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胃癌细胞和肝癌细胞适配子的筛选以及临床应用

中文摘要第1-8页
Abstract第8-19页
第一章 引言第19-36页
   ·癌症的形成第19-20页
   ·胃癌的研究现状第20-21页
   ·肝癌的研究现状第21-22页
   ·指数富集配体系统进化(SELEX)技术第22-26页
     ·SELEX技术的基本原理与流程第22-23页
     ·SELEX筛选技术的特点第23-25页
     ·SELEX技术的应用第25-26页
       ·SELEX技术在基础研究方面的应用第25页
       ·SELEX技术在临床方面的应用第25-26页
       ·SELEX技术在药物筛选方面的应用第26页
   ·适配子(aptamer)第26-30页
     ·适配子的定义第26-27页
     ·细胞筛选技术(cell-SELEX)第27-28页
     ·cell-SELEX技术的临床应用第28-29页
       ·肿瘤特异性地诊断第28-29页
       ·靶向性地治疗肿瘤第29页
       ·肿瘤标志物的筛选第29页
     ·适配子的改造第29-30页
   ·适配子筛选中常用的分离方法第30-32页
     ·毛细管电泳(CE-SELEX)第30页
     ·磁珠和亲和色谱第30-31页
     ·纤维素膜分离第31页
     ·微流控用于SELEX筛选第31-32页
     ·SELEX筛选中使用的其它方法第32页
   ·CELL-SELEX筛选中常用的分析及检测手段第32-35页
     ·激光共聚焦显微镜第32-33页
     ·流式细胞术第33页
     ·免疫组化与免疫荧光第33-35页
   ·本研究的临床意义第35-36页
第二章 SELEX筛选的PCR条件优化第36-44页
   ·材料与方法第36-40页
     ·实验试剂第36页
     ·实验材料第36页
     ·主要溶液的配制第36-37页
     ·实验仪器第37-38页
     ·实验方法第38-40页
       ·引物设计的原则第38页
       ·凝胶电泳和EB染色第38-39页
       ·优化对称PCR扩增的条件第39页
       ·不对称PCR扩增条件优化第39-40页
   ·结果第40-42页
     ·对称PCR扩增的优化结果第40-41页
     ·不对称PCR扩增优化的结果第41-42页
   ·讨论第42-44页
第三章 胃癌细胞适配子的筛选第44-66页
   ·材料与方法第44-45页
     ·实验试剂与材料第44页
     ·主要溶液的配制第44-45页
     ·主要的仪器第45页
   ·实验方法第45-46页
     ·细胞培养第45-46页
       ·复苏细胞第45-46页
       ·细胞传代第46页
       ·冻存第46页
   ·胃癌细胞适配子筛选第46-51页
     ·适配子筛选条件的优化第46页
     ·SGC7901胃癌细胞筛选第46-51页
       ·准备SGC7901胃癌细胞第46页
       ·文库的准备第46-47页
       ·结合反应第47页
       ·细胞收集与洗涤第47页
       ·收集结合的文库及文库的定量第47页
       ·反筛过程的加入第47页
       ·纯化结合的ssDNA第47-48页
       ·对称PCR扩增结合ssDNA第48页
       ·dsDNA回收及定量第48-49页
       ·不对称PCR扩增ssDNA第49页
       ·纯化ssDNA第49-50页
       ·用人的胃黏膜细胞GES-1细胞进行反筛第50页
       ·流式细胞术实验和共聚焦显微镜监测文库的富集第50页
       ·用碱性磷酸酶反应试剂盒检测文库与SGC7901胃癌细胞的亲和力第50-51页
   ·克隆测序及二级结构分析第51-53页
     ·对称PCR扩增第51页
     ·用T-A试剂盒连pUC-T载体第51-52页
       ·PCR产物与质粒连接第51-52页
       ·连接产物的转化第52页
       ·连接产物的鉴定第52页
     ·挑取克隆及质粒扩增第52-53页
     ·流式细胞术实验确定克隆的结合力第53页
     ·克隆及测序第53页
   ·结果与讨论第53-66页
     ·适配子筛选条件的优化结果第53-54页
     ·荧光标记的文库的扩增第54-55页
     ·流式细胞术实验监测文库的富集第55-57页
     ·共聚焦实验监测文库的富集第57-59页
     ·Digxon-标记的文库的扩增第59页
     ·碱性磷酸酶测定文库与SGC7901细胞的结合力第59-60页
     ·克隆及测序第60-66页
       ·PCR鉴定克隆第60-61页
       ·流式细胞术实验测定单克隆与靶细胞的结合力第61页
       ·测序第61-62页
       ·适配子的二级结构分析第62-66页
第四章 胃癌细胞单一适配子的特异性鉴定第66-77页
   ·细胞培养第66页
   ·截短适配子的序列及二级结构第66-71页
     ·截短适配子的序列第66-67页
     ·截短适配子的二级结构第67-70页
     ·截短适配子的亲和力测定第70-71页
     ·截短适配子的特异性分析第71页
   ·结果与讨论第71-76页
     ·截短适配子的亲和力第71-73页
     ·截短适配子的特异性分析第73-76页
       ·流式细胞术分析适配子的特异性第73-74页
       ·共聚焦实验分析适配子的特异性第74-76页
   ·本章讨论第76-77页
第五章 胃癌适配子临床应用的初步研究第77-95页
   ·引言第77-80页
     ·适配子用于传感器(aptasensor)第77-80页
       ·电化学适配子传感器(Electrochemical Aptasensor)第78页
       ·荧光光学适配子传感器(Fluorescence-Based Optical Aptasensor)第78-79页
       ·适配子比色法光学传感器(Colorimetric-Based Optical Aptasensor)第79页
       ·其它的适配子传感器第79-80页
   ·适配子在临床上的的应用第80-82页
     ·治疗疾病第80页
     ·药物运输系统第80-81页
     ·生物成像第81-82页
   ·胃癌适配子的临床应用之一—组织实验第82页
     ·组织准备第82页
     ·免疫组化实验第82页
   ·胃癌适配子的临床应用之二—肿瘤细胞的俘获与释放第82-83页
     ·构建适配子-量子点磁纳米微球(FMNS)的检测平台第82-83页
     ·适配子-量子点磁纳米微球俘获与释放癌细胞第83页
       ·适配子-量子点磁纳米微球俘获癌细胞第83页
       ·适配子-量子点磁纳米微球释放癌细胞第83页
   ·适配子的结合靶标的初步研究第83-84页
   ·适配子靶标的分离与确定第84页
   ·胃癌适配子的临床应用之三—荧光探针第84-87页
     ·适配子荧光探针的设计第84-86页
     ·靶细胞激活适配子荧光探针第86页
     ·适配子荧光探针在小鼠体内成像第86-87页
   ·结果与讨论第87-94页
     ·免疫组化实验结果—胃癌细胞适配子与组织的结合第87-88页
     ·适配子结合靶标的初步确定第88页
     ·适配子结合靶标的分离与确定第88-90页
     ·适配子俘获与释放癌细胞第90-92页
       ·适配子-磁纳米微球的表征第90页
       ·适配子俘获与释放胃癌细胞第90-92页
     ·适配子荧光探针检测癌细胞的体内与体外研究第92-93页
       ·靶细胞激活适配子荧光探针第92页
       ·适配子体内检测癌细胞第92-93页
     ·适配子荧光探针在小鼠体内成像第93-94页
   ·本章小结第94-95页
第六章 肝癌细胞适配子的筛选第95-130页
   ·材料与方法第95-96页
     ·实验试剂与材料第95页
     ·主要的仪器第95页
     ·细胞培养第95-96页
   ·肝癌细胞适配子的筛选第96-97页
     ·流式细胞术实验和共聚焦显微镜监测文库的富集第96-97页
     ·克隆测序及二级结构分析第97页
     ·肝癌单一适配子结合力的测定第97页
     ·截短适配子的特异性分析第97页
   ·适配子的临床应用的初步研究第97-98页
   ·适配子结构改造极其结合力的测定第98页
     ·适配子的结构改造第98页
     ·结构改造后的适配子的结合力的测定第98页
     ·结构改造后的适配子与L-02人正常肝细胞的结合力的测定第98页
   ·结果与讨论第98-107页
     ·流式细胞术实验检测文库的富集第98-99页
     ·共聚焦实验监测文库的富集第99-100页
     ·克隆、测序第100页
     ·测序第100-107页
       ·克隆的测序结果第100-101页
       ·肝癌适配子二级结构模拟第101-102页
       ·肝癌适配子序列的截短第102-103页
       ·截短的肝癌适配子序列的二级结构模拟第103-107页
   ·肝癌细胞截短后的单一适配子结合力的测定第107-111页
   ·肝癌细胞适配子的特异性检测第111-122页
     ·共聚焦显微镜分析适配子的特异性第111-115页
     ·流式细胞术分析适配子的特异性第115-121页
       ·各条适配子与Huh7.5.1肝癌细胞的结合情况第115页
       ·各条适配子与HepG2肝癌细胞的结合情况第115-116页
       ·各条适配子与97L肝癌细胞的结合情况第116-117页
       ·各条适配子与LM9肝癌细胞的结合情况第117页
       ·各条适配子与HeLa宫颈癌细胞的结合情况第117-118页
       ·各条适配子与HT29胰腺癌细胞的结合情况第118-119页
       ·各条适配子与GES-1胃黏膜细胞的结合情况第119页
       ·各条适配子与Hs578Bst人乳腺上皮细胞的结合情况第119-120页
       ·各条适配子与L-02人正常肝细胞的结合情况第120-121页
     ·小结与讨论第121-122页
   ·肝癌适配子的临床应用的初步研究第122-125页
     ·适配子与人的肝癌组织结合第122-124页
     ·适配子与人的正常肝组织结合第124-125页
   ·适配子的碱基修饰第125-126页
   ·碱基修饰的适配子的结合力的测定第126-128页
     ·碱基修饰后的适配子序列与Huh7.5.1靶肝癌细胞的结合能力测定第126-128页
     ·碱基修饰后的适配子序列与L-02正常细胞的结合能力测定第128页
   ·小结第128-130页
参考文献第130-149页
全文总结第149-152页
致谢第152-153页
附录第153-178页

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