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低能离子诱导玉米Mu转座子激活及DNA甲基化表观遗传机制的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-11页
引言第11-13页
第一章 文献综述第13-38页
     ·低能离子注入在生物体中的研究第13-14页
     ·低能离子生物学的发展第13页
     ·低能离子注入的生物学效应第13-14页
     ·离子束生物工程第14页
   ·植物转座子分子生物学研究进展第14-21页
     ·植物转座子的概念第14-15页
     ·植物转座子的类型及其结构第15-16页
     ·植物转座子的转座途径第16-17页
     ·植物转座子在基因组进化的作用第17-18页
     ·植物转座子的应用第18-19页
     ·玉米 Mu转座子及其特点第19-21页
   ·与植物转座子活性相关的 DN A 甲基化调控研究进展第21-31页
     ·植物DNA甲基化作用第21-22页
     ·植物DNA甲基化转移酶的种类第22页
     ·植物DNA甲基化的生物学功能第22-24页
     ·植物DNA甲基化对转座子的调控作用第24页
     ·植物RNA 介导的DNA甲基化调控机制第24-31页
   ·生物信息学在发掘植物重要功能基因上的应用第31-34页
     ·生物信息学研究内容第31页
     ·生物信息学数据库服务系统及软件应用第31-34页
   ·本课题研究的背景、目的和意义第34-37页
   ·本课题研究的技术路线第37-38页
第二章 低能离子束诱导玉米 Mu转座子活性变异分析第38-49页
   ·实验材料第38-39页
     ·植物材料第38-39页
     ·试剂第39页
   ·主要仪器设备第39-40页
   ·研究方法第40-41页
     ·植物材料的低能氮离子束处理第40页
     ·玉米 MuDR 种质花粉的体外萌发第40页
     ·玉米 MuDR 种质花粉的田间授粉及遗传杂交试验第40页
     ·玉米 Mu转座子活性变异的效应分析第40页
     ·玉米 Mu转座活性变异的稳定性检测第40页
     ·低能离子束诱导玉米花粉 Mu活性变异有效参数筛选第40-41页
     ·玉米 Mu转座子活性变异突变体筛选第41页
   ·结果与分析第41-47页
     ·玉米 MuDR 种质的花粉的体外萌发实验第41-42页
     ·低能 N~+离子束注入对玉米 Mu转座子的激活效应第42-43页
     ·低能 N~+离子束注入诱导玉米 Mu转座活性变异的稳定性检测第43-46页
     ·低能 N~+离子束注入诱导玉米 Mu转座活性变异有效参数筛选第46页
     ·低能 N~+离子束注入诱导玉米 Mu转座突变体筛选第46-47页
   ·讨论第47-49页
第三章 玉米 Mu转座子突变体的转座特点及表达水平分析第49-60页
   ·实验材料第49-50页
     ·植物材料第49页
     ·菌株和载体第49页
     ·酶及试剂第49页
     ·引物合成和测序第49-50页
   ·主要仪器设备第50页
   ·研究方法第50-56页
     ·玉米基因组DNA的提取( CTAB 法)第50-51页
     ·Southern 杂交分析第51-54页
     ·玉米组织总RNA 的提取第54-55页
     ·反转录第55-56页
   ·结果与分析第56-59页
     ·玉米 Mu 转座子突变体的 Mu1 转座特点分析第56-57页
     ·玉米 Mu 转座子突变体的 MuDR 表达活性检测第57-59页
   ·讨论第59-60页
第四章 玉米 Mu转座子突变体 DNA 甲基化表观遗传变异的分析第60-75页
   ·实验材料第60页
   ·研究方法(重亚硫酸盐测序法)第60-67页
   ·结果与分析第67-73页
     ·玉米 MUuDR 转座子DNA甲基化位点分析第67-68页
     ·玉米 MuDR 转座子DNA甲基化位点检测第68-73页
   ·讨论第73-75页
第五章 玉米 DCL、AGO 和 RDR 基因家族的鉴定和表达分析第75-103页
   ·实验材料第76-77页
     ·植物材料第76页
     ·酶及试剂第76页
     ·引物设计第76-77页
   ·仪器设备第77-78页
   ·基因组数据的获得第78页
   ·研究方法第78-79页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能基因的鉴定第78页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能蛋白的序列比对和系统发生分析第78页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能蛋白的保守基序和结构域分析第78页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能基因的染色体定位第78-79页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能基因的表达序列标签( EST)数据库分析第79页
     ·植物材料的胁迫处理第79页
     ·半定量 RT -PCR 分析第79页
   ·结果与分析第79-99页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能基因的鉴定和分析第79-84页
     ·玉米DCL 、AGO和RDR功能蛋白的系统发生分析第84-87页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能蛋白的保守基序和结构域分析第87-94页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能基因的染色体定位第94-95页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能基因的表达序列标签( EST)数据库分析第95-97页
     ·玉米 DCL 、AGO 和RDR功能基因在胁迫处理下的表达谱分析第97-99页
   ·讨论第99-103页
第六章 玉米 D NA 甲基化转移酶 (DMT) 基因家族的鉴定和表达分析第103-116页
   ·实验材料第103-104页
     ·植物材料第103-104页
     ·酶及试剂第104页
     ·引物设计第104页
   ·仪器设备第104页
   ·基因组数据的获得第104页
   ·研究方法第104-106页
     ·玉米 DMT功能基因的鉴定第104-105页
     ·玉米 DMT功能蛋白的序列比对和系统发生分析第105页
     ·玉米 DMT功能蛋白的保守基序和结构域分析第105页
     ·玉米 DMT 功能基因的染色体定位第105页
     ·植物材料的胁迫处理第105-106页
     ·半定量 RT -PCR 分析第106页
   ·结果与分析第106-114页
     ·玉米 DMT 功能基因的鉴定与分析第106-107页
     ·玉米 DMT功能蛋白的序列比较与系统发生分析第107-108页
     ·玉米 DM T 功能蛋白的保守基序和结构域分析第108-112页
     ·玉米 DMT功能蛋白基本结构的确定第112页
     ·玉米 DMT功能基因的染色体定位第112-113页
     ·玉米 DMT功能基因在胁迫处理下的表达谱分析第113-114页
   ·讨论第114-116页
结论第116-118页
参考文献第118-134页
致谢第134-135页
作者简介第135-136页
攻读博士学位期间发表的论文第136页

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