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基于核酸短暂杂交和Lambda核酸外切酶的单碱基突变检测方法的研究

学位论文数据集第3-4页
摘要第4-6页
ABSTRACT第6-7页
第一章 绪论第17-23页
    1.1 引言第17页
    1.2 基因突变检测技术第17-18页
    1.3 单核苷酸突变第18-19页
    1.4 核酸短暂杂交第19-20页
    1.5 核酸外切酶第20-21页
    1.6 单分子荧光技术第21-22页
    1.7 课题研究内容以及选题意义第22-23页
        1.7.1 主要研究内容第22页
        1.7.2 研究成果及创新点第22-23页
第二章 Lambda核酸外切酶与短暂杂交体系的优化探究第23-45页
    2.1 实验材料及仪器第23-25页
        2.1.1 试剂与材料第23-24页
        2.1.2 实验所用仪器第24页
        2.1.3 实验DNA序列第24-25页
    2.2 实验方法第25-29页
        2.2.1 碱基突变位点的筛选第25页
        2.2.2 短暂杂交长度的筛选第25-26页
        2.2.3 盐离子条件的优化第26页
        2.2.4 位点突变类型的探究第26页
        2.2.5 优化后的碱基突变位点测定第26-27页
        2.2.6 优化后短暂杂交长度结果测定第27页
        2.2.7 核酸短暂杂交与核酸稳定杂交的探究第27-28页
        2.2.8 低丰度突变检测第28页
        2.2.9 全部突变类型的高选择性检测第28-29页
        2.2.10 温度对短暂杂交反应体系的影响第29页
    2.3 实验结果与讨论第29-43页
        2.3.1 碱基突变位点的筛选结果第29-31页
        2.3.2 短暂杂交长度的筛选结果第31-32页
        2.3.3 盐离子优化的结果第32-33页
        2.3.4 位点突变类型的探究结果第33-34页
        2.3.5 离子条件优化后突变位点的结果第34页
        2.3.6 离子条件优化后短暂杂交长度的结果第34-35页
        2.3.7 短暂杂交与稳定杂交的比较第35-36页
        2.3.8 低丰度突变检测结果第36-37页
        2.3.9 全部突变类型区分度的结果第37-39页
        2.3.10 温度对于反应速率的探究第39-41页
        2.3.11 镁离子对于体系的影响第41-43页
    2.4 本章小结第43-45页
第三章 DNA短暂杂交的单分子测定和DNA-Lambda核酸外切酶的相互作用第45-59页
    3.1 实验材料及仪器第45-47页
        3.1.1 试剂与材料第45-46页
        3.1.2 实验所用仪器第46-47页
        3.1.3 实验DNA序列第47页
    3.2 实验步骤第47-51页
        3.2.1 目标型全内反射荧光显微镜(TIRFM)反应通道的建立第47-48页
        3.2.2 DNA短暂杂交的单分子检测步骤第48-49页
        3.2.3 Lambda核酸外切酶的标记第49页
        3.2.4 Lambda核酸外切酶的标记后的活性测试第49-50页
        3.2.5 Lambda核酸外切酶体系单分子检测步骤第50-51页
    3.3 实验结果与讨论第51-58页
        3.3.1 单分子表征动态底物的短暂杂交第51-53页
        3.3.2 DNA短暂杂交的单分子鉴定结果第53-56页
        3.3.3 Lambda核酸外切酶的标记结果第56页
        3.3.4 DNA短暂杂交的单分子鉴定和DNA-Lambda核酸外切酶相互作用第56-58页
    3.4 本章小结第58-59页
第四章 KRAS体系条件优化与单核苷酸突变检测第59-71页
    4.1 实验材料及仪器第59-61页
        4.1.1 试剂与材料第59-60页
        4.1.2 实验所用仪器第60页
        4.1.3 DNA序歹列第60-61页
    4.2 实验方法第61-66页
        4.2.1 KRAS体系短暂杂交长度的探究第61页
        4.2.2 KRAS体系离子浓度的探究第61-62页
        4.2.3 低丰度突变检测第62-63页
        4.2.4 细胞复苏第63页
        4.2.5 细胞换液第63页
        4.2.6 细胞传代第63页
        4.2.7 细胞冻存第63-64页
        4.2.8 A549及HEK-293T细胞基因组DNA的提取第64-65页
        4.2.9 细胞系提取的基因组DNA单核苷酸突变的检测第65-66页
    4.3 实验结果与讨论第66-70页
        4.3.1 KRAS体系离子条件优化的结果第66页
        4.3.2 KRAS体系短暂杂交长度的结果第66-67页
        4.3.3 A549细胞与HEK-293细胞培养结果第67-68页
        4.3.4 人肺癌细胞(A549)提取结果第68页
        4.3.5 人胚肾细胞(HEK-293)提取结果第68页
        4.3.6 细胞系提取的基因组DNA单核苷酸突变的检测第68-69页
        4.3.7 低丰度突变检测结果第69-70页
    4.4 本章小结第70-71页
第五章 结论与展望第71-73页
    5.1 结论第71页
    5.2 展望第71-73页
参考文献第73-81页
致谢第81-83页
研究成果及发表的学术论文第83-85页
作者与导师简介第85-86页
附件第86-87页

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