首页--农业科学论文--畜牧、动物医学、狩猎、蚕、蜂论文--家畜论文--猪论文

猪繁殖性状全基因组关联分析及拷贝数变异检测

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略词第13-14页
第一章 文献综述第14-29页
    1.1 猪繁殖性状第14-16页
    1.2 猪繁殖性状研究进展第16-19页
        1.2.1 猪繁殖性状QTL定位情况第16-18页
        1.2.2 猪繁殖性状候选基因研究进展第18-19页
    1.3 全基因组关联分析第19-23页
        1.3.1 GWAS试验设计及其统计分析第20页
        1.3.2 GWAS的群体分层问题第20-21页
        1.3.3 GWAS的多重比较检验第21-22页
        1.3.4 猪重要性状GWAS研究进展第22-23页
    1.4 拷贝数变异第23-28页
        1.4.1 CNV的形成机制第23-24页
        1.4.2 CNV的作用机制第24-25页
        1.4.3 CNV的检测方法第25-26页
        1.4.4 CNV在畜禽上的研究进展第26-28页
    1.5 本研究的目的意义第28-29页
第二章 母猪繁殖性状遗传参数分析第29-36页
    2.1 试验材料与方法第29-31页
        2.1.1 数据来源第29页
        2.1.2 数据统计与分析第29-30页
        2.1.3 统计模型第30-31页
    2.2 结果与分析第31-34页
        2.2.1 表型基本统计量第31页
        2.2.2 影响繁殖性状的效应分析第31-32页
        2.2.3 遗传参数估计结果第32-34页
    2.3 讨论第34-35页
        2.3.1 遗传参数估计第34页
        2.3.2 遗传力与遗传相关第34-35页
    2.4 小结第35-36页
第三章 母猪繁殖性状全基因组关联分析第36-63页
    3.1 试验材料与方法第36-42页
        3.1.1 试验群体第36页
        3.1.2 表型记录第36页
        3.1.3 主要试剂和溶液配制第36-37页
        3.1.4 主要试验仪器第37页
        3.1.5 样品采集及基因组DNA提取第37-38页
        3.1.6 SNP分型与质控第38-40页
        3.1.7 统计分析方法第40-42页
        3.1.8 功能注释第42页
    3.2 结果与分析第42-59页
        3.2.1 初产母猪繁殖性状全基因组关联分析第42-53页
        3.2.2 仔猪均匀度与胎间距性状全基因组关联分析第53-59页
    3.3 讨论第59-62页
        3.3.1 猪繁殖性状GWAS研究第59页
        3.3.2 群体分层第59-60页
        3.3.3 初产母猪繁殖性状功能基因第60-61页
        3.3.4 仔猪均匀度与胎间距性状功能基因第61-62页
    3.4 小结第62-63页
第四章 基于猪80K芯片进行拷贝数变异的检测与分析第63-78页
    4.1 试验材料与方法第63-68页
        4.1.1 试验群体第63页
        4.1.2 表型记录第63页
        4.1.3 主要试剂和溶液配制第63页
        4.1.4 主要试验仪器第63页
        4.1.5 样品采集及基因组DNA提取第63-64页
        4.1.6 CNV的推断第64-66页
        4.1.7 CNVR与繁殖性状之间的关联分析第66页
        4.1.8 CNVR包含的基因及其功能分析第66页
        4.1.9 CNVR的荧光定量PCR验证第66-68页
    4.2 结果与分析第68-75页
        4.2.1 质控后样本数第68页
        4.2.2 CNVs推断结果第68-69页
        4.2.3 CNVR与繁殖性状之间的关联分析第69-70页
        4.2.4 CNVR包含的基因及其功能分析第70-73页
        4.2.5 荧光定量PCR验证第73-75页
    4.3 讨论第75-76页
        4.3.1 关于CNV检测技术第75页
        4.3.2 与其他CNV研究的比较第75页
        4.3.3 CNVR内基因功能分析第75-76页
    4.4 小结第76-78页
第五章 结论第78-79页
参考文献第79-93页
致谢第93-94页
附录第94-111页
个人简介第111-112页

论文共112页,点击 下载论文
上一篇:北京鸭GBS平台构建及部分经济性状全基因组关联分析
下一篇:牛蒡苷元的制备及其抗PCV2和PRRSV活性研究