目录 | 第1-6页 |
缩略词表 | 第6-8页 |
摘要 | 第8-10页 |
Abstract | 第10-13页 |
前言 | 第13-30页 |
一、MicroRNA研究概况 | 第13-17页 |
二、MicroRNA与病毒 | 第17-22页 |
三、MicroRNA的研究方法 | 第22-29页 |
四、本研究的目的与意义 | 第29-30页 |
第一部分 甲型肝炎病毒编码microRNAs分子的生物信息学预测及分析 | 第30-59页 |
引言 | 第30页 |
一、HAV基因组RNA及负链RNA编码miRNA分子的理论分析及机制猜想 | 第30-32页 |
二、VMir软件和预测方法 | 第32-36页 |
(一)、VMir软件 | 第32-34页 |
(二)、预测方法 | 第34-36页 |
三、结果与分析 | 第36-55页 |
(一)、HAV基因组及(-)RNA中存在pre-miRNA茎环结构 | 第36-42页 |
(一)、HAV基因组及(-)RNA中存在成熟miRNA分子 | 第42-55页 |
四、讨论 | 第55-58页 |
五、第一部分小结 | 第58-59页 |
第二部分 甲型肝炎病毒编码microRNAs分子的克隆和生物学特征鉴定 | 第59-123页 |
引言 | 第59页 |
一、实验材料与方法 | 第59-93页 |
(一)、实验材料 | 第59-64页 |
(二)、实验方法 | 第64-93页 |
二、结果与分析 | 第93-117页 |
(一)、生物信息学预测miRNAs的克隆及测序验证 | 第93-100页 |
(二)、Northem blot检测不到HAV编码的miRNAs分子 | 第100-101页 |
(三)、poly(A)-tailed RT-PCR能特异性检测到HAV编码的miRNAs分子 | 第101-102页 |
(四)、克隆鉴定的miRNA分子由预测的茎环结构前体分子剪切而来 | 第102-110页 |
(五)、HAV编码miRNAs依赖Drosha、Dicer和AG02但不依赖Exportin-5 | 第110-115页 |
(六)、HAV编码的miRNAs分子具有PTGS功能活性 | 第115-116页 |
(七)、HAV编码的miRNAs时序性表达分析 | 第116-117页 |
三、讨论 | 第117-121页 |
四、第二部分小结 | 第121-123页 |
第三部分 甲型肝炎病毒编码microRNAs分子的作用及作用机制研究 | 第123-167页 |
引言 | 第123-124页 |
一、实验材料与方法 | 第124-140页 |
(一)、实验材料 | 第124页 |
(二)、实验方法 | 第124-140页 |
二、结果与分析 | 第140-162页 |
(一)、HAV编码miRNAs分子的靶基因预测 | 第140页 |
(二)、靶基因野生型和突变型表达质粒的鉴定 | 第140-147页 |
(三)、miRNAs对HAV(±)RNA链中的靶基因片段具有极强的抑制效应 | 第147-148页 |
(四)、miRNAs在HAV(±)RNA链中靶位点处亚基因组检测序列的确定 | 第148-153页 |
(五)、miRNAs靶基因的qRT-PCR定量扩增曲线和融解曲线分析 | 第153-154页 |
(六)、上调miRNAs能显著降低靶HAV亚基因组RNA水平 | 第154-155页 |
(七)、下调miRNAs能显著提高靶HAV亚基因组RNA水平 | 第155-156页 |
(八)、上调miRNAs强烈抑制了HAV病毒基因组RNA的复制 | 第156-159页 |
(九)、下调miRNAs显著促进了HAV病毒基因组RNA的复制 | 第159-162页 |
三、讨论 | 第162-166页 |
四、第三部分小结 | 第166-167页 |
全文小结 | 第167-169页 |
HAV编码miRNA分子通过降解病毒基因组抑制病毒复制的模型 | 第169页 |
参考文献 | 第169-178页 |
论文综述 | 第178-189页 |
参考文献 | 第185-189页 |
附录Ⅰ 主要溶液的配制 | 第189-191页 |
附录Ⅱ 主要试剂盒操作步骤 | 第191-195页 |
致谢 | 第195-196页 |
个人简历与研究成果 | 第196页 |