| 中文摘要 | 第2-3页 |
| ABSTRACT | 第3页 |
| 中文文摘 | 第5-11页 |
| 绪论 | 第11-25页 |
| 第一节 植物内生菌的菌群结构及其多样性 | 第11-14页 |
| 1.1 什么样的细菌能够被定义为植物内生菌 | 第11页 |
| 1.2 植物内生菌的菌群结构组成 | 第11页 |
| 1.3 植物内生菌的多样性 | 第11-13页 |
| 1.3.1 不同宿主植物内生菌的差异 | 第12页 |
| 1.3.2 不同根际土壤中植物内生菌的差异 | 第12-13页 |
| 1.4 番茄根内生菌菌群结构及多样性 | 第13-14页 |
| 第二节 植物根内生菌的侵入与定殖 | 第14-18页 |
| 2.1 植物根内生菌的来源及与根际土壤菌的关系 | 第14页 |
| 2.2 植物内生菌的侵入与定植 | 第14-17页 |
| 2.2.1 吸附于植物根表面 | 第14-15页 |
| 2.2.2 侵入植物根 | 第15页 |
| 2.2.3 侵入植物皮层 | 第15-16页 |
| 2.2.4 侵入植物木质部 | 第16-17页 |
| 2.2.5 侵染植物生殖器官 | 第17页 |
| 2.3 影响内生菌在根内定植的因素 | 第17-18页 |
| 2.3.1 内生菌自身性状对定植的影响 | 第17页 |
| 2.3.2 寄主植物类型对定植的影响 | 第17-18页 |
| 2.3.3 相关微生物对定植的影响 | 第18页 |
| 2.3.4 植物寄生线虫对定植的影响 | 第18页 |
| 第三节 植物内生菌的功能 | 第18-22页 |
| 3.1 植物内生菌的防病害作用 | 第18-20页 |
| 3.1.1 植物内生菌的抑菌能力 | 第18-19页 |
| 3.1.2 竞争营养物质及生态位 | 第19-20页 |
| 3.1.3 诱导植物抗性 | 第20页 |
| 3.2 植物内生菌的促生长作用 | 第20-21页 |
| 3.2.1 植物内生菌的直接促生作用 | 第21页 |
| 3.2.2 植物内生菌的间接促生作用 | 第21页 |
| 3.3 植物内生菌的生物固氮作用 | 第21-22页 |
| 第四节 研究内容、目的和意义 | 第22-25页 |
| 4.1 研究内容 | 第22页 |
| 4.2 研究目的及意义 | 第22-25页 |
| 第一章 番茄根内生菌优势种群的分离、鉴定与多样性分析 | 第25-37页 |
| 第一节 材料和方法 | 第25-28页 |
| 1.1 材料 | 第25-26页 |
| 1.1.1 样品采集与准备 | 第25页 |
| 1.1.2 培养基 | 第25-26页 |
| 1.1.3 主要仪器 | 第26页 |
| 1.2 方法 | 第26-28页 |
| 1.2.1 番茄根内生菌的分离纯化 | 第26-27页 |
| 1.2.2 总DNA的提取和质量检测 | 第27页 |
| 1.2.3 细菌16srRNA基因的PCR扩增 | 第27页 |
| 1.2.4 番茄根内生菌菌株的分子鉴定和系统发育分析 | 第27-28页 |
| 第二节 结果和分析 | 第28-34页 |
| 2.1 表面消毒结果的检测 | 第28页 |
| 2.2 番茄根内生菌的分离纯化 | 第28-29页 |
| 2.3 细菌16SrRNA基因的PCR扩增与测序 | 第29-34页 |
| 2.4 16S rRNA序列比对及系统发育树的构建 | 第34页 |
| 第三节 小结与讨论 | 第34-37页 |
| 第二章 番茄根内生菌主要类群代表菌株基因组测序与功能分析 | 第37-53页 |
| 第一节 材料和方法 | 第37-38页 |
| 1.1 方法 | 第37-38页 |
| 1.1.1 基因组测序 | 第37-38页 |
| 1.1.2 总DNA测序数据组装与功能注释 | 第38页 |
| 第二节 结果和分析 | 第38-51页 |
| 2.1 总DNA测序数据组装与基因组功能注释 | 第38-51页 |
| 2.1.1 基因组的基本特征 | 第38-39页 |
| 2.1.2 基因组功能注释 | 第39-45页 |
| 2.1.3 次级代谢产物分析 | 第45-51页 |
| 第三节 小结与讨论 | 第51-53页 |
| 第三章 番茄根内生菌抑菌机制的研究 | 第53-67页 |
| 第一节 材料与方法 | 第53-55页 |
| 1.1 实验材料 | 第53-54页 |
| 1.1.1 菌种 | 第53页 |
| 1.1.2 试剂 | 第53-54页 |
| 1.1.3 培养基 | 第54页 |
| 1.2 方法 | 第54-55页 |
| 1.2.1 番茄内生菌对细菌测试菌株的拮抗作用 | 第54页 |
| 1.2.2 番茄内生菌对真菌测试菌株黑曲霉的拮抗作用 | 第54页 |
| 1.2.3 p21抑菌活性与铁离子浓度关系的探究 | 第54-55页 |
| 1.2.4 p21次级代谢产物编码基因簇分析 | 第55页 |
| 第二节 结果与分析 | 第55-65页 |
| 2.1 番茄内生菌对病原菌的拮抗作用 | 第55-59页 |
| 2.2 p21抑菌活性与铁离子浓度关系 | 第59-61页 |
| 2.3 p21次级代谢产物基因簇的AntiSMASH分析 | 第61-63页 |
| 2.4 p21中铁载体合成基因簇的分析 | 第63-65页 |
| 第三节 小结与讨论 | 第65-67页 |
| 第四章 木质纤维素酶在植物内生菌侵入定殖过程中作用的研究 | 第67-81页 |
| 第一节 材料和方法 | 第67-68页 |
| 1.1 试剂和仪器 | 第67-68页 |
| 1.1.1 菌种 | 第67页 |
| 1.1.2 试剂 | 第67-68页 |
| 1.1.3 仪器 | 第68页 |
| 1.2 方法 | 第68页 |
| 1.2.1 纤维素酶活性定性分析 | 第68页 |
| 1.2.2 木聚糖酶活性定性分析 | 第68页 |
| 1.2.3 木质纤维素酶基因分析 | 第68页 |
| 第二节 结果和分析 | 第68-79页 |
| 2.1 纤维素酶活性定性分析 | 第68-72页 |
| 2.2 木聚糖酶活性定性分析 | 第72页 |
| 2.3 优势菌木质纤维素酶基因分析 | 第72-79页 |
| 第三节 小结与讨论 | 第79-81页 |
| 第五章 总结与展望 | 第81-85页 |
| 参考文献 | 第85-97页 |
| 攻读学位期间承担的科研任务与主要成果 | 第97-99页 |
| 致谢 | 第99-101页 |
| 个人简历 | 第101-105页 |
