| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| ·研究背景与意义 | 第10-16页 |
| ·生物信息学和进化论背景 | 第13-15页 |
| ·程序设计和反射计算背景 | 第15-16页 |
| ·仿真和计算机模拟技术背景 | 第16页 |
| ·本论文的主要内容和创新点 | 第16-18页 |
| ·本论文的组织结构 | 第18-20页 |
| 第二章 程序视角下的细胞结构和细胞分裂 | 第20-27页 |
| ·细胞结构组成 | 第20页 |
| ·细胞分裂 | 第20-24页 |
| ·细胞分裂和基因工程的研究现状和局限性 | 第24-25页 |
| ·细胞功能表达的程序性解释 | 第25-26页 |
| ·本章总结 | 第26-27页 |
| 第三章 指令和程序的新解读以及Java程序运行原理 | 第27-47页 |
| ·指令、程序和进程的一般化定义 | 第27-33页 |
| ·计算机程序和生命程序的异同点 | 第33-35页 |
| ·程序设计和程序设计语言 | 第35-39页 |
| ·程序设计的概念和程序的构造过程 | 第35-37页 |
| ·面向对象程序设计方法和语言 | 第37-39页 |
| ·Java语言和JVM工作原理 | 第39-45页 |
| ·Java虚拟机 | 第39-40页 |
| ·类装载器 | 第40-41页 |
| ·字节码文件 | 第41-45页 |
| ·Java语言中程序的动态生成和编译技术 | 第45页 |
| ·本章总结 | 第45-47页 |
| 第四章 反射计算技术和生物反射的程序模拟 | 第47-62页 |
| ·生物学中的反射概念 | 第47-49页 |
| ·计算机领域中的反射概念和反射程序设计技术 | 第49-54页 |
| ·运行时动态反射技术 | 第50-52页 |
| ·运行前静态反射技术 | 第52-54页 |
| ·当前反射计算的研究现状 | 第54页 |
| ·一种统一的反射定义和程序设计技术 | 第54-56页 |
| ·用计算机程序模拟生物的非条件反射和条件反射 | 第56-61页 |
| ·非条件反射模拟 | 第56-58页 |
| ·条件反射模拟 | 第58-61页 |
| ·本章总结 | 第61-62页 |
| 第五章 细胞功能表达的计算机程序模拟 | 第62-67页 |
| ·生命程序和计算机程序的相似性分析 | 第62-63页 |
| ·基因类和染色体类抽象 | 第63-64页 |
| ·细胞类抽象和细胞功能表达的程序解释 | 第64-66页 |
| ·本章总结 | 第66-67页 |
| 第六章 细胞分裂与分化的计算机程序模拟 | 第67-77页 |
| ·对细胞的进一步建模分析 | 第67-68页 |
| ·对基因类和染色体类进一步分析 | 第68-69页 |
| ·其它辅助类抽象和类图 | 第69-70页 |
| ·细胞分裂与分化程序模型解释 | 第70-76页 |
| ·本章总结 | 第76-77页 |
| 第七章 生命进化原理及计算机程序模拟 | 第77-91页 |
| ·拉马克进化理论 | 第78-79页 |
| ·达尔文进化理论 | 第79页 |
| ·拉马克进化理论和达尔文进化理论比较 | 第79-80页 |
| ·生命进化的程序性解释 | 第80-82页 |
| ·生命进化的计算机程序模拟 | 第82-90页 |
| ·拉马克进化机制模拟 | 第83-85页 |
| ·达尔文进化机制模拟 | 第85-88页 |
| ·统一的进化程序模型 | 第88-90页 |
| ·本章总结 | 第90-91页 |
| 第八章 数学模型抽象及相关问题的逻辑分析和解释 | 第91-101页 |
| ·细胞分裂的数学模型抽象 | 第91-94页 |
| ·基因组进化的数学模型抽象 | 第94-97页 |
| ·C值佯谬问题和N值佯谬问题解释 | 第97-98页 |
| ·外显子、内含子及假基因的解释 | 第98-100页 |
| ·本章总结 | 第100-101页 |
| 第九章 总结和展望 | 第101-105页 |
| ·总结 | 第101-103页 |
| ·未来的思考及展望 | 第103-105页 |
| 参考文献 | 第105-109页 |
| 附录1 本文中的代码列表 | 第109-139页 |
| 附录2 部分大插图 | 第139-142页 |
| 附录3 细胞分裂程序模型的部分输出结果 | 第142-146页 |
| 在学期间的科研成果 | 第146-147页 |
| 致谢 | 第147页 |