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五指山近交系小型猪骨髓和脐带间充质干细胞的全基因组甲基化和转录组联合分析

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 文献综述第10-18页
    1.1 MSCs的研究进展第10-12页
        1.1.1 MSCs的生物学特性第10-12页
        1.1.2 MSCs的临床应用第12页
        1.1.3 骨髓间充质干细胞(bone marrow MSCs,BMMSCs)和脐带间充质干细胞(umbilical cord MSCs,UCMSCs)第12页
    1.2 DNA甲基化研究进展第12-15页
        1.2.1 全基因组甲基化分析的方法第13-15页
    1.3 RNA-seq研究进展第15-16页
        1.3.1 转录组学的主要研究方法第15-16页
        1.3.2 RNA-Seq技术的应用第16页
    1.4 五指山小型猪近交系(Wuzhishan pig,WZSP)简介第16-17页
    1.5 本研究的目的及意义第17-18页
第二章 WZSP MSCs的分离、培养与鉴定第18-29页
    2.1 试验材料第18-20页
        2.1.1 实验动物及样品采集第18页
        2.1.2 主要仪器和设备第18页
        2.1.3 主要试剂、耗材及溶液配制第18-20页
    2.2 试验方法第20-22页
        2.2.1 WZSP MSCs的原代分离、培养与鉴定第20-22页
    2.3 结果与分析第22-27页
        2.3.1 WZSP MSCs分离、纯化及形态学观察第22-23页
        2.3.2 猪UCMSCs和BMMSCs的鉴定第23-25页
        2.3.3 猪UCMSCs和BMMSCs的成骨成脂分化第25-27页
    2.4 讨论第27-29页
第三章 WZSP MSCs的全基因组甲基化、转录组测序及其联合分析第29-60页
    3.1 试验材料第29页
        3.1.1 实验动物及样品采集第29页
        3.1.2 主要仪器和设备第29页
        3.1.3 主要试剂和耗材第29页
    3.2 试验方法第29-38页
        3.2.1 基因组DNA的提取第29-30页
        3.2.2 MeDIP-seq文库构建及前期数据处理第30-31页
        3.2.3 总RNA的提取第31页
        3.2.4 RNA-seq文库构建第31-32页
        3.2.5 Gene Ontology和KEGG pathway分析第32页
        3.2.6 反转录第32页
        3.2.7 RT-qPCR第32-34页
        3.2.8 Sequenom mass ARRAY(?)的甲基化验证第34-38页
        3.2.9 迁移能力检测第38页
    3.3 结果与分析第38-58页
        3.3.1 BMMSCs和UCMSCs的全基因组甲基化情况第38-41页
        3.3.2 BMMSCs和UCMSCs的全基因组转录组情况第41-42页
        3.3.3 BMMSCs和UCMSCs的全基因组甲基化和转录组的联合分析第42-58页
    3.4 讨论第58-60页
第四章 全文总结第60-61页
    4.1 本研究的主要结论和创新点第60页
    4.2 本研究的不足之处和下一步的计划第60-61页
致谢第61-62页
参考文献第62-68页
个人简历第68-70页
附录第70-84页

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