| 中文摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 略缩词表 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-28页 |
| 1.1 植物代谢组学的研究概况 | 第12-18页 |
| 1.1.1 植物代谢组学的研究范围和内容 | 第12-13页 |
| 1.1.2 植物代谢组学的技术手段及研究方法 | 第13-18页 |
| 1.2 代谢产物的高效检测与鉴定 | 第18-21页 |
| 1.2.1 代谢产物的高效检测 | 第18-20页 |
| 1.2.2 代谢产物的鉴定 | 第20-21页 |
| 1.3 代谢组变异及代谢组的遗传连锁分析和全基因组关联分析 | 第21-26页 |
| 1.3.1 代谢组的变异 | 第21-22页 |
| 1.3.2 代谢组学的遗传连锁分析 | 第22-23页 |
| 1.3.3 代谢组学的全基因组关联分析 | 第23-26页 |
| 1.4 代谢组学在植物生物学研究中的应用 | 第26-27页 |
| 1.5 本研究的目的与意义 | 第27-28页 |
| 2 材料与方法 | 第28-36页 |
| 2.1 玉米籽粒群体材料来源 | 第28页 |
| 2.2 玉米重复性选择及材料选取 | 第28-29页 |
| 2.3 基因型分析和转录组测序 | 第29页 |
| 2.4 代谢用化学试剂 | 第29页 |
| 2.5 样品的制备与提取 | 第29-30页 |
| 2.6 实验仪器条件和参数 | 第30-32页 |
| 2.6.1 HPLC条件 | 第30页 |
| 2.6.2 ESI-Q TRAP-MS/MS条件和参数 | 第30页 |
| 2.6.3 线性离子阱条件和参数 | 第30-31页 |
| 2.6.4 三重四极杆条件和参数 | 第31页 |
| 2.6.5 ESI-Q TOF-MS/MS条件和参数 | 第31-32页 |
| 2.7 代谢统计分析 | 第32页 |
| 2.8 mQTL定位分析 | 第32页 |
| 2.9 eQTL分析 | 第32-33页 |
| 2.10 全基因组关联分析 | 第33页 |
| 2.11 载体构建和水稻遗传转化 | 第33-34页 |
| 2.12 表达分析 | 第34-35页 |
| 2.13 百粒重与代谢产物的显著性分析 | 第35页 |
| 2.14 数据的通用性 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-76页 |
| 3.1 玉米籽粒代谢组学分析 | 第36-48页 |
| 3.1.1 玉米籽粒MS2T数据库的建立 | 第36-39页 |
| 3.1.2 代谢产物的鉴定和注释 | 第39-44页 |
| 3.1.3 代谢产物高通量检测 | 第44-46页 |
| 3.1.4 代谢产物间相关性分析和物质聚类 | 第46-48页 |
| 3.2 玉米籽粒中基于代谢组学的遗传分析 | 第48-54页 |
| 3.2.1 代谢表型的统计分析 | 第48-50页 |
| 3.2.2 玉米关联群体的mGWAS分析 | 第50-53页 |
| 3.2.3 玉米RIL群体的mQTL分析 | 第53-54页 |
| 3.3 代谢相关基因功能研究和代谢网络构建 | 第54-76页 |
| 3.3.1 候选基因的挖掘与分析 | 第55-57页 |
| 3.3.2 代谢相关候选基因的功能研究 | 第57-64页 |
| 3.3.3 玉米酚胺代谢途径网络构建 | 第64-70页 |
| 3.3.4 玉米籽粒黄酮代谢网络构建 | 第70-74页 |
| 3.3.5 代谢产物与重要农艺性状间的相互关系 | 第74-76页 |
| 4 讨论 | 第76-81页 |
| 4.1 代谢产物的生化分析及鉴定是代谢组学的研究基础 | 第76-78页 |
| 4.2 基于代谢组学的关联分析与多方法的结合是玉米遗传研究的重要手段 | 第78-79页 |
| 4.3 利用代谢组学解析复杂生物性状 | 第79-81页 |
| 5 参考文献 | 第81-99页 |
| 附录 | 第99-104页 |
| 附录Ⅰ：玉米籽粒中黄酮和酚胺定位的候选基因信息表 | 第99-101页 |
| 附录Ⅱ：玉米籽粒中与HKW相关的代谢产物信息 | 第101-103页 |
| 附录Ⅲ：作者简介 | 第103-104页 |
| 个人简历 | 第103页 |
| 在读期间发表论文 | 第103页 |
| 申请专利 | 第103-104页 |
| 致谢 | 第104-106页 |
