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基于加权网络的精神分裂症基因脑区共表达研究

摘要第5-6页
Abstract第6页
第1章 绪论第12-17页
    1.1 研究背景及意义第12-13页
    1.2 国内外研究现状第13-16页
    1.3 研究内容第16页
    1.4 论文结构安排第16-17页
第2章 相关理论知识第17-29页
    2.1 生物方面的基础知识第17-20页
        2.1.1 基因基础知识的介绍第17-19页
        2.1.2 人脑结构的基本介绍第19-20页
    2.2 聚类第20-22页
        2.2.1 有监督和无监督第20页
        2.2.2 距离与相似系数第20-21页
        2.2.3 聚类算法的类型第21-22页
    2.3 基因网络模型第22-27页
        2.3.1 线性回归构建网络第23页
        2.3.2 互信息方法构建网络第23-25页
        2.3.3 贝叶斯方法构建网络第25-26页
        2.3.4 成对统计关联方法构建网络第26页
        2.3.5 加权矩阵模型第26-27页
    2.4 脑部结构的模型第27-28页
        2.4.1 大脑坐标的建立第27-28页
        2.4.2 大脑分区的建立第28页
    2.5 小结第28-29页
第3章 一种权重网络研究脑区基因共表达的方法第29-45页
    3.1 引言第29页
    3.2 权重基因网络的原理以及构建第29-34页
        3.2.1 特征基因以及样本的选择第29-30页
        3.2.2 构建基因共表达模块第30-33页
        3.2.3 脑区在基因模块上的映射第33-34页
    3.3 实验的结果与分析第34-38页
        3.3.1 构建网络模块第35-36页
        3.3.2 模块到脑区的映射第36-38页
    3.4 显著脑区共表达基因的分析第38-43页
        3.4.1 海马(Hippoc ampus)第38-39页
        3.4.2 下丘脑和基底核(thalamus and BasalGanglia)第39-41页
        3.4.3 颞叶(temporal lobe)第41-43页
        3.4.4 讨论第43页
    3.5 小结第43-45页
第4章 各脑区间基因的差异性表达和共表达分析第45-56页
    4.1 引言第46页
    4.2 脑区基因差异性表达第46-48页
    4.3 脑区基因的共表达第48-49页
    4.4 实验结果与分析第49-55页
        4.4.1 基因数据的归一化和样本的聚类第49-50页
        4.4.2 各脑区之间的基因表达研究第50-54页
        4.4.3 模块内部的基因表达研究第54-55页
    4.5 小结第55-56页
结论第56-59页
参考文献第59-62页
致谢第62-63页
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文第63-64页
附录B 攻读硕士学位期间所参与的科研活动第64页

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