| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第12-17页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第13-16页 |
| 1.3 研究内容 | 第16页 |
| 1.4 论文结构安排 | 第16-17页 |
| 第2章 相关理论知识 | 第17-29页 |
| 2.1 生物方面的基础知识 | 第17-20页 |
| 2.1.1 基因基础知识的介绍 | 第17-19页 |
| 2.1.2 人脑结构的基本介绍 | 第19-20页 |
| 2.2 聚类 | 第20-22页 |
| 2.2.1 有监督和无监督 | 第20页 |
| 2.2.2 距离与相似系数 | 第20-21页 |
| 2.2.3 聚类算法的类型 | 第21-22页 |
| 2.3 基因网络模型 | 第22-27页 |
| 2.3.1 线性回归构建网络 | 第23页 |
| 2.3.2 互信息方法构建网络 | 第23-25页 |
| 2.3.3 贝叶斯方法构建网络 | 第25-26页 |
| 2.3.4 成对统计关联方法构建网络 | 第26页 |
| 2.3.5 加权矩阵模型 | 第26-27页 |
| 2.4 脑部结构的模型 | 第27-28页 |
| 2.4.1 大脑坐标的建立 | 第27-28页 |
| 2.4.2 大脑分区的建立 | 第28页 |
| 2.5 小结 | 第28-29页 |
| 第3章 一种权重网络研究脑区基因共表达的方法 | 第29-45页 |
| 3.1 引言 | 第29页 |
| 3.2 权重基因网络的原理以及构建 | 第29-34页 |
| 3.2.1 特征基因以及样本的选择 | 第29-30页 |
| 3.2.2 构建基因共表达模块 | 第30-33页 |
| 3.2.3 脑区在基因模块上的映射 | 第33-34页 |
| 3.3 实验的结果与分析 | 第34-38页 |
| 3.3.1 构建网络模块 | 第35-36页 |
| 3.3.2 模块到脑区的映射 | 第36-38页 |
| 3.4 显著脑区共表达基因的分析 | 第38-43页 |
| 3.4.1 海马(Hippoc ampus) | 第38-39页 |
| 3.4.2 下丘脑和基底核(thalamus and BasalGanglia) | 第39-41页 |
| 3.4.3 颞叶(temporal lobe) | 第41-43页 |
| 3.4.4 讨论 | 第43页 |
| 3.5 小结 | 第43-45页 |
| 第4章 各脑区间基因的差异性表达和共表达分析 | 第45-56页 |
| 4.1 引言 | 第46页 |
| 4.2 脑区基因差异性表达 | 第46-48页 |
| 4.3 脑区基因的共表达 | 第48-49页 |
| 4.4 实验结果与分析 | 第49-55页 |
| 4.4.1 基因数据的归一化和样本的聚类 | 第49-50页 |
| 4.4.2 各脑区之间的基因表达研究 | 第50-54页 |
| 4.4.3 模块内部的基因表达研究 | 第54-55页 |
| 4.5 小结 | 第55-56页 |
| 结论 | 第56-59页 |
| 参考文献 | 第59-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 附录A 攻读学位期间所发表的学术论文 | 第63-64页 |
| 附录B 攻读硕士学位期间所参与的科研活动 | 第64页 |