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HIV膜融合抑制剂的结构生物学研究

致谢第5-6页
摘要第6-8页
ABSTRACT第8-9页
第一章 绪论第18-44页
    1.1 本章引言第18-40页
        1.1.1 HIV的起源、传播途径与治疗方法第18-19页
        1.1.2 HIV的进化和分类第19-23页
        1.1.3 HIV的形态和生活周期第23-24页
        1.1.4 HIV基因组的特点第24-26页
        1.1.5 HIV的结合和进入第26-31页
            1.1.5.1 包膜糖蛋白第26-28页
            1.1.5.2 CD4的结合第28页
            1.1.5.3 共受体相互作用第28-29页
            1.1.5.4 gp41的结构、功能与膜融合第29-31页
        1.1.6 HIV的药物治疗与膜融合抑制剂第31-40页
            1.1.6.1 HIV治疗药物与研究进展第31-32页
            1.1.6.2 HIV膜融合抑制剂的抗病毒优势第32-34页
            1.1.6.3 N肽起源的HIV膜融合抑制剂第34-35页
            1.1.6.4 化学修饰的肽融合抑制剂第35-36页
            1.1.6.5 D-肽融合抑制剂第36页
            1.1.6.6 以融合肽为靶点的抑制剂第36-37页
            1.1.6.7 5螺旋(5-Helix)蛋白第37页
            1.1.6.8 C肽起源的HIV膜融合抑制剂的研发历程第37-40页
    1.2 HIV膜融合抑制剂的结构生物学研究第40-41页
    1.3 本论文选题意义、主要研究内容及结构第41-44页
第二章 材料与方法第44-58页
    2.1 本章引言第44页
    2.2 实验材料第44-53页
        2.2.1 多肽第44页
        2.2.2 仪器耗材第44-45页
        2.2.3 实验试剂第45页
            2.2.3.1 试剂来源第45页
            2.2.3.2 缓冲液的配制第45页
        2.2.4 实验原理第45-53页
            2.2.4.1 透析原理第45-46页
            2.2.4.2 分子筛凝胶层析纯化原理第46-47页
            2.2.4.3 蛋白质结晶原理第47-50页
            2.2.4.4 蛋白质晶体的优化原理及常用方法第50页
            2.2.4.5 蛋白质晶体X射线衍射原理第50-51页
            2.2.4.6 圆二色(CD)光谱第51-52页
            2.2.4.7 原位ESI-Q-TOF质谱实验原理第52-53页
    2.3 实验方法第53-58页
        2.3.1 6-HB复合物的制备第53-54页
        2.3.2 6-HB复合物的获得和鉴定第54页
        2.3.3 6-HB复合物的结晶第54页
        2.3.4 复合物晶体的捞取第54页
        2.3.5 衍射数据的收集、处理和结构解析第54-55页
        2.3.6 圆二色(CD)光谱第55-56页
        2.3.7 HIV膜融合抑制剂的膜融合抑制实验第56-57页
        2.3.8 抗病毒实验第57页
        2.3.9 原位ESI-Q-TOF质谱第57-58页
第三章 HIV膜融合抑制剂的结构解析第58-90页
    3.1 本章引言第58页
    3.2 实验流程设计第58页
    3.3 T20/N39多肽复合物的晶体结构解析第58-63页
        3.3.1 T20/N39多肽复合物的制备第58-60页
        3.3.2 T20/N39的晶体筛选、数据收集与结构解析第60-63页
    3.4 LP-40/N44多肽复合物的晶体结构解析第63-67页
        3.4.1 LP-40/N44多肽复合物的制备第63-64页
        3.4.2 LP-40/N44的晶体筛选、数据收集与结构解析第64-67页
    3.5 LP-46/N44多肽复合物的晶体结构解析第67-72页
        3.5.1 LP-46/N44多肽复合物的制备第67-68页
        3.5.2 LP-46/N44的晶体筛选、数据收集与结构解析第68-72页
    3.6 HP23L/N36多肽复合物的晶体结构解析第72-77页
        3.6.1 HP23L/N36多肽复合物的制备第72页
        3.6.2 HP23L/N36的晶体筛选、数据收集与结构解析第72-77页
    3.7 LP-11/N44多肽复合物的晶体结构解析第77-83页
        3.7.1 LP-11/N44多肽复合物的制备第77-78页
        3.7.2 LP-11/N44的晶体筛选、数据收集与结构解析第78-83页
    3.8 HP23L/N36KR多肽复合物的晶体结构解析第83-87页
        3.8.1 HP23L/N36KR多肽复合物的制备第83页
        3.8.2 HP23L/N36KR的晶体筛选、数据收集与结构解析第83-87页
    3.9 讨论第87-89页
    3.10 小结第89-90页
第四章 HIV膜融合抑制剂的结构分析第90-126页
    4.1 本章引言第90页
    4.2 第一代膜融合抑制剂T20及其衍生物LP-40的结构分析第90-103页
        4.2.1 T20/N39多肽复合物的晶体结构分析第90-94页
        4.2.2 T20介导的gp41上的主要耐药位点的分子结构基础第94-97页
        4.2.3 LP-40/N44多肽复合物的晶体结构分析第97-100页
        4.2.4 讨论第100-103页
    4.3 第二代膜融合抑制剂的衍生物LP-46的结构分析第103-109页
        4.3.1 LP-46/N44多肽复合物的晶体结构分析第104-106页
        4.3.2 讨论第106-109页
    4.4 短肽类膜融合抑制剂HP23L及其衍生物的晶体结构分析第109-122页
        4.4.1 HP23L/N36多肽复合物的晶体结构分析第109-115页
            4.4.1.1 HP23LN端谷氨酸构象的功能验证第113-115页
        4.4.2 LP-11/N44多肽复合物的晶体结构分析第115-118页
            4.4.2.1 HP23L与LP-11单体在溶液中的多聚状态研究第117-118页
        4.4.3 短肽抑制剂介导的gp41上的耐药位点的分子结构基础第118-120页
        4.4.4 讨论第120-122页
    4.10 小结第122-126页
第五章 结论第126-128页
参考文献第128-140页
附录A第140-142页
附录B第142-144页
附录C第144-146页
索引第146-148页
作者简历第148-152页
学位论文数据集第152页

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