粒构建第30-31页
    2.8 重组蛋白的表达第31页
    2.9 表达过程的优化第31页
    2.10 重组蛋白的纯化第31-34页
    2.11 重组蛋白的进一步处理与保存第34-36页
第3章 Cab2及其突变体与底物产物复合物晶体结构解析第36-92页
    3.1 结晶试剂第36页
    3.2 晶体生长条件的初筛与优化第36-40页
    3.3 衍射数据的收集第40-43页
    3.4 衍射数据处理第43-48页
    3.5 Cab2相关晶体结构的解析与模型修正第48-52页
    3.6 晶体结构模型质量检验分析第52-64页
    3.7 晶体结构模型中缺失部分的鉴定第64-67页
    3.8 Cab2与Cab2_(H337A)晶体结构比较分析第67-73页
    3.9 Cab2整体结构及保守性分析第73-78页
    3.10 酿酒酵母Cab2中PPA、PMT及PPC的结合位点第78-81页
    3.11 Cab2与其它结构已解析PPCS的结构比对第81-88页
    3.12 Cab2与不同配体复合物结构中活性口袋残基及配体的构象变化第88-92页
第4章 Cab2蛋白相关生化功能研究第92-102页
    4.1 底物PPA及CTP/ATP与Cab2的亲和力测定第92-94页
    4.2 底物PPA与Cab2各突变体的亲和力测定第94-95页
    4.3 Cab2对金属离子选择性第95-97页
    4.4 Cab2对ATP/CTP选择性第97-98页
    4.5 Cab2对半胱氨酸/胱氨酸/丝氨酸选择性第98-99页
    4.6 突变体酶活性测定第99-102页
第5章 酿酒酵母Cab2催化机制第102-110页
    5.1 推测Cab2中CTP/ATP可能的结合位点第102-104页
    5.2 Lys226残基的ε-氨基可能发挥质子供体的作用第104-105页
    5.3 Cab2可能的催化机制第105-110页
第6章 酿酒酵母辅酶A合成途径中其它酶的研究第110-114页
    6.1 大肠杆菌表达体系中重组蛋白的表达第110-111页
    6.2 毕赤酵母表达体系中重组蛋白的表达第111页
    6.3 GST-pulldown实验第111-114页
小结第114-116页
参考文献第116-124页
附录第124-173页
致谢第173-174页
在读期间发表的学术论文及参加的学术会议第174页

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