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甲型肝炎病毒编码microRNAs分子的预测、鉴定及功能研究

目录第1-6页
缩略词表第6-8页
摘要第8-10页
Abstract第10-13页
前言第13-30页
 一、MicroRNA研究概况第13-17页
 二、MicroRNA与病毒第17-22页
 三、MicroRNA的研究方法第22-29页
 四、本研究的目的与意义第29-30页
第一部分 甲型肝炎病毒编码microRNAs分子的生物信息学预测及分析第30-59页
 引言第30页
 一、HAV基因组RNA及负链RNA编码miRNA分子的理论分析及机制猜想第30-32页
 二、VMir软件和预测方法第32-36页
  (一)、VMir软件第32-34页
  (二)、预测方法第34-36页
 三、结果与分析第36-55页
  (一)、HAV基因组及(-)RNA中存在pre-miRNA茎环结构第36-42页
  (一)、HAV基因组及(-)RNA中存在成熟miRNA分子第42-55页
 四、讨论第55-58页
 五、第一部分小结第58-59页
第二部分 甲型肝炎病毒编码microRNAs分子的克隆和生物学特征鉴定第59-123页
 引言第59页
 一、实验材料与方法第59-93页
  (一)、实验材料第59-64页
  (二)、实验方法第64-93页
 二、结果与分析第93-117页
  (一)、生物信息学预测miRNAs的克隆及测序验证第93-100页
  (二)、Northem blot检测不到HAV编码的miRNAs分子第100-101页
  (三)、poly(A)-tailed RT-PCR能特异性检测到HAV编码的miRNAs分子第101-102页
  (四)、克隆鉴定的miRNA分子由预测的茎环结构前体分子剪切而来第102-110页
  (五)、HAV编码miRNAs依赖Drosha、Dicer和AG02但不依赖Exportin-5第110-115页
  (六)、HAV编码的miRNAs分子具有PTGS功能活性第115-116页
  (七)、HAV编码的miRNAs时序性表达分析第116-117页
 三、讨论第117-121页
 四、第二部分小结第121-123页
第三部分 甲型肝炎病毒编码microRNAs分子的作用及作用机制研究第123-167页
 引言第123-124页
 一、实验材料与方法第124-140页
  (一)、实验材料第124页
  (二)、实验方法第124-140页
 二、结果与分析第140-162页
  (一)、HAV编码miRNAs分子的靶基因预测第140页
  (二)、靶基因野生型和突变型表达质粒的鉴定第140-147页
  (三)、miRNAs对HAV(±)RNA链中的靶基因片段具有极强的抑制效应第147-148页
  (四)、miRNAs在HAV(±)RNA链中靶位点处亚基因组检测序列的确定第148-153页
  (五)、miRNAs靶基因的qRT-PCR定量扩增曲线和融解曲线分析第153-154页
  (六)、上调miRNAs能显著降低靶HAV亚基因组RNA水平第154-155页
  (七)、下调miRNAs能显著提高靶HAV亚基因组RNA水平第155-156页
  (八)、上调miRNAs强烈抑制了HAV病毒基因组RNA的复制第156-159页
  (九)、下调miRNAs显著促进了HAV病毒基因组RNA的复制第159-162页
 三、讨论第162-166页
 四、第三部分小结第166-167页
全文小结第167-169页
HAV编码miRNA分子通过降解病毒基因组抑制病毒复制的模型第169页
参考文献第169-178页
论文综述第178-189页
 参考文献第185-189页
附录Ⅰ 主要溶液的配制第189-191页
附录Ⅱ 主要试剂盒操作步骤第191-195页
致谢第195-196页
个人简历与研究成果第196页

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