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咔唑降解菌株的筛选及降解基因的研究

摘要第6-7页
abstract第7-8页
英文缩略表第12-13页
第一章 引言第13-22页
    1.1 咔唑的概述第13-14页
        1.1.1 咔唑的性质第13-14页
        1.1.2 咔唑来源及环境污染现状第14页
        1.1.3 咔唑的危害第14页
    1.2 咔唑的微生物降解第14-21页
        1.2.1 上游降解途径第15-18页
        1.2.2 下游降解途径第18-19页
        1.2.3 咔唑降解基因簇第19-20页
        1.2.4 咔唑降解基因簇的调控第20-21页
    1.3 研究目的和意义第21-22页
第二章 咔唑降解菌的分离、鉴定及降解特性的研究第22-33页
    2.1 实验材料第22页
        2.1.1 实验试剂第22页
        2.1.2 培养基第22页
        2.1.3 主要实验仪器第22页
    2.2 实验方法第22-24页
        2.2.1 降解菌的分离和纯化第22-23页
        2.2.2 菌株的形态和生理生化鉴定第23页
        2.2.3 菌株 16S rRNA基因序列的分析第23页
        2.2.4 菌株生长曲线测定第23页
        2.2.5 菌株降解特性的研究第23-24页
        2.2.6 土壤原位修复模拟第24页
        2.2.7 实验数据分析第24页
    2.3 结果与分析第24-31页
        2.3.1 菌落形态和生理生化特性第24-25页
        2.3.2 B1菌株的 16S rRNA基因的PCR扩增和序列鉴定第25-27页
        2.3.3 B1菌株的生长曲线第27页
        2.3.4 B1菌株对咔唑降解能力的测定第27-28页
        2.3.5 环境因素对降解效率的影响第28-30页
        2.3.6 B1菌株对不同底物的降解能力第30页
        2.3.7 土壤原位修复模拟第30-31页
    2.4 小结与讨论第31-33页
第三章 B1菌株咔唑降解基因簇的分析与表达研究第33-46页
    3.1 实验材料第33页
        3.1.1 主要试剂、菌株和载体第33页
        3.1.2 培养基和相关溶液第33页
        3.1.3 主要实验仪器第33页
    3.2 实验方法第33-38页
        3.2.1 咔唑降解基因簇的分析第33页
        3.2.2 基因保守区的获得第33-35页
        3.2.3 RNA的提取第35-37页
        3.2.4 RT-PCR实验第37页
        3.2.5 qRT-PCR实验第37-38页
    3.3 结果与分析第38-45页
        3.3.1 咔唑降解基因簇的分析第38-40页
        3.3.2 保守基因的扩增第40-41页
        3.3.3 测序结果分析第41页
        3.3.4 RNA提取第41-42页
        3.3.5 降解基因簇表达模式的研究第42页
        3.3.6 qRT-PCR实验结果第42-45页
    3.4 小结与讨论第45-46页
第四章 咔唑降解基因簇中carB基因的克隆与表达第46-63页
    4.1 实验材料第46-47页
        4.1.1 主要试剂、菌株和载体第46页
        4.1.2 培养基和缓冲液第46页
        4.1.3 主要实验仪器第46-47页
    4.2 实验方法第47-52页
        4.2.1 carB、carBa和carBb基因的扩增第47页
        4.2.2 表达载体的构建第47-49页
        4.2.3 CarB、CarBa和CarBb的生物信息学分析第49页
        4.2.4 CarB、CarBa和CarBb的诱导表达和检测第49-51页
        4.2.5 酶学性质分析第51-52页
    4.3 结果与分析第52-61页
        4.3.1 克隆获得carB、carBa和carBb基因第52页
        4.3.2 CarB、CarBa和CarBb的生物信息学分析第52-57页
        4.3.3 蛋白质的表达和检测第57-59页
        4.3.4 CarB酶功能研究第59页
        4.3.5 酶学性质分析第59-61页
    4.4 小结与讨论第61-63页
第五章 全文结论第63-65页
参考文献第65-71页
附录第71-73页
致谢第73-74页
作者简历第74页

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