| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第9-13页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第9-10页 |
| 1.2 研究现状与进展 | 第10-11页 |
| 1.2.1 蛋白质分类研究现状与进展 | 第10-11页 |
| 1.2.2 图核的发展 | 第11页 |
| 1.3 本文的主要工作 | 第11-12页 |
| 1.4 本文的组织结构 | 第12-13页 |
| 第2章 线性分类器 | 第13-23页 |
| 2.1 分类问题和分类器 | 第13-14页 |
| 2.2 线性可分问题的支撑向量分类器 | 第14-18页 |
| 2.2.1 最大间隔法 | 第14-16页 |
| 2.2.2 原始问题与对偶问题 | 第16-18页 |
| 2.2.3 支撑向量 | 第18页 |
| 2.3 线性支撑向量分类器 | 第18-21页 |
| 2.3.1 软间隔优化 | 第18-19页 |
| 2.3.2 线性支撑向量分类器 | 第19-21页 |
| 2.4 本章小结 | 第21-23页 |
| 第3章 核函数 | 第23-31页 |
| 3.1 非线性分类问题 | 第23-26页 |
| 3.1.1 非线性分类例子 | 第23-24页 |
| 3.1.2 非线性分类算法 | 第24-26页 |
| 3.2 核函数 | 第26-29页 |
| 3.2.1 内积与核函数的特征 | 第26-28页 |
| 3.2.2 核函数的性质及常见的核 | 第28-29页 |
| 3.3 本章小结 | 第29-31页 |
| 第4章 图核 | 第31-43页 |
| 4.1 图的基本概念 | 第31-33页 |
| 4.2 图核 | 第33-40页 |
| 4.2.1 随机通路核 | 第33-35页 |
| 4.2.2 子树模式核 | 第35-37页 |
| 4.2.3 所有路径核和最短路径核 | 第37-40页 |
| 4.3 本章小结 | 第40-43页 |
| 第5章 Weisfeiler-Lehman图匹配与蛋白质识别 | 第43-53页 |
| 5.1 蛋白质的结构 | 第43-46页 |
| 5.1.1 蛋白质的一级结构 | 第44-45页 |
| 5.1.2 蛋白质的二级结构 | 第45-46页 |
| 5.1.3 蛋白质的三级结构与四级结构 | 第46页 |
| 5.2 蛋白质分类进展 | 第46-48页 |
| 5.3 Weisfeiler-Lehman图匹配 | 第48-52页 |
| 5.3.1 一维WL图匹配 | 第48-50页 |
| 5.3.2 通用WL核函数 | 第50-51页 |
| 5.3.3 WL图核 | 第51-52页 |
| 5.4 本章小结 | 第52-53页 |
| 第6章 实验结果与分析 | 第53-59页 |
| 6.1 蛋白质数据集 | 第53-55页 |
| 6.2 实验配置 | 第55-56页 |
| 6.3 各种图核的性能 | 第56-57页 |
| 6.4 本章小结 | 第57-59页 |
| 结论 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 攻读硕士学位期间所发表的学术论文 | 第65-67页 |
| 致谢 | 第67页 |