| 摘要 | 第11-13页 |
| Abstract | 第13-14页 |
| 前言 | 第15-16页 |
| 第一章 文献综述 | 第16-30页 |
| 1.1 植物的先天免疫机制 | 第16-18页 |
| 1.1.1 病原相关分子触发的免疫反应 | 第16-17页 |
| 1.1.2 效应因子触发的免疫反应 | 第17-18页 |
| 1.2 植物抗病反应中主要的信号转导途径 | 第18-21页 |
| 1.2.1 离子流和钙离子信号转导途径 | 第18-19页 |
| 1.2.2 氧化迸发与活性氧的产生 | 第19页 |
| 1.2.3 植物激素信号转导途径 | 第19-21页 |
| 1.2.4 其它信号转导途径 | 第21页 |
| 1.3 植物几丁质酶研究进展 | 第21-24页 |
| 1.3.1 几丁质酶的基本性质 | 第22页 |
| 1.3.2 几丁质酶的分类 | 第22-23页 |
| 1.3.3 几丁质酶参与的植物防御反应 | 第23-24页 |
| 1.4 根肿病抗性研究进展 | 第24-29页 |
| 1.4.1 根肿病的症状和芸薹根肿菌的分类地位 | 第24页 |
| 1.4.2 芸萋根肿菌的生活史 | 第24-25页 |
| 1.4.3 根肿菌的分子检测 | 第25-26页 |
| 1.4.4 芸薹种抗根肿病基因定位研究进展 | 第26-27页 |
| 1.4.5 寄主对根肿菌侵染的响应 | 第27-29页 |
| 1.5 转录组测序技术及其应用 | 第29页 |
| 1.6 本研究的目的与意义 | 第29-30页 |
| 第二章 根肿菌胁迫下大白菜近等基因系的转录组分析 | 第30-43页 |
| 2.1 材料与方法 | 第30-33页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第30页 |
| 2.1.2 芸薹根肿菌来源及休眠孢子悬浮液制备 | 第30-31页 |
| 2.1.3 根肿菌染色及显微观察 | 第31页 |
| 2.1.4 取样及总RNA提取 | 第31-32页 |
| 2.1.5 转录组测序 | 第32-33页 |
| 2.2 结果与分析 | 第33-40页 |
| 2.2.1 根肿菌侵染过程及抗病性鉴定 | 第33-35页 |
| 2.2.2 RNA质量检测 | 第35页 |
| 2.2.3 转录组测序数据产出及组装结果 | 第35-36页 |
| 2.2.4 根肿菌胁迫下抗、感近等基因系差异表达基因 | 第36页 |
| 2.2.5 差异基因功能注释 | 第36-40页 |
| 2.3 讨论 | 第40-42页 |
| 2.3.1 实验材料的选择及取样时间点的确定 | 第40-41页 |
| 2.3.2 RNA-seq技术数据的分析 | 第41页 |
| 2.3.3 抗感材料间差异表达基因分析 | 第41-42页 |
| 2.4 小结 | 第42-43页 |
| 第三章 大白菜根肿病抗性相关基因的挖掘及表达分析 | 第43-61页 |
| 3.1 材料与方法 | 第43-46页 |
| 3.1.1 试验材料及处理 | 第43页 |
| 3.1.2 根肿病抗性相关差异表达基因的筛选 | 第43-45页 |
| 3.1.3 引物设计 | 第45-46页 |
| 3.1.4 cDNA第一链的合成 | 第46页 |
| 3.1.5 实时荧光定量PCR反应体系和程序 | 第46页 |
| 3.2 结果与分析 | 第46-56页 |
| 3.2.1 模式识别受体基因(PRRs) | 第46-47页 |
| 3.2.2 含LRR结构域的抗病(R)基因 | 第47-48页 |
| 3.2.3 病程相关蛋白 | 第48-49页 |
| 3.2.4 SA、JA/ET信号转导途径相关基因 | 第49-50页 |
| 3.2.5 MAPK级联反应与WRKY转录因子 | 第50-51页 |
| 3.2.6 细胞壁修饰相关基因 | 第51-52页 |
| 3.2.7 几丁质酶基因 | 第52-53页 |
| 3.2.8 钙信号途径和氧爆反应 | 第53-54页 |
| 3.2.9 抗病相关基因qRT-PCR验证 | 第54-56页 |
| 3.3 讨论 | 第56-60页 |
| 3.3.1 抗病株系中病程相关蛋白的上调表达 | 第56页 |
| 3.3.2 植物PRRs对病原菌的识别 | 第56-57页 |
| 3.3.3 NBS-LRR类抗病蛋白对病原菌的识别 | 第57页 |
| 3.3.4 WRKY转录因子与MAPK级联反应的活化 | 第57-58页 |
| 3.3.5 钙信号转导途径与活性氧爆发 | 第58页 |
| 3.3.6 抗病株系中SA信号途径的诱导和JA/ET信号途径的抑制 | 第58-59页 |
| 3.3.7 细胞壁相关基因 | 第59-60页 |
| 3.3.8 几丁质酶应对根肿菌胁迫的反应 | 第60页 |
| 3.4 小结 | 第60-61页 |
| 第四章 大白菜几丁质酶家族成员的鉴定 | 第61-75页 |
| 4.1 材料与方法 | 第61-63页 |
| 4.1.1 基因组数据及生物信息学软件 | 第61-62页 |
| 4.1.2 几丁质酶家族成员的检索 | 第62页 |
| 4.1.3 几丁质酶家族成员的生物信息学分析 | 第62-63页 |
| 4.2 结果与分析 | 第63-73页 |
| 4.2.1 大白菜几丁质酶家族成员的基本信息 | 第63-66页 |
| 4.2.2 大白菜几丁质酶基因聚类及内含子/外显子分析 | 第66页 |
| 4.2.3 大白菜几丁质酶基因基序及保守结构域分析 | 第66-69页 |
| 4.2.4 大白菜几丁质酶基因的染色体定位 | 第69-70页 |
| 4.2.5 大白菜几丁质酶基因启动子顺式作用元件分析 | 第70-71页 |
| 4.2.6 大白菜几丁质酶基因家族的进化分析 | 第71-73页 |
| 4.3 讨论 | 第73-74页 |
| 4.4 小结 | 第74-75页 |
| 第五章 根肿菌胁迫下大白菜几丁质酶基因的表达模式分析 | 第75-82页 |
| 5.1 材料与方法 | 第75-77页 |
| 5.1.1 试验材料及处理 | 第75页 |
| 5.1.2 总RNA的提取及cDNA的合成 | 第75-76页 |
| 5.1.3 半定量PCR(Semi-quantitative PCR)和实时荧光定量(real time qPCR,qRT-PCR) | 第76-77页 |
| 5.2 结果与分析 | 第77-80页 |
| 5.2.1 大白菜几丁质酶基因在不同部位的表达 | 第77-78页 |
| 5.2.2 根肿菌侵染和几丁质处理后几丁质酶基因的表达 | 第78-79页 |
| 5.2.3 几丁质处理对根肿菌侵染和植株抗病性的影响 | 第79-80页 |
| 5.3 讨论 | 第80-81页 |
| 5.4 小结 | 第81-82页 |
| 结论 | 第82-83页 |
| 参考文献 | 第83-97页 |
| 附录 | 第97-102页 |
| 致谢 | 第102-103页 |
| 攻读研究生期间发表论文 | 第103页 |
