双序列比对线性空间算法的研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| ·引言 | 第7页 |
| ·生物信息学的序列比对 | 第7-8页 |
| ·生物序列比对算法研究现状 | 第8-10页 |
| ·论文主要研究内容 | 第10-13页 |
| 第二章 双序列全局比对算法 | 第13-23页 |
| ·序列比对算法基础 | 第13-14页 |
| ·序列比对算法中的动态规划算法 | 第14-18页 |
| ·算法思想 | 第14-16页 |
| ·算法伪代码描述 | 第16-17页 |
| ·算法分析 | 第17-18页 |
| ·线性空间 Hirschberg 算法 | 第18-23页 |
| ·算法理论依据 | 第18页 |
| ·算法思想 | 第18-21页 |
| ·算法分析 | 第21-23页 |
| 第三章 并行 Hirschberg 算法 | 第23-39页 |
| ·并行计算简介 | 第23-24页 |
| ·并行计算定义 | 第23页 |
| ·并行计算的研究内容 | 第23-24页 |
| ·并行算法设计原则 | 第24-25页 |
| ·并行 OpenMP 技术 | 第25-29页 |
| ·影响并行 Hirschberg 算法性能的因素 | 第29-33页 |
| ·数据分解 | 第29-30页 |
| ·任务与交互 | 第30-31页 |
| ·负载平衡的映射技术 | 第31页 |
| ·伪共享 | 第31-32页 |
| ·同步 | 第32-33页 |
| ·并行 Hirschberg 算法的设计与实现 | 第33-36页 |
| ·实验结果及分析 | 第36-39页 |
| 第四章 非递归 FA 算法 | 第39-49页 |
| ·FA 算法介绍 | 第39-41页 |
| ·非递归 FA 算法的设计与实现 | 第41-45页 |
| ·算法思想 | 第41-42页 |
| ·算法伪代码描述 | 第42-43页 |
| ·算法详细实现 | 第43-45页 |
| ·实验结果及分析 | 第45-49页 |
| 第五章 结束语 | 第49-51页 |
| ·全文总结 | 第49页 |
| ·研究的不足和前景 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-55页 |
