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两种木食性白蚁肠道微生物源糖苷水解酶多样性和酶学特性研究

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 文献综述第13-23页
    1.1 引言第13页
    1.2 白蚁肠道共生微生物及其生理功能第13-15页
    1.3 白蚁的木质纤维素酶分解系统第15-17页
        1.3.1 低等白蚁的木质纤维素分解系统第15-16页
        1.3.2 高等白蚁的木质纤维素分解系统第16-17页
    1.4 白蚁及其共生微生物纤维素酶、半纤维素酶研究概况第17-22页
        1.4.1 木质纤维素降解酶类及其功能第17-19页
        1.4.2 白蚁宿主来源的纤维素酶第19-20页
        1.4.3 白蚁共生微生物的纤维素酶以及半纤维素酶第20-22页
    1.5 本研究的目的和意义第22-23页
第二章 黑胸散白蚁共生疣微菌TSB-47木质纤维素酶基因的多样性及木聚糖酶Xyn1959的酶活特性研究第23-52页
    2.1 材料第23-28页
        2.1.1 实验材料第23页
        2.1.2 主要仪器第23-24页
        2.1.3 主要试剂、培养基以及缓冲液的配制第24-28页
    2.2 实验方法第28-34页
        2.2.1 Opitutaceae sp.TSB-47基因组DNA的提取第28页
        2.2.2 Opitutaceae sp.TSB-47基因组测序第28页
        2.2.3 纤维素、半纤维素酶的系统发育分析第28页
        2.2.4 纤维素酶以及半纤维素酶基因重组表达质粒的构建第28-29页
        2.2.5 Xyn1959木聚糖酶的表达以及纯化第29-31页
        2.2.6 重组Xyn1959木聚糖酶酶学性质研究第31-34页
    2.3 实验结果第34-49页
        2.3.1 Opitutaceae sp.TSB-47的基因组DNA第34页
        2.3.2 Opitutaceae sp.TSB-47的基因组注释与分析第34-37页
        2.3.3 Opitutaceae sp.TSB-47纤维素酶以及半纤维素酶的多样性分析第37-41页
        2.3.4 Opitutaceae sp.TSB-47内切葡聚糖酶的系统发育分析第41页
        2.3.5 Opitutaceae sp.TSB-47木聚糖酶的系统发育分析第41-42页
        2.3.6 纤维素酶以及半纤维素酶基因重组表达质粒的构建第42页
        2.3.7 Xyn1959木聚糖酶基因全长的克隆第42-44页
        2.3.8 Xyn1959木聚糖酶基因的异源表达、纯化第44-45页
        2.3.9 重组Xyn1959木聚糖酶活性分析第45-49页
    2.4 讨论第49-52页
第三章 黑胸散白蚁肠道GHF7纤维素酶基因的克隆、表达以及酶活特性研究第52-71页
    3.1 实验材料第52-53页
        3.1.1 白蚁的采集和饲养第52页
        3.1.2 主要试剂第52-53页
    3.2 实验方法第53-57页
        3.2.1 黑胸散白蚁肠道不同样品DNA的提取第53页
        3.2.2 黑胸散白蚁肠道GHF7纤维素酶基因的定位第53页
        3.2.3 黑胸散白蚁全肠cDNA的制备第53-54页
        3.2.4 GHF7基因的PCR扩增和RT-PCR扩增第54-55页
        3.2.5 GHF7基因DNA文库以及cDNA文库的构建第55页
        3.2.6 GHF7基因的系统发育分析第55页
        3.2.7 重组RcGHF7-RT33蛋白的表达以及纯化第55-56页
        3.2.8 RcGHF7-RT33的β-葡萄糖苷酶特性研究第56-57页
    3.3 实验结果第57-68页
        3.3.1 黑胸散白蚁肠道GHF7基因的定位第57页
        3.3.2 黑胸散白蚁全肠GHF7基因的多样性分析第57-60页
        3.3.3 黑胸散白蚁肠道已表达GHF7基因的多样性分析第60-62页
        3.3.4 黑胸散白蚁肠道GHF7纤维素酶基因RcGHF7-RT33的多重比对第62-64页
        3.3.5 重组RcGHF7-RT33蛋白表达以及纯化第64-66页
        3.3.6 重组RcGHF7-RT33的β-葡萄糖苷酶活性分析第66-68页
    3.4 讨论第68-71页
第四章 海南象白蚁肠道共生细菌来源的EG酶的多样性与活性研究第71-96页
    4.1 实验材料第71-72页
        4.1.1 白蚁的采集和饲养第71页
        4.1.2 主要试剂第71-72页
    4.2 实验方法第72-79页
        4.2.1 海南象白蚁全肠Fosmid文库的构建第72-75页
        4.2.2 Fosmid文库中具有纤维素酶活性克隆的筛选第75-76页
        4.2.3 Fosmid文库中具有EG酶活性克隆的测序第76页
        4.2.4 EG酶基因的定位第76-77页
        4.2.5 海南象白蚁肠道不同部位EG酶基因文库的构建第77页
        4.2.6 海南象白蚁肠道不同部位EG酶基因文库的Rarefaction分析第77页
        4.2.7 海南象白蚁肠道EG酶基因的系统发育分析第77页
        4.2.8 NSEG5a基因的表达与纯化第77页
        4.2.9 重组NSEG5a的EG酶学特性研究第77-79页
    4.3 实验结果第79-94页
        4.3.1 海南象白蚁全肠Fosmid文库的构建第79-82页
        4.3.2 具有纤维素酶活性克隆的筛选第82-83页
        4.3.3 具有EG酶活性克隆的454测序及分析第83-85页
        4.3.4 GHF5内切-β-1,4-葡聚糖酶基因定位第85-86页
        4.3.5 海南象白蚁肠道不同部位EG基因的克隆第86-88页
        4.3.6 NSEG5a基因全长的克隆第88-89页
        4.3.7 NSEG5a的异源表达和纯化第89-91页
        4.3.8 NSEG5a重组酶的酶活特性研究第91-94页
    4.4 讨论第94-96页
第五章 总结与展望第96-98页
参考文献第98-108页
攻读学位期间发表的论文第108-109页
致谢第109页

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