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基于高通量测序的中国甜柿microRNAs鉴定及分析

目录第1-6页
摘要第6-7页
Abstract第7-9页
缩略词表第9-10页
1 前言第10-19页
   ·课题的提出第10页
   ·前人研究进展第10-19页
     ·中国甜柿及其分类学地位第10-11页
     ·中国甜柿单宁成分第11-12页
     ·柿单宁前体生物合成、转运与聚合途径第12-15页
     ·中国甜柿自然脱涩机理第15-16页
     ·基于miRNA的转录后调控途径第16-19页
       ·miRNA概念和分布第16页
       ·miRNA生物合成和作用机制第16-17页
       ·高通量测序技术在植物miRNA鉴定中的应用第17-18页
       ·植物miRNA与PAs生物合成调控第18-19页
   ·研究内容与目的第19页
2 材料与方法第19-26页
   ·试材与取样第19页
   ·试剂与仪器第19-20页
     ·主要试剂盒第19页
     ·其他主要试剂第19-20页
     ·克隆载体及宿主菌株第20页
     ·主要仪器设备第20页
   ·实验方法第20-26页
     ·柿单宁含量测定第20-21页
       ·印迹法与品尝法判断单宁含量第20页
       ·Folin-Ciocalteu法测定单宁含量第20-21页
     ·文库建立及测序第21页
     ·测序数据基本生物信息学分析第21页
     ·已知miRNA鉴定与novel miRNA预测第21-22页
     ·Novel miRNA筛选与验证第22-24页
       ·总RNA提取与反转录第22-23页
       ·Novel miRNA PCR扩增第23页
       ·Novel miRNA扩增片段回收与连接载体第23-24页
       ·Novel miRNA重组子转化大肠杆菌第24页
       ·阳性克隆片段筛选与测序第24页
     ·差异表达miRNA分析第24页
     ·靶基因预测及GO功能注释第24-25页
     ·差异表达miRNA qRT-PCR验证第25-26页
3 结果与分析第26-40页
   ·不同脱涩类型果实发育过程中单宁含量变化动态第26-29页
   ·sRNA测序数据分析第29-31页
   ·中国甜柿conserved miRNA鉴定第31-33页
   ·中国甜柿novel miRNA预测第33页
   ·miRNA差异表达分析第33页
   ·差异表达miRNA靶基因预测与GO功能注释第33-36页
   ·与单宁累积和自然脱涩相关miRNA表达分析第36-38页
   ·miRNA靶基因表达验证第38页
   ·差异表达miRNA qRT-PCR分析第38-40页
4 讨论第40-44页
   ·柿miRNA鉴定及其靶基因预测第40-42页
   ·与中国甜柿单宁合成和与自然脱涩脱涩相关miRNA第42-44页
参考文献第44-51页
附录Ⅰ miRNAs实时定量引物序列第51-52页
附录Ⅱ 新miRNA鉴定第52-57页
附录Ⅲ 差异表达miRNA与靶基因GO注释第57-59页
作者简历及在校期间的科研实践第59-60页
致谢第60-61页

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