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汶上芦花鸡蛋品质及其候选基因遗传效应分析

中文摘要第9-11页
Abstract第11-13页
1 引言第14-26页
    1.1 汶上芦花鸡品种简介第14页
    1.2 汶上芦花鸡种群研究进展第14-15页
        1.2.1 汶上芦花鸡品种资源保存现状第14-15页
        1.2.2 汶上芦花鸡遗传特性第15页
        1.2.3 种质特性第15页
    1.3 蛋品质及其影响因素研究进展第15-19页
        1.3.1 蛋品质衡量指标第16页
        1.3.2 蛋品质影响因素研究进展第16-19页
            1.3.2.1 遗传因素对蛋品质的影响第16-17页
            1.3.2.2 饲养方式对蛋品质的影响第17-18页
            1.3.2.3 周龄对蛋品质的影响第18页
            1.3.2.4 营养水平对蛋品质的影响第18-19页
            1.3.2.5 环境温度对蛋品质的影响第19页
    1.4 蛋品质相关候选基因多态性研究进展第19-24页
        1.4.1 离子转运基因第20-21页
        1.4.2 蛋壳基质蛋白基因第21-22页
        1.4.3 浓缩蛋白Ⅰ复合体亚基基因第22页
        1.4.4 血管活性肠肽基因和促卵泡激素亚基基因第22页
        1.4.5 卵抑制剂基因第22-23页
        1.4.6 H-钙黏蛋白13基因和胞外吡啶核苷酸氧化酶二硫键巯基交换酶基因.第23页
        1.4.7 共济失调-毛细血管扩张突变激酶基因和锌指蛋白基因第23-24页
    1.5 单核苷酸标记在地方鸡种上的研究进展第24-25页
    1.6 本研究目的与意义第25-26页
2 材料与方法第26-32页
    2.1 试验动物及采样时间第26页
    2.2 饲养管理第26页
    2.3 主要仪器设备第26页
    2.4 主要试剂第26-27页
    2.5 试验方法第27-32页
        2.5.1 蛋品质指标测量第27-28页
        2.5.2 鸡血液DNA的提取第28页
        2.5.3 蛋品质相关候选基因及SNPs的确定第28页
        2.5.4 引物信息第28-29页
        2.5.5 混池测序并筛选群体中存在的SNP位点第29-30页
        2.5.6 质谱分型第30页
        2.5.7 数据统计分析第30-32页
3 结果与分析第32-77页
    3.1 不同周龄汶上芦花鸡的蛋品质第32-33页
    3.2 蛋品质性状间的相关性第33-41页
        3.2.1 30周龄不同蛋品质性状间的相关性第33页
        3.2.2 40周龄不同蛋品质性状间的相关性第33-34页
        3.2.3 50周龄不同蛋品质性状间的相关性第34-41页
    3.3 候选基因目的片段PCR扩增结果第41页
    3.4 混池测序结果第41-42页
    3.5 SNP位点信息第42-43页
    3.6 候选基因质谱分型结果第43-44页
    3.7 候选基因遗传学分析第44-48页
        3.7.1 哈代温伯格平衡检验第44-46页
        3.7.2 候选基因多态性分析第46-48页
    3.8 SNPs功能预测结果第48-49页
    3.9 候选基因SNPs与蛋品质性状的关联分析第49-77页
        3.9.1 候选基因SNPs不同基因型蛋品质性状比较第49-69页
        3.9.2 候选基因SNPs对不同周龄蛋品质的表型方差贡献率第69-77页
4 讨论第77-80页
    4.1 汶上芦花鸡不同周龄蛋品质的比较第77页
    4.2 汶上芦花鸡蛋品质性状表型相关第77页
    4.3 候选基因SNPs群体遗传学分析第77-78页
    4.4 候选基因SNPs与蛋品质性状的关联分析第78-80页
5 结论第80-81页
参考文献第81-88页
致谢第88页

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