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基于转录组数据对三系杂交水稻低结实率原因初探

摘要第1-6页
Abstract第6-10页
第一章 文献综述第10-19页
   ·水稻结实率研究进展第10-11页
   ·高温对水稻结实率的影响第11-12页
     ·花粉不育第11-12页
     ·花药开裂出现问题,花粉量不足第12页
     ·花粉活力不足,荫发能力降低第12页
   ·转录组和转录组测序概念解析第12-13页
   ·转录组测序技术进展第13-17页
     ·第一代测序技术第13-14页
     ·第二代测序技术(高通量测序技术)第14-16页
     ·第三代测序技术第16页
     ·三代测序技术比较第16-17页
   ·选题依据及研究的目的和意义第17-19页
第二章 材料与方法第19-27页
   ·实验材料第19页
     ·水稻材料第19页
     ·生化试剂和耗材第19页
     ·转录组测序公司第19页
     ·仪器设备第19页
   ·实验材料的准备第19-21页
   ·花粉育性检测和结实率统计第21页
   ·转录组测序技术路线第21-22页
   ·转录组数据质量检测第22-24页
     ·测序错误率检测第22页
     ·GC含量的检测第22-23页
     ·原始数据组成第23页
     ·表达水平饱和曲线检测第23页
     ·RNA-seq相关性检测第23-24页
   ·差异基因的筛选第24-25页
     ·影响三系水稻结实率的差异基因的筛选第24页
     ·导致三系杂交水稻高温敏感的差异基因的筛选第24-25页
   ·差异基因的GO富集和KEGG代谢通路分析第25页
   ·差异基因的实时荧光定量PCR验证第25-27页
     ·定量引物的设计和筛选第25-26页
     ·qPCR验证第26-27页
第三章 结果与分析第27-48页
   ·各组合常温下花粉育性检查第27-28页
   ·各组合的结实率第28页
   ·RNA的提取和检测第28-29页
   ·转录组数据质量检测结果第29-31页
     ·GC含量分布图分析结果第29-30页
     ·基因表达水平饱和曲线第30-31页
     ·RNA-seq相关性第31页
   ·差异基因筛选结果第31-48页
     ·各组合差异基因分析第31-32页
     ·引起三系杂交水稻结实率较低的差异基因的选择第32-33页
     ·影响三系杂交水稻结实率差异基因的qPCR验证结果第33-43页
     ·引起三系杂交水稻高温条件下结实率降低过快基因的筛选第43-48页
第四章 讨论及后续研究设想第48-51页
   ·讨论第48-49页
     ·转录组测序是快速获得表型相关基因的有效手段第48页
     ·三系不育胞质可能通过调控细胞核基因表达影响三系杂交稻结实率第48-49页
     ·三系杂交稻对高温更敏感第49页
   ·试验小结与后续研究设想第49-51页
     ·试验小结第49页
     ·后续研究设想第49-51页
参考文献第51-55页
致谢第55-56页

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