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西鄂尔多斯荒漠灌木根际细菌多样性和群落结构的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-7页
1 引言第12-19页
    1.1 植物根际第12页
    1.2 植物根际微生物多样性第12页
    1.3 微生物多样性研究方法第12-13页
        1.3.1 非分子生物学方法第12-13页
        1.3.2 分子生物学方法第13页
    1.4 植物根际促生菌(PGPR)的研究第13-16页
        1.4.1 PGPR的概念及种类第13-14页
        1.4.2 固氮菌的研究第14-15页
        1.4.3 溶磷菌的研究第15页
        1.4.4 产铁载体菌的研究第15-16页
    1.5 PGPR菌株应用第16-17页
        1.5.1 PGPR菌株与农业第16页
        1.5.2 PGPR与荒漠第16-17页
    1.6 研究区概况第17页
    1.7 研究目的与意义第17-19页
2 材料与方法第19-32页
    2.1 实验材料第19-23页
        2.1.1 样品采集与处理第19页
        2.1.2 主要试剂与试剂盒第19页
        2.1.3 主要仪器第19-20页
        2.1.4 序列分析工具和软件第20页
        2.1.5 培养基配方第20-21页
        2.1.6 主要溶液第21-23页
            2.1.6.1 各理化指标测定试剂第21-22页
            2.1.6.2 CAS检测液的配制第22-23页
            2.1.6.3 植酸酶活测定试剂第23页
        2.1.7 本研究使用的PCR扩增引物第23页
    2.2 实验方法第23-32页
        2.2.1 土壤理化性质的测定第23-26页
            2.2.1.1 含水量的测定第23-24页
            2.2.1.2 pH的测定第24页
            2.2.1.3 速效磷含量的测定第24页
            2.2.1.4 速效氮含量的测定第24-25页
            2.2.1.5 有机质含量的测定第25-26页
        2.2.2 根际细菌多样性及群落结构分析第26-28页
            2.2.2.1 高通量测序第26-27页
            2.2.2.2 微生物群落结构与环境因子的关系第27页
            2.2.2.3 土壤DNA提取第27-28页
            2.2.2.4 实时荧光定量PCR估算细菌丰度第28页
        2.2.3 PGPR的分离筛选及鉴定第28-30页
            2.2.3.1 植物根际固氮细菌、溶磷细菌的分离第28-29页
            2.2.3.2 植物内生固氮菌、溶磷细菌的分离第29页
            2.2.3.3 细菌DNA提取及16S rDNA鉴定第29-30页
        2.2.4 PGPR促生能力分析第30-32页
            2.2.4.1 固氮能力的测定第30页
            2.2.4.2 溶无机磷能力的测定第30页
            2.2.4.3 溶有机磷能力的测定第30-31页
            2.2.4.4 产铁载体能力分析第31-32页
                2.2.4.4.1 产铁载体能力定性分析第31页
                2.2.4.4.2 产铁载体的定量检测第31-32页
3 结果与分析第32-57页
    3.1 根际细菌多样性和群落结构第32-39页
        3.1.1 土壤理化性质第32页
        3.1.2 OTU聚类及多样性指数分析第32-33页
        3.1.3 稀释性曲线第33-34页
        3.1.4 主成分分析第34页
        3.1.5 样品聚类分析第34-35页
        3.1.6 群落结构第35-38页
        3.1.7 环境因子与微生物群落之间关系第38页
        3.1.8 细菌丰度第38-39页
    3.2 PGPR的分离筛选及鉴定第39-50页
        3.2.1 根际及内生固氮细菌的分离与鉴定第40-45页
            3.2.1.1 根际固氮细菌的分离与鉴定第40-44页
            3.2.1.2 内生固氮细菌的分离与鉴定第44-45页
        3.2.2 根际及内生溶磷细菌的分离与鉴定第45-50页
            3.2.2.1 根际溶磷细菌的分离与鉴定第45-48页
            3.2.2.2 内生溶磷细菌的分离与鉴定第48-50页
    3.3 PGPR促生能力分析第50-57页
        3.3.1 固氮能力分析第50-51页
        3.3.2 溶无机磷能力分析第51-52页
            3.3.2.1 磷标准曲线的绘制第51-52页
            3.3.2.2 溶无机磷能力测定第52页
        3.3.3 溶有机磷能力分析第52-54页
            3.3.3.1 磷标准曲线的绘制第52-53页
            3.3.3.2 植酸酶活力测定第53-54页
        3.3.4 产铁载体分析第54-57页
            3.3.4.1 产铁载体细菌的分离筛选第54-55页
            3.3.4.2 细菌产铁载的定量检测第55-57页
4 讨论第57-62页
    4.1 根际细菌多样性和群落结构及其影响因素第57-58页
    4.2 荒漠灌木的PGPR类群及其功能第58-62页
        4.2.1 PGPR类群第58-59页
        4.2.2 PGPR功能第59-62页
            4.2.2.1 固氮菌的固氮活性第59页
            4.2.2.2 溶磷菌的溶无机磷能力第59-60页
            4.2.2.3 溶磷菌的溶有机磷能力第60-61页
            4.2.2.4 固氮菌、溶磷菌的产铁载体能力第61-62页
5 结论第62-64页
致谢第64-65页
参考文献第65-70页
作者简介第70页

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