抗药性沙门氏菌及其噬菌体的相互作用关系
| 中文摘要 | 第9-11页 |
| ABSTRACT | 第11-12页 |
| 符号说明 | 第13-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-30页 |
| 1.1 沙门氏菌病及其治疗 | 第14-15页 |
| 1.2 噬菌体与宿主相互作用 | 第15-24页 |
| 1.2.1 宿主抵抗噬菌体的防御机制 | 第16-20页 |
| 1.2.1.1 阻断吸附 | 第16-17页 |
| 1.2.1.1.1 阻塞受体 | 第16-17页 |
| 1.2.1.1.2 细胞外基质的覆盖作用 | 第17页 |
| 1.2.1.1.3 竞争性抑制剂 | 第17页 |
| 1.2.1.2 阻断DNA侵入 | 第17-19页 |
| 1.2.1.3 切割侵入的核酸 | 第19-20页 |
| 1.2.1.3.1 限制修饰系统 | 第19页 |
| 1.2.1.3.2 CRISPR-Cas系统 | 第19-20页 |
| 1.2.1.4 流产性感染 | 第20页 |
| 1.2.2 噬菌体抵抗宿主防御的机制 | 第20-23页 |
| 1.2.2.1 对抗吸附阻碍 | 第21页 |
| 1.2.2.2 对抗R-M系统 | 第21-22页 |
| 1.2.2.3 对抗CRISPR-Cas系统 | 第22-23页 |
| 1.2.2.4 对抗流产性感染系统 | 第23页 |
| 1.2.3 相互作用研究展望 | 第23-24页 |
| 1.3 噬菌体的应用 | 第24-26页 |
| 1.3.1 噬菌体在畜禽养殖中的应用 | 第24-25页 |
| 1.3.2 噬菌体在水产养殖中的应用 | 第25-26页 |
| 1.3.3 噬菌体在食品生产中的应用 | 第26页 |
| 1.3.4 其他应用 | 第26页 |
| 1.4 多位点序列分型 | 第26-30页 |
| 1.4.1 MLST的概念与基本原理 | 第27-28页 |
| 1.4.2 MLST与其他分型方法的比较 | 第28页 |
| 1.4.3 MLST的应用 | 第28-30页 |
| 第二章 四地区养殖场主要流行菌株分离与分析 | 第30-47页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30-36页 |
| 2.1.1 实验材料 | 第30-31页 |
| 2.1.2 仪器与设备 | 第31-32页 |
| 2.1.3 实验方法与步骤 | 第32-36页 |
| 2.1.3.1 菌株分离 | 第32页 |
| 2.1.3.2 分离菌种的鉴定 | 第32-33页 |
| 2.1.3.3 MLST分析 | 第33-36页 |
| 2.1.3.4 沙门氏菌药敏试验 | 第36页 |
| 2.2 结果与分析 | 第36-44页 |
| 2.2.1 菌株分离结果 | 第36-38页 |
| 2.2.2 PCR鉴定结果 | 第38-39页 |
| 2.2.3 MLST结果统计与分析 | 第39-43页 |
| 2.2.3.1 沙门氏菌MLST结果 | 第39-40页 |
| 2.2.3.2 金黄色葡萄球菌MLST结果 | 第40-41页 |
| 2.2.3.3 大肠杆菌MLST结果 | 第41-42页 |
| 2.2.3.4 肺炎克雷伯氏菌的MLST结果 | 第42-43页 |
| 2.2.4 沙门氏菌药敏试验结果 | 第43-44页 |
| 2.3 讨论 | 第44-46页 |
| 2.4 小结 | 第46-47页 |
| 第三章 沙门氏菌噬菌体的分离纯化与性质分析 | 第47-62页 |
| 3.1 材料与方法 | 第47-52页 |
| 3.1.1 实验材料与仪器 | 第47页 |
| 3.1.2 实验方法与步骤 | 第47-52页 |
| 3.1.2.1 沙门氏菌噬菌体的分离纯化与富集 | 第47-48页 |
| 3.1.2.2 沙门氏菌噬菌体基本理化性质分析 | 第48-50页 |
| 3.1.2.3 噬菌体的电镜观察 | 第50-51页 |
| 3.1.2.4 噬菌体基因组测序分析 | 第51-52页 |
| 3.2 结果与分析 | 第52-60页 |
| 3.2.1 沙门氏菌噬菌体分离纯化结果 | 第52-53页 |
| 3.2.2 噬菌体理化性质测定结果 | 第53-56页 |
| 3.2.2.1 效价测定结果 | 第53页 |
| 3.2.2.2 最适生长温度测定结果 | 第53-54页 |
| 3.2.2.3 pH值稳定性测定结果 | 第54页 |
| 3.2.2.4 最佳感染复数测定结果 | 第54-55页 |
| 3.2.2.5 一步生长曲线测定结果 | 第55-56页 |
| 3.2.3 电镜观察结果 | 第56页 |
| 3.2.4 噬菌体基因组测序结果分析 | 第56-60页 |
| 3.2.4.1 结果统计 | 第56-58页 |
| 3.2.4.2 噬箘体基因组分析 | 第58-60页 |
| 3.3 讨论 | 第60-61页 |
| 3.4 小结 | 第61-62页 |
| 第四章 噬菌体与宿主相互作用实验 | 第62-72页 |
| 4.1 材料与方法 | 第62-65页 |
| 4.1.1 实验材料 | 第62页 |
| 4.1.2 实验方法 | 第62-65页 |
| 4.1.2.1 预实验—细菌共培养 | 第62-63页 |
| 4.1.2.2 单一菌株与单一噬菌体联合培养 | 第63页 |
| 4.1.2.4 单一细菌与多种噬箘体的联合培养 | 第63-64页 |
| 4.1.2.5 单一噬菌体与多种细菌联合培养 | 第64页 |
| 4.1.2.6 多种噬菌体与多种细菌联合培养 | 第64-65页 |
| 4.2 结果与分析 | 第65-69页 |
| 4.2.1 细菌共培养结果 | 第65-66页 |
| 4.2.2 单一菌株与单一噬箘体传代培养结果 | 第66页 |
| 4.2.3 单一菌株与多种噬菌体的联合培养 | 第66-67页 |
| 4.2.5 单一噬菌体与多菌株联合培养 | 第67页 |
| 4.2.6 多噬箘体与多菌株联合培养(一) | 第67-68页 |
| 4.2.7 多噬箘体与多菌株联合培养(二) | 第68-69页 |
| 4.3 讨论 | 第69-71页 |
| 4.4 小结 | 第71-72页 |
| 第五章 临床剂量抗生素对肠道中噬菌体与细菌的影响 | 第72-80页 |
| 5.1 材料与方法 | 第72-74页 |
| 5.1.1 实验材料 | 第72页 |
| 5.1.2 实验方法 | 第72-74页 |
| 5.1.2.1 SPF鸡饲喂及药物处理 | 第72-73页 |
| 5.1.2.2 宏基因组测序分析 | 第73-74页 |
| 5.2 结果与分析 | 第74-77页 |
| 5.2.1 SPF鸡肠道细菌与噬菌体相互关系分析 | 第74-76页 |
| 5.2.2 抗生素对SPF鸡肠道细菌的影响 | 第76-77页 |
| 5.2.3 抗生素对SPF鸡肠道噬菌体的影响 | 第77页 |
| 5.3 讨论 | 第77-78页 |
| 5.4 小结 | 第78-80页 |
| 全文总结 | 第80-82页 |
| 参考文献 | 第82-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 攻读硕士期间发表论文情况 | 第92-93页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第93页 |
