| 附表 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| Table of Contents | 第10-13页 |
| LIST OF TABLES | 第13-14页 |
| LIST OF FIGURES | 第14-15页 |
| ABBREVIATIONS | 第15-16页 |
| CHAPTER 1 INTRODUCTION | 第16-23页 |
| 1.1 Importance of Cotton | 第16页 |
| 1.2 Cultivated Gossypium Species | 第16-17页 |
| 1.2.1 Diploid Cotton Species | 第16-17页 |
| 1.2.2 Tetraploid Cotton Species | 第17页 |
| 1.3 Races of Gossypium hirsutum | 第17-19页 |
| 1.4 Basis of Genetic Diversity | 第19页 |
| 1.5 Genetic Diversity in Crop Improvement | 第19-20页 |
| 1.6 Genetic Diversity of Gossypium species | 第20-22页 |
| 1.6.1 Morphological and Physiological Diversity | 第20页 |
| 1.6.2 Agronomic Diversity | 第20页 |
| 1.6.3 Molecular Diversity | 第20-22页 |
| 1.7 Objectives | 第22-23页 |
| CHAPTER 2 REVIEW LITERATURE | 第23-28页 |
| 2.1 Genetic Markers | 第23-28页 |
| 2.1.1 Morphological Markers | 第23页 |
| 2.1.2 Biochemical Marker | 第23-24页 |
| 2.1.3 Molecular Markers | 第24-28页 |
| 2.1.3.1 Hybridization Based Marker(Non-PCR Technique) | 第24-25页 |
| 2.1.3.2 PCR Based Techniques | 第25-28页 |
| 2.1.3.2.1 Random Amplified Polymorphic DNA(RAPD) | 第25-26页 |
| 2.1.3.2.2 Amplified Fragment Length Polymorphism(AFLP) | 第26页 |
| 2.1.3.2.3 Simple Sequence Repeat(SSR) | 第26-28页 |
| CHAPTER 3 | 第28-39页 |
| 3.3 | 第28-29页 |
| 3.3.1 Stock Solutions for DNA Extraction | 第28-29页 |
| 3.3.1.1 CTAB DNA Extraction Buffer(pH=8.0) | 第28页 |
| 3.3.1.2 1M Tris-HCl | 第28-29页 |
| 3.3.1.3 0.5M EDTA(pH=8.0) | 第29页 |
| 3.4 DAN Quantification | 第29-30页 |
| 3.4.1 Preparation of 1% Agarose Gel | 第29页 |
| 3.4.2 Agarose Gel Electrophoresis | 第29-30页 |
| 3.4.3 Gel Staining | 第30页 |
| 3.5 Polymerase Chain Reaction(PCR) | 第30-32页 |
| 3.5.1 PCR Mixture for Screening of SSR Molecular Markers | 第30页 |
| 3.5.2 PCR Mixture for Screening of Accessions | 第30-31页 |
| 3.5.3 PCR Program | 第31-32页 |
| 3.6 Polyacrylamide Gel Electrophoresis(PAGE) | 第32-34页 |
| 3.6.1 Preparation of Polyacrylamide Gel Casting Apparatus | 第32页 |
| 3.6.2 Preparation of 8% PAGE | 第32页 |
| 3.6.3 Sample Loading and Electrophoresis | 第32-33页 |
| 3.6.4 Silver Staining | 第33-34页 |
| 3.6.4.1 Fixing | 第33页 |
| 3.6.4.2 Silver Impregnation | 第33-34页 |
| 3.6.4.3 Development | 第34页 |
| 3.7 Stock Solutions for PAGE | 第34-35页 |
| 3.8 Screened SSR Primers | 第35页 |
| 3.9 Gel Scoring | 第35-36页 |
| 3.10 Data Analysis | 第36页 |
| 3.11 Agronomic Traits | 第36-37页 |
| 3.11.1 Plant Height(cm) | 第37页 |
| 3.11.2 Number of Days to 50% Flowering | 第37页 |
| 3.11.3 Number of Sympodial Branches per Plant | 第37页 |
| 3.11.4 First Fruit Branch Node Number | 第37页 |
| 3.11.5 Lint Percentage | 第37页 |
| 3.12 Fiber Traits | 第37-39页 |
| 3.12.1 Upper Half Mean Length(mm) | 第37页 |
| 3.12.2 Micronaire | 第37页 |
| 3.12.3 Uniformity Index(%) | 第37-38页 |
| 3.12.4 Fiber Elongation | 第38-39页 |
| CHAPTER 4 RESULTS | 第39-73页 |
| 4.1 Molecular Genetic Diversity | 第39-64页 |
| 4.1.1 SSR Polymorphism | 第39-48页 |
| 4.1.1.1 Number of Alleles | 第39-45页 |
| 4.1.1.2 Polymorphism Information Content(PIC) | 第45-47页 |
| 4.1.1.3 Unique Alleles | 第47-48页 |
| 4.1.2 Genetic Similarity | 第48-64页 |
| 4.1.2.1 Intra-race Genetic Similarity | 第48-57页 |
| 4.1.2.1.1 Race Latifolium(LA) | 第48-51页 |
| 4.1.2.1.2 Race Richmondi(RI) | 第51-52页 |
| 4.1.2.1.3 Race Punctatum(PU) | 第52-53页 |
| 4.1.2.1.4 Race Morrilli(MO) | 第53-54页 |
| 4.1.2.1.5 Race Palmeri(PA)and Yucatanense(YU) | 第54-55页 |
| 4.1.2.1.6 Race Marie-galante(MG) | 第55-57页 |
| 4.1.2.2 Inter-race Genetic Similarity | 第57-58页 |
| 4.1.2.3 Genetic Similarity of Cultivated Gossypium Species | 第58-59页 |
| 4.1.2.4 Similarity between A Genome and AD Genome Species | 第59-64页 |
| 4.2 Phenotypic Diversity | 第64-73页 |
| 4.2.1 Agronomic Traits | 第64-68页 |
| 4.2.2 Fiber Traits | 第68-70页 |
| 4.2.3 Phenotypic Clustering | 第70-73页 |
| CHAPTER 5 DISCUSSION | 第73-78页 |
| 5.1 Microsatellite Polymorphism | 第73-74页 |
| 5.2 Genetic Similarity | 第74-76页 |
| 5.3 Clustering | 第76-77页 |
| 5.4 SSR Markers | 第77页 |
| 5.5 Phenotypic Traits | 第77-78页 |
| CONCLUSION | 第78-80页 |
| REFERENCES | 第80-90页 |
| APPENDIX | 第90-94页 |
| ACKNOWLEDGEMENT | 第94-95页 |
| CURRICULUM VITAE | 第95页 |
