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白菜类作物抗坏血酸和开花相关基因的系统进化及QTL定位分析

摘要第8-11页
ABSTRACT第11-14页
缩略词表第15-18页
前言第18-19页
第一章 文献综述第19-37页
    1 抗坏血酸在植物体内的生物合成代谢及调控途径第19-24页
        1.1 抗坏血酸生物合成途径第19-22页
        1.2 抗坏血酸在植物体内的调控作用第22-23页
        1.3 抗坏血酸相关基因的调控机制第23-24页
    2 开花途径及开花基因在体内的调控途径第24-28页
        2.1 成花调控途径第24-26页
        2.2 花形态建成模式第26-27页
        2.3 果胶的代谢过程对花粉发育和抗坏血酸合成的重要作用第27-28页
    3 十字花科重要植物基因组发展概况第28-31页
        3.1 白菜基因组研究进展第29-30页
        3.2 甘蓝基因组的研究进展第30页
        3.3 甘蓝型油菜基因组的研究进展第30-31页
        3.4 比较基因组学的研究方案第31页
    4 基因剂量假说及复制基因类型第31-34页
        4.1 复制基因的产生第32-33页
        4.2 复制基因的分化特征第33-34页
    5 分子标记技术发展概况第34-37页
        5.1 分子标记技术的重要发展阶段第34-35页
        5.2 连锁图谱构建技术的发展第35-37页
第二章 抗坏血酸相关基因在白菜基因组三倍化过程中的进化保守性研究第37-57页
    1 引言第38-39页
    2 材料与方法第39-44页
        2.1 材料第39页
        2.2 试验方法第39-44页
    3 结果与分析第44-54页
        3.1 AsA相关基因在拟南芥和白菜基因组中的鉴定第44-46页
        3.2 AsA相关基因在白菜基因组中的保留情况第46页
        3.3 AsA共线基因碱基同义突变频率(Ks)的计算第46-47页
        3.4 AsA转运基因的进化历程第47-49页
        3.5 白菜和拟南芥AsA转运基因结构和功能的鉴定第49-50页
        3.6 L-半乳糖生物合成途径的复制和分化第50-51页
        3.7 白菜和拟南芥AsA代谢循环途径相关基因特征和表达分析第51-52页
        3.8 白菜和拟南芥AsA相关基因功能和表达分析第52-54页
    4 讨论第54-57页
第三章 抗坏血酸L-半乳糖途径基因在白菜中的保守性及功能分化性研究第57-75页
    1 引言第58-59页
    2 材料与方法第59-63页
        2.1 材料第59-60页
        2.2 试验方法第60-63页
    3 结果与分析第63-72页
        3.1 芸薹属植物中L-半乳糖基因的复制和分化第63-65页
        3.2 L-半乳糖基因的特征分析第65-67页
        3.3 在不结球白菜中FLC基因调控VTC5基因的表达第67-68页
        3.4 光照下L-半乳糖途径基因的表达模式分析第68-70页
        3.5 四种逆境胁迫对L-半乳糖途径基因的影响第70-72页
    4 讨论第72-75页
第四章 AKR基因分子进化分析及在不结球白菜克隆鉴定第75-97页
    1 引言第76-77页
    2 材料与方法第77-82页
        2.1 材料第77页
        2.2 试验方法第77-82页
    3 结果与分析第82-95页
        3.1 ARK基因家族分组鉴定第82-84页
        3.2 ARK基因家族进化及特征分析第84-85页
        3.3 植物进化过程中AKRs分支选择压力的鉴定第85-86页
        3.4 AKRs在白菜基因组三倍化过程中的分化特征第86-88页
        3.5 白菜和拟南芥AKRs基因结构特征和组织表达分析第88-91页
        3.6 A组AKR基因在不结球白菜中克隆分析第91-92页
        3.7 逆境对克隆得到的BrcAKR基因表达趋势与AsA含量相关性的影响第92-95页
    4 讨论第95-97页
第五章 白菜PG和PME基因综合比较分析揭示了其不同进化模式第97-117页
    1 引言第98-99页
    2 材料与方法第99-102页
        2.1 材料第99-100页
        2.2 试验方法第100-102页
    3 结果与分析第102-114页
        3.1 白菜基因组三倍化过程中PG和PME基因拷贝数的变异分析第102-103页
        3.2 白菜基因组中PG和PME复制类型及与拟南芥同源基因Ks值分析第103-104页
        3.3 白菜基因组中PG和PME基因特征分析第104-106页
        3.4 PME基因在植物中的进化模式第106-109页
        3.5 PG基因在植物中的进化历程第109-111页
        3.6 PG和PME基因在分化过程中的选择压力第111-113页
        3.7 PG和PME基因拟南芥和白菜中组织表达分化比较分析第113-114页
    4 讨论第114-117页
第六章 综合比较白菜开花途径相关基因并分析CO-like基因的进化模式第117-139页
    1 引言第118-120页
    2 材料与方法第120-122页
        2.1 材料第120页
        2.2 试验方法第120-122页
    3 结果与分析第122-137页
        3.1 单双子叶中开花相关基因鉴定分析第122-125页
        3.2 白菜COL基因综合比较分析第125-127页
        3.3 COL基因在植物中的起源和进化历程第127-132页
        3.4 十字花科和禾本科植物中CO基因综合比较分析第132-133页
        3.5 生物钟途径调控基因的表达模式分析第133-137页
    4 讨论第137-139页
第七章 白菜MADS-box基因家族全基因组分析鉴定第139-159页
    1 引言第140-142页
    2 材料与方法第142-146页
        2.1 材料第142页
        2.2 试验方法第142-146页
    3 结果与分析第146-156页
        3.1 MADS基因鉴定及比较分析第146-148页
        3.2 MADS基因在白菜基因组中不同保留程度分析第148页
        3.3 白菜MADS基因系统进化比较分析第148-149页
        3.4 白菜MADS基因保守结构域和基因结构分析第149-150页
        3.5 MADS直系同源基因对、染色体分布以及重复基因分析第150-153页
        3.6 白菜MADS基因组织表达分析第153-154页
        3.7 白菜MADS基因在逆境下表达分析第154-156页
    4 讨论第156-159页
第八章 不结球白菜高密度遗传图谱构建及AsA和开花性状的QTL定位分析第159-173页
    1 引言第160-161页
    2 材料与方法第161-164页
        2.1 材料第161页
        2.2 试验方法第161-164页
    3 结果与分析第164-169页
        3.1 全基因组重测序和SNP位点鉴定第164-165页
        3.2 连锁图谱的构建第165-166页
        3.3 连锁图谱与物理图谱的共线关系以及SNP位点注释第166-167页
        3.4 AsA含量和开花时间的调查第167-168页
        3.5 QTL定位分析第168-169页
    4 讨论第169-173页
全文结论第173-175页
创新点第175-177页
参考文献第177-197页
论文发表情况第197-199页
致谢第199页

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