| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-14页 |
| ·蛋白质网络 | 第9-10页 |
| ·本课题研究的意义 | 第10-11页 |
| ·本文的主要研究内容 | 第11-12页 |
| ·本文的组织结构 | 第12-14页 |
| 2 融合蛋白质网络和基因表达数据的蛋白质复合物识别算法 | 第14-24页 |
| ·种子节点的计算与选取 | 第14-16页 |
| ·非交叠蛋白质复合物识别算法IPCIPG-n | 第16-17页 |
| ·交叠蛋白质复合物识别算法IPCIPG-o | 第17-19页 |
| ·实验结果与分析 | 第19-23页 |
| ·实验数据集 | 第19页 |
| ·与已知蛋白质复合物比较 | 第19-21页 |
| ·功能富集分析 | 第21-23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 3 面向动态蛋白质网络中复合物及功能模块识别算法 | 第24-41页 |
| ·蛋白质复合物以及功能模块的识别模型 | 第24-26页 |
| ·蛋白质复合物识别算法 | 第26-28页 |
| ·功能模块识别算法 | 第28-31页 |
| ·实验结果与分析 | 第31-39页 |
| ·蛋白质复合物评估 | 第31-36页 |
| ·功能模块评估 | 第36-37页 |
| ·参数th的影响分析 | 第37-38页 |
| ·蛋白质复合物与功能模块之间的关系 | 第38-39页 |
| ·本章小结 | 第39-41页 |
| 4 基于蛋白质功能层次性的聚类评估方法hF-measure | 第41-54页 |
| ·常用评估方法 | 第41-43页 |
| ·基于蛋白质功能层次结构特性评估方法hF-measure | 第43-47页 |
| ·基于蛋白质功能层次结构的功能相似性定义 | 第43-45页 |
| ·蛋白质复合物拓扑无关评估方法:hF-measure~(Tf) | 第45-46页 |
| ·蛋白质复合物拓扑相关评估方法：hF-measure~(Tb) | 第46-47页 |
| ·含功能未知蛋白质的情况分析 | 第47页 |
| ·实验结果与分析 | 第47-52页 |
| ·区分复合物中不同的错误分组 | 第47-50页 |
| ·蛋白质复合物的拓扑变化分析 | 第50页 |
| ·基于聚类算法分析结果的评估 | 第50-51页 |
| ·包含功能未知蛋白质的复合物评估 | 第51-52页 |
| ·本章小结 | 第52-54页 |
| 5 蛋白质网络聚类算法分析及评估可视化平台的设计与实现 | 第54-61页 |
| ·系统原理及总体结构 | 第54-55页 |
| ·聚类算法及评估方法 | 第55-57页 |
| ·系统聚类分析及评估 | 第57-60页 |
| ·聚类分析可视化 | 第57-58页 |
| ·聚类算法评估 | 第58-60页 |
| ·本章小结 | 第60-61页 |
| 6 总结 | 第61-64页 |
| ·主要贡献和创新 | 第61-62页 |
| ·展望 | 第62-64页 |
| 参考文献 | 第64-70页 |
| 攻读硕士学位期间主要研究成果 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |
