基于高通量测序的狼和家犬血液转录组研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-17页 |
| ·测序技术的发展 | 第9-11页 |
| ·第一代测序技术 | 第9页 |
| ·第二代测序技术 | 第9-10页 |
| ·第三代测序技术 | 第10-11页 |
| ·转录组与转录组测序技术 | 第11-14页 |
| ·转录组 | 第11页 |
| ·RNA-Seq技术 | 第11-12页 |
| ·RNA-Seq技术的应用 | 第12-14页 |
| ·狼和家犬血液转录组研究 | 第14-17页 |
| ·狼和家犬研究现状 | 第14-15页 |
| ·血液转录组研究现状 | 第15-17页 |
| 第二章 狼和家犬血液总RNA的提取与测序 | 第17-23页 |
| ·材料和试剂 | 第17-18页 |
| ·材料 | 第17页 |
| ·试剂 | 第17-18页 |
| ·实验仪器 | 第18页 |
| ·试验方法 | 第18-23页 |
| ·总RNA的提取 | 第18-20页 |
| ·总RNA的检测 | 第20页 |
| ·文库的构建 | 第20-21页 |
| ·文库库检及上机测序 | 第21页 |
| ·差异表达基因荧光定量PCR验证 | 第21-23页 |
| 第三章 高通量测序数据的处理 | 第23-26页 |
| ·原始数据格式说明 | 第23-24页 |
| ·测序数据的质量评估 | 第24页 |
| ·测序数据的过滤 | 第24页 |
| ·测序数据的比对 | 第24页 |
| ·转录本表达水平的确定 | 第24页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第24页 |
| ·差异表达基因的GO和KEGG富集分析 | 第24-26页 |
| 第四章 实验结果与分析 | 第26-42页 |
| ·总RNA的检测结果 | 第26-27页 |
| ·转录组测序结果 | 第27页 |
| ·测序数据的质量评估结果 | 第27-30页 |
| ·测序错误率分布检查 | 第27-28页 |
| ·A/T/G/C含量分布检查 | 第28-29页 |
| ·测序数据的过滤 | 第29-30页 |
| ·测序数据的比对分析 | 第30-33页 |
| ·序列在基因组不同区域分布情况的统计 | 第30-32页 |
| ·序列在基因组上覆盖的检测 | 第32-33页 |
| ·转录本的组装 | 第33页 |
| ·转录本表达水平的分析 | 第33-35页 |
| ·转录本表达水平的相关性分析 | 第33-34页 |
| ·转录本表达水平比对 | 第34-35页 |
| ·转录本表达水平 | 第35页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第35-37页 |
| ·差异表达基因GO分析 | 第37-39页 |
| ·差异表达基因KEGG分析 | 第39-41页 |
| ·差异表达基因荧光定量PCR验证 | 第41-42页 |
| 第五章 讨论 | 第42-44页 |
| 第六章 本文的创新之处与展望 | 第44-45页 |
| ·本文的创新之处 | 第44页 |
| ·展望 | 第44-45页 |
| 参考文献 | 第45-51页 |
| 在校期间发表的学术论文 | 第51-52页 |
| 致谢 | 第52-53页 |
| 附录 | 第53-61页 |
