摘要 | 第5-7页 |
ABSTRACT | 第7-8页 |
前言 | 第9-12页 |
1 材料和方法 | 第12-20页 |
1.1 细菌CRISPR/CAS系统间隔序列数据: | 第12-17页 |
1.2 噬菌体、质粒基因组数据: | 第17页 |
1.3 间隔序列与噬菌体、质粒基因组分别比对分析 | 第17-18页 |
1.4 生物信息计算集群 | 第18页 |
1.5 统计分析 | 第18-20页 |
2 结果 | 第20-33页 |
2.1 CRISPR结构在细菌基因组上的分布 | 第20-26页 |
2.2 噬菌体来源的间隔序列 | 第26-27页 |
2.3 质粒来源的间隔序列 | 第27-29页 |
2.4 比对中存在1条间隔序列比对成功多条质粒序列 | 第29-31页 |
2.5 同源性比对中存在1条质粒比对成功多条间隔序列 | 第31-33页 |
3 讨论 | 第33-38页 |
3.1 CRISPR结构在细菌基因组上的分布 | 第33-35页 |
3.2 间隔序列中具有明确外源性基因来源的比例较低 | 第35-37页 |
3.3 间隔序列同源性分析 | 第37-38页 |
4 结论 | 第38-39页 |
参考文献 | 第39-41页 |
综述 成簇的规律短回文间隔重复序列的结构功能与研宄进展 | 第41-50页 |
参考文献 | 第46-50页 |
硕士期间发表论文 | 第50-51页 |
附件 | 第51-70页 |
附录 | 第70-76页 |
致谢 | 第76页 |