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酵母对纤维素乙醇生产中的抑制剂响应的系统生物学研究

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-10页
前言第10-12页
第一章 文献综述第12-24页
   ·纤维素乙醇第12-17页
     ·纤维素乙醇的意义第12-13页
     ·纤维素乙醇生产工艺第13-17页
   ·纤维素乙醇生产中的抑制剂第17-20页
     ·抑制剂的产生及其毒性第17-18页
     ·水解液的脱毒第18-19页
     ·抑制剂的原位脱毒第19-20页
   ·乙醇的耐受第20-21页
     ·乙醇的毒性第20页
     ·乙醇耐受性研究进展第20-21页
   ·系统生物技术第21-22页
     ·系统生物技术的简介第21页
     ·系统生物技术的优势第21-22页
   ·本课题的研究意义和主要内容第22-24页
     ·研究意义第22-23页
     ·主要内容第23-24页
第二章 酿酒酵母对糠醛和醋酸的响应转录组学研究第24-50页
   ·引言第24-25页
   ·材料与方法第25-34页
     ·菌株第25页
     ·溶液与培养基配制第25-26页
     ·菌种培养第26页
     ·RNA的提取、反转录与标记第26-30页
     ·杂交与扫描第30-32页
     ·数据处理第32页
     ·定量实时PCR验证第32-34页
   ·结果第34-46页
     ·糠醛和醋酸对生长的影响第34页
     ·酿酒酵母的转录组水平响应第34-36页
     ·对糠醛响应中表达显著下调的基因第36-38页
     ·对糠醛响应中表达显著上调的基因第38-40页
     ·醋酸响应中表达显著下调的基因第40-43页
     ·对醋酸响应中表达显著上调的基因第43-44页
     ·定量实时反转录PCR验证第44-46页
   ·讨论第46-48页
   ·小结第48-50页
第三章 糠醛和醋酸耐受菌株和原始菌株的比较转录组学研究第50-66页
   ·引言第50页
   ·材料与方法第50-51页
     ·培养基第50-51页
     ·菌株及其培养方法第51页
     ·RNA提取和芯片检测第51页
     ·数据处理第51页
   ·结果与讨论第51-64页
     ·耐受菌株中的差异基因概述第51-52页
     ·糠醛耐受菌株表达下调基因第52-55页
     ·糠醛耐受菌株高表达基因第55-57页
     ·醋酸耐受菌株中低表达的基因第57-61页
     ·醋酸耐受菌株中高表达的基因第61-64页
   ·小结第64-66页
第四章 乙醇对单双倍体酵母转录组影响的研究第66-86页
   ·引言第66-67页
   ·材料与方法第67-69页
     ·菌株与培养基第67页
     ·微生物培养及实验设计第67-68页
     ·菌株乙醇耐受性实验第68页
     ·RNA提取及芯片杂交第68页
     ·数据分析第68页
     ·定量实时PCR验证第68页
     ·发酵液成分测定第68-69页
   ·结果与讨论第69-83页
     ·乙醇对酵母菌生长的抑制作用第69页
     ·转录表达谱差异概述第69-73页
     ·乙醇诱导与转录和翻译功能有关的基因的表达第73页
     ·乙醇诱导与脂类和脂肪酸合成的调控功能有关的基因的表达第73-75页
     ·乙醇诱导与氨基酸和嘌呤合成有关的基因的表达第75-78页
     ·乙醇抑制与辅因子合成有关的基因的表达第78-80页
     ·同源二倍体和单倍体的差异表达基因第80-83页
     ·菌株乙醇刺激和乙醇适应后的基因表达差异的比较第83页
   ·小结第83-86页
第五章 乙醇对单双倍体酵母影响的代谢物组学研究第86-100页
   ·引言第86-87页
   ·材料与方法第87-89页
     ·菌株与培养基第87页
     ·实验设计第87页
     ·小分子代谢物提取第87页
     ·GC-TOF-MS检测第87-88页
     ·数据分析第88-89页
   ·结果第89-95页
     ·代谢物图谱概述和多元统计分析第89-92页
     ·乙醇存在下单双倍体的代谢差异第92-94页
     ·乙醇胁迫保护剂第94-95页
   ·讨论第95-98页
     ·单双倍体碳氮代谢差异第95-96页
     ·单双倍体中乙醇耐受性的差异第96-98页
   ·小结第98-100页
第六章 乙醇对单双倍体酵母影响的蛋白组学研究第100-116页
   ·引言第100页
   ·材料与方法第100-104页
     ·菌株与培养基第100页
     ·试验设计第100页
     ·蛋白质提取和二维凝胶电泳第100-103页
     ·二维凝胶电泳分析第103页
     ·蛋白的质谱鉴定第103-104页
   ·结果第104-111页
     ·单双倍体酵母的蛋白质组图谱第104-106页
     ·蛋白质折叠、胁迫响应和氧化还原酶活性相关蛋白的变化第106-108页
     ·与核苷酸和有机酸代谢相关的蛋白的变化第108-109页
     ·与单糖代谢和碳水化合物及乙醇生物合成过程相关蛋白的变化第109-111页
   ·讨论第111-114页
   ·小结第114-116页
第七章 结论与展望第116-119页
   ·结论第116-117页
   ·展望第117-118页
   ·创新点第118-119页
参考文献第119-130页
发表论文和参加科研情况说明第130-132页
致谢第132页

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