摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
第1章 绪论 | 第13-27页 |
1.1 DNA分子质子转移的研究意义和发展概况 | 第13-25页 |
1.1.1 DNA分子的结构和电化学性质 | 第13-19页 |
1.1.2 DNA分子质子转移的研究意义 | 第19-20页 |
1.1.3 DNA碱基对氢键间质子转移机理 | 第20-23页 |
1.1.4 影响DNA碱基对质子转移的环境因素 | 第23-25页 |
1.2 论文的研究目的与主要内容 | 第25-27页 |
第2章 方法和理论基础 | 第27-38页 |
2.1 常用的量子化学计算方法 | 第27-28页 |
2.2 密度泛函理论基础 | 第28-30页 |
2.3 密度泛函近似 | 第30-32页 |
2.3.1 局域自旋密度近似 | 第30-31页 |
2.3.2 广义梯度近似 | 第31-32页 |
2.3.3 杂化密度泛函及常用方法 | 第32页 |
2.4 ONIOM方法 | 第32-35页 |
2.5 溶剂化模型 | 第35-36页 |
2.6 基组 | 第36-38页 |
第3章 质子化碱基对氢键间单质子转移反应 | 第38-62页 |
3.1 引言 | 第38-39页 |
3.2 计算方法 | 第39-40页 |
3.3 十四种质子化碱基对中质子转移反应 | 第40-53页 |
3.3.1 结构和相对能 | 第40-48页 |
3.3.2 NBO电荷和氢键长 | 第48-51页 |
3.3.3 气相和溶剂中质子转移能量变化 | 第51-53页 |
3.4 三种单质子转移路径对比 | 第53-60页 |
3.4.1 结构变化 | 第54-58页 |
3.4.2 气相和溶剂中质子转移能量变化 | 第58-60页 |
3.5 小结 | 第60-62页 |
第4章 氢化碱基对氢键间双质子转移反应 | 第62-75页 |
4.1 引言 | 第62-63页 |
4.2 计算方法 | 第63页 |
4.3 结果与讨论 | 第63-73页 |
4.3.1 相对能对比 | 第63-65页 |
4.3.2 结构变化 | 第65-71页 |
4.3.3 气相和溶液中质子转移能量变化 | 第71-73页 |
4.4 小结 | 第73-75页 |
第5章 含GC碱基对的DNA三聚体中质子转移反应 | 第75-101页 |
5.1 引言 | 第75-76页 |
5.2 计算方法 | 第76页 |
5.3 含GC碱基对的DNA三聚体中质子转移反应 | 第76-85页 |
5.3.1 气相中质子转移反应 | 第77-83页 |
5.3.2 水溶剂中质子转移反应 | 第83-85页 |
5.4 氢化DNA三聚体中性、阴离子和阳离子中质子转移反应 | 第85-99页 |
5.4.1 含氢化GC碱基对的DNA三聚体中质子转移反应 | 第86-90页 |
5.4.2 含质子化GC碱基对的DNA三聚体中质子转移反应 | 第90-94页 |
5.4.3 含氢化GC碱基对阴离子的DNA三聚体中质子转移反应 | 第94-99页 |
5.5 小结 | 第99-101页 |
第6章 结论与展望 | 第101-105页 |
6.1 主要结论 | 第101-103页 |
6.2 未来工作的展望 | 第103-105页 |
致谢 | 第105-107页 |
参考文献 | 第107-122页 |
附录 | 第122-125页 |
攻读博士学位期间发表的论文及研究成果 | 第125-126页 |