摘要 | 第7-9页 |
ABSTRACT | 第9-10页 |
縮略词表及其英汉对照 | 第11-12页 |
第一章 文献综述 | 第12-28页 |
1.1 芝麻种质资源概述 | 第12-13页 |
1.1.1 芝麻种质资源的分布及分类 | 第12-13页 |
1.1.2 我国芝麻种质资源的收集与保存 | 第13页 |
1.2 种质资源在作物遗传育种中的重要作用 | 第13-14页 |
1.3 遗传标记的类型 | 第14-18页 |
1.3.1 形态标记 | 第14页 |
1.3.2 染色体标记 | 第14-15页 |
1.3.3 蛋白质标记 | 第15页 |
1.3.4 分子标记 | 第15-18页 |
1.3.4.1 基于分子杂交的分子标记 | 第16-17页 |
1.3.4.2 基于PCR技术的分子标记 | 第17页 |
1.3.4.3 基于限制性酶切和PCR技术结合的分子标记 | 第17-18页 |
1.3.4.4 以单核甘酸多态性为基础的新型分子标记 | 第18页 |
1.4 分子标记在作物遗传育种中的应用 | 第18-20页 |
1.4.1 利用分子标记进行基因定位 | 第18页 |
1.4.2 构建遗传图谱 | 第18-19页 |
1.4.3 核心种质的构建与鉴定 | 第19页 |
1.4.4 作物品种纯度和真实性的鉴定 | 第19页 |
1.4.5 亲缘关系与种质资源遗传多样性评价 | 第19-20页 |
1.4.6 杂种优势预测 | 第20页 |
1.4.7 分子标记辅助选择育种 | 第20页 |
1.5 基于连锁不平衡的关联分析 | 第20-26页 |
1.5.1 连锁不平衡的概念和度量 | 第21页 |
1.5.2 影响LD的因素和LD衰减 | 第21-22页 |
1.5.3 关联分析的策略 | 第22-24页 |
1.5.4 关联分析的基本方法 | 第24-25页 |
1.5.4.1 基因型分析 | 第24页 |
1.5.4.2 表型鉴定 | 第24页 |
1.5.4.3 统计分析 | 第24-25页 |
1.5.5 关联分析的研究进展及展望 | 第25-26页 |
本研究的目的及意义 | 第26-28页 |
第二章 芝麻重要产量和品质性状的关联分析研究 | 第28-86页 |
2.1 材料和方法 | 第28-35页 |
2.1.1 材料来源 | 第28-29页 |
2.1.2 田间试验设计 | 第29页 |
2.1.3 田间性状调查 | 第29-30页 |
2.1.4 基因型鉴定 | 第30-33页 |
2.1.4.1 DNA提取和检测 | 第30-32页 |
2.1.4.2 SSR标记的来源 | 第32页 |
2.1.4.3 SSR反应体系 | 第32-33页 |
2.1.4.4 SSR反应程序 | 第33页 |
2.1.4.5 PCR扩增产物检测 | 第33页 |
2.1.5 数据统计及分析 | 第33-35页 |
2.1.5.1 表型数据的分析 | 第33页 |
2.1.5.2 SSR多态引物多态性分析 | 第33页 |
2.1.5.3 连锁不平衡的估算 | 第33-34页 |
2.1.5.4 群体结构(Q矩阵)分析和个体间亲缘关系(K矩阵)分析 | 第34页 |
2.1.5.5 性状与标记的关联分析 | 第34-35页 |
2.2 结果与分析 | 第35-82页 |
2.2.1 各表型性状的变异 | 第35-37页 |
2.2.2 性状间的相关性 | 第37-38页 |
2.2.3 SSR引物多态性分析 | 第38-42页 |
2.2.4 连锁不平衡分析 | 第42-43页 |
2.2.5 群体结构分析 | 第43-46页 |
2.2.6 SSR标记与产量、品质性状的关联分析 | 第46-76页 |
2.2.6.1 GLM模型的性状关联分析 | 第46-62页 |
2.2.6.2 MLM模型的关联分析 | 第62-76页 |
2.2.7 与芝麻产量、品质性状稳定关联的SSR标记优异等位变异的发掘 | 第76-77页 |
2.2.8 与多种性状关联的SSR位点优异等位变异的比较 | 第77-82页 |
2.3 讨论 | 第82-84页 |
2.3.1 SSR标记的等位基因多样性 | 第82页 |
2.3.2 连锁不平衡位点对关联分析的影响 | 第82-83页 |
2.3.3 关联分析时分析群体结构的必要性 | 第83页 |
2.3.4 稳定关联标记的优异等位变异 | 第83-84页 |
2.4 结论 | 第84-86页 |
参考文献 | 第86-92页 |
附录 | 第92-102页 |
致谢 | 第102-104页 |
攻读硕士期间所发表论文 | 第104页 |