| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 英文缩略表 | 第15-16页 |
| 第一章 引言 | 第16-26页 |
| 1.1 关联分析的研究进展 | 第16-18页 |
| 1.1.1 关联分析的基础 | 第16页 |
| 1.1.2 关联分析的策略 | 第16-17页 |
| 1.1.3 关联分析的优势 | 第17-18页 |
| 1.1.4 关联分析在植物数量性状中的研究进展 | 第18页 |
| 1.2 水稻耐冷性研究进展 | 第18-21页 |
| 1.2.1 水稻不同生育时期的耐冷性鉴定评价 | 第18-20页 |
| 1.2.2 水稻不同生育时期的耐冷性的遗传基础 | 第20-21页 |
| 1.3 水稻耐盐碱性研究进展 | 第21-23页 |
| 1.3.1 水稻不同生育时期的耐盐碱性鉴定评价 | 第21-22页 |
| 1.3.2 水稻不同生育时期的耐盐碱性的遗传基础 | 第22-23页 |
| 1.4 云南地方稻种资源的遗传多样性研究 | 第23-24页 |
| 1.4.1 云南水稻地方品种遗传多样性的研究意义 | 第23-24页 |
| 1.4.2 云南水稻地方品种遗传多样性的研究进展 | 第24页 |
| 1.5 本研究目的和意义 | 第24-26页 |
| 第二章 粳稻选育品种的遗传多样性、遗传结构及LD分析 | 第26-37页 |
| 2.1 材料与方法 | 第26-28页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第26-27页 |
| 2.1.2 基于SSR标记的基因分型 | 第27页 |
| 2.1.3 基因型数据的统计分析 | 第27-28页 |
| 2.2 结果与分析 | 第28-35页 |
| 2.2.1 遗传多样性分析 | 第28页 |
| 2.2.2 群体结构分析 | 第28-31页 |
| 2.2.3 群体分化分析 | 第31页 |
| 2.2.4 亚群内的遗传多样性 | 第31页 |
| 2.2.5 亲缘关系的估计 | 第31-32页 |
| 2.2.6 LD | 第32-35页 |
| 2.3 讨论 | 第35-37页 |
| 2.3.1 水稻选育品种的遗传多样性 | 第35页 |
| 2.3.2 遗传结构和遗传分化 | 第35-36页 |
| 2.3.3 LD | 第36-37页 |
| 第三章 粳稻选育品种耐冷性鉴定及耐冷基因的关联分析 | 第37-56页 |
| 3.1 材料与方法 | 第38-40页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第38页 |
| 3.1.2 基于SSR标记的基因分型 | 第38页 |
| 3.1.3 耐冷鉴定方法 | 第38-39页 |
| 3.1.4 表型数据的统计分析 | 第39页 |
| 3.1.5 关联分析 | 第39-40页 |
| 3.2 结果与分析 | 第40-52页 |
| 3.2.1 不同来源粳稻选育品种的耐冷性状表型差异 | 第40-45页 |
| 3.2.2 不同来源粳稻选育品种的聚类分析 | 第45-47页 |
| 3.2.3 表型性状的多样性 | 第47-48页 |
| 3.2.4 模型比较与关联分析 | 第48-52页 |
| 3.2.5 优异等位变异的效应 | 第52页 |
| 3.3 讨论 | 第52-56页 |
| 3.3.1 不同来源粳稻选育品种的耐冷性差异 | 第52-53页 |
| 3.3.2 自然低温与冷水胁迫下聚类结果比较 | 第53-54页 |
| 3.3.3 水稻耐冷性状的遗传解析 | 第54-56页 |
| 第四章 粳稻选育品种耐盐碱性鉴定及耐盐碱基因的关联分析 | 第56-69页 |
| 4.1 材料与方法 | 第57-58页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第57页 |
| 4.1.2 基于SSR标记的基因分型 | 第57页 |
| 4.1.3 耐盐鉴定 | 第57页 |
| 4.1.4 苗期耐碱鉴定 | 第57-58页 |
| 4.1.5 表型数据的统计分析 | 第58页 |
| 4.1.6 关联分析 | 第58页 |
| 4.2 结果与分析 | 第58-67页 |
| 4.2.1 表型多样性 | 第58-60页 |
| 4.2.2 模型比较与关联分析 | 第60-66页 |
| 4.2.3 等位变异效应 | 第66-67页 |
| 4.3 讨论 | 第67-69页 |
| 4.3.1 水稻耐盐性状的遗传解析 | 第67页 |
| 4.3.2 水稻苗期耐碱性状的遗传解析 | 第67-69页 |
| 第五章 粳稻选育品种主要农艺性状的多年异地鉴定及其关联分析 | 第69-80页 |
| 5.1 材料与方法 | 第70页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第70页 |
| 5.1.2 基于SSR标记的基因分型 | 第70页 |
| 5.1.3 表型鉴定 | 第70页 |
| 5.1.4 表型数据的统计分析 | 第70页 |
| 5.1.5 关联分析 | 第70页 |
| 5.2 结果与分析 | 第70-78页 |
| 5.2.1 表型多样性 | 第70-72页 |
| 5.2.2 模型比较与关联分析 | 第72-77页 |
| 5.2.3 优异等位变异的效应 | 第77-78页 |
| 5.3 讨论 | 第78-80页 |
| 第六章 云南农家保护水稻地方品种遗传多样性的历时变化 | 第80-98页 |
| 6.1 材料与方法 | 第80-83页 |
| 6.1.1 试验材料 | 第80-81页 |
| 6.1.2 基因型分析 | 第81-82页 |
| 6.1.3 序列分析及中性检验 | 第82页 |
| 6.1.4 单倍型的演化网络分析 | 第82-83页 |
| 6.1.5 群体结构和群体分化 | 第83页 |
| 6.2 结果与分析 | 第83-94页 |
| 6.2.1 核苷酸多样性与中性检验 | 第83-87页 |
| 6.2.2 单倍型的系统发生关系和地理分析 | 第87-89页 |
| 6.2.3 稻区内的遗传变异 | 第89-91页 |
| 6.2.4 群体结构与遗传分化 | 第91-94页 |
| 6.3 讨论 | 第94-98页 |
| 6.3.1 云南水稻地方品种的农家保护现状 | 第94-95页 |
| 6.3.2 水稻地方品种单倍型的动态变化 | 第95-96页 |
| 6.3.3 水稻地方品种群体时期间与时期内的遗传分化 | 第96页 |
| 6.3.4 云南农家保护下水稻地方品种遗传多样性的维持机制 | 第96-98页 |
| 第七章 全文结论 | 第98-101页 |
| 7.1 粳稻抗逆性关联分析 | 第98-99页 |
| 7.2 云南农家保护水稻地方品种遗传多样性的历时变化 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-115页 |
| 附录 | 第115-144页 |
| 致谢 | 第144-145页 |
| 作者简历 | 第145页 |
