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GC碱基对的质子转移机理

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第1章 绪论第13-27页
    1.1 DNA分子质子转移的研究意义和发展概况第13-25页
        1.1.1 DNA分子的结构和电化学性质第13-19页
        1.1.2 DNA分子质子转移的研究意义第19-20页
        1.1.3 DNA碱基对氢键间质子转移机理第20-23页
        1.1.4 影响DNA碱基对质子转移的环境因素第23-25页
    1.2 论文的研究目的与主要内容第25-27页
第2章 方法和理论基础第27-38页
    2.1 常用的量子化学计算方法第27-28页
    2.2 密度泛函理论基础第28-30页
    2.3 密度泛函近似第30-32页
        2.3.1 局域自旋密度近似第30-31页
        2.3.2 广义梯度近似第31-32页
        2.3.3 杂化密度泛函及常用方法第32页
    2.4 ONIOM方法第32-35页
    2.5 溶剂化模型第35-36页
    2.6 基组第36-38页
第3章 质子化碱基对氢键间单质子转移反应第38-62页
    3.1 引言第38-39页
    3.2 计算方法第39-40页
    3.3 十四种质子化碱基对中质子转移反应第40-53页
        3.3.1 结构和相对能第40-48页
        3.3.2 NBO电荷和氢键长第48-51页
        3.3.3 气相和溶剂中质子转移能量变化第51-53页
    3.4 三种单质子转移路径对比第53-60页
        3.4.1 结构变化第54-58页
        3.4.2 气相和溶剂中质子转移能量变化第58-60页
    3.5 小结第60-62页
第4章 氢化碱基对氢键间双质子转移反应第62-75页
    4.1 引言第62-63页
    4.2 计算方法第63页
    4.3 结果与讨论第63-73页
        4.3.1 相对能对比第63-65页
        4.3.2 结构变化第65-71页
        4.3.3 气相和溶液中质子转移能量变化第71-73页
    4.4 小结第73-75页
第5章 含GC碱基对的DNA三聚体中质子转移反应第75-101页
    5.1 引言第75-76页
    5.2 计算方法第76页
    5.3 含GC碱基对的DNA三聚体中质子转移反应第76-85页
        5.3.1 气相中质子转移反应第77-83页
        5.3.2 水溶剂中质子转移反应第83-85页
    5.4 氢化DNA三聚体中性、阴离子和阳离子中质子转移反应第85-99页
        5.4.1 含氢化GC碱基对的DNA三聚体中质子转移反应第86-90页
        5.4.2 含质子化GC碱基对的DNA三聚体中质子转移反应第90-94页
        5.4.3 含氢化GC碱基对阴离子的DNA三聚体中质子转移反应第94-99页
    5.5 小结第99-101页
第6章 结论与展望第101-105页
    6.1 主要结论第101-103页
    6.2 未来工作的展望第103-105页
致谢第105-107页
参考文献第107-122页
附录第122-125页
攻读博士学位期间发表的论文及研究成果第125-126页

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