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1,2-萘醌类化合物抑制PTP-1B蛋白的构效关系及分子动力学模拟

摘要第1-4页
ABSTRACT第4-9页
第一章 文献综述第9-21页
   ·引言第9页
   ·PTP-1B的结构及其作用机制第9-12页
     ·PTP-1B的结构第9-11页
     ·PTP-1B在胰岛素信号通路中的调控作用第11-12页
   ·PTP-1B抑制剂的国内外研究现状第12-13页
   ·虚拟筛选与新药发现第13-19页
     ·计算机辅助药物设计的策略及方法第15-18页
       ·基于配体的药物设计方法第16页
       ·基于受体的药物设计方法第16-17页
       ·与组合化学相结合的药物设计方法第17-18页
     ·药物设计的基本思想第18-19页
   ·研究内容和研究意义第19-21页
第二章 1,2-萘醌类化合物三维定量构效关系的研究第21-42页
   ·实验材料第21-23页
   ·计算平台第23-24页
     ·硬件平台第23-24页
     ·软件平台 Sybyl 6.92第24页
   ·CoMFA和CoMSIA的实验建立过程第24-35页
     ·化合物分子构型的优化第25-26页
       ·初始构象的获得第25页
       ·全局构象搜索第25-26页
     ·有效活性构象的确定第26-28页
     ·模板选取及分子叠合第28-29页
     ·CoMFA QSAR的建立和PLS进行数理统计第29-33页
       ·电荷定义方式对CoMFA结果的影响第29-30页
       ·最佳Energy Cutoff值的搜索和建立CoMFA模型第30-32页
       ·空间网格间距对CoMFA结果的影响第32-33页
     ·CoMSIA QSAR的建立和PLS进行数理统计第33-35页
   ·QSAR模型的验证第35-38页
   ·讨论和分析第38-40页
     ·CoMFA模型第38页
     ·CoMFA系数等势图第38-39页
     ·CoMSIA模型第39-40页
     ·CoMSIA系数等势图第40页
   ·小结第40-42页
第三章 1,2-萘醌类化合物作用的分子动力学模拟第42-54页
   ·实验材料第42页
   ·计算平台第42页
   ·分子动力学模拟的实验建立过程第42-45页
     ·化合物分子构型的优化第43页
       ·初始构象的获得第43页
       ·全局构象搜索第43页
     ·有效活性构象的确定第43页
     ·分子动力学模拟第43-45页
       ·分子动力学过程第43-44页
       ·一系列化合物结合能的计算第44-45页
   ·结果分析第45-50页
     ·1,2-萘醌类化合物-蛋白质复合物的柔性第45-46页
     ·一系列化合物的结合能第46-49页
     ·结构分析第49-50页
   ·小结第50-54页
第四章 新型化合物分子的初步设计第54-63页
   ·药物分子设计中的相似性原理和方法第54-55页
   ·实验材料第55-56页
     ·硬件平台第55-56页
     ·软件平台第56页
   ·先导化合物的设计第56-60页
     ·活性位点的探索第56-57页
     ·文献支持第57页
     ·3D-QSAR分析总结第57页
     ·目标分子设计第57-60页
   ·实验过程的建立第60页
     ·化合物分子构型的建立和优化第60页
       ·初始构象的获得第60页
       ·全局构象搜索第60页
     ·分子对接及构象筛选第60页
   ·设计的结果及分析第60-62页
   ·小 结第62-63页
第五章 结论和展望第63-64页
   ·结论第63页
   ·展望第63-64页
参考文献第64-69页
发表论文和参加科研情况说明第69-70页
附录第70-79页
致谢第79页

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