摘要 | 第1-4页 |
ABSTRACT | 第4-9页 |
第一章 文献综述 | 第9-21页 |
·引言 | 第9页 |
·PTP-1B的结构及其作用机制 | 第9-12页 |
·PTP-1B的结构 | 第9-11页 |
·PTP-1B在胰岛素信号通路中的调控作用 | 第11-12页 |
·PTP-1B抑制剂的国内外研究现状 | 第12-13页 |
·虚拟筛选与新药发现 | 第13-19页 |
·计算机辅助药物设计的策略及方法 | 第15-18页 |
·基于配体的药物设计方法 | 第16页 |
·基于受体的药物设计方法 | 第16-17页 |
·与组合化学相结合的药物设计方法 | 第17-18页 |
·药物设计的基本思想 | 第18-19页 |
·研究内容和研究意义 | 第19-21页 |
第二章 1,2-萘醌类化合物三维定量构效关系的研究 | 第21-42页 |
·实验材料 | 第21-23页 |
·计算平台 | 第23-24页 |
·硬件平台 | 第23-24页 |
·软件平台 Sybyl 6.92 | 第24页 |
·CoMFA和CoMSIA的实验建立过程 | 第24-35页 |
·化合物分子构型的优化 | 第25-26页 |
·初始构象的获得 | 第25页 |
·全局构象搜索 | 第25-26页 |
·有效活性构象的确定 | 第26-28页 |
·模板选取及分子叠合 | 第28-29页 |
·CoMFA QSAR的建立和PLS进行数理统计 | 第29-33页 |
·电荷定义方式对CoMFA结果的影响 | 第29-30页 |
·最佳Energy Cutoff值的搜索和建立CoMFA模型 | 第30-32页 |
·空间网格间距对CoMFA结果的影响 | 第32-33页 |
·CoMSIA QSAR的建立和PLS进行数理统计 | 第33-35页 |
·QSAR模型的验证 | 第35-38页 |
·讨论和分析 | 第38-40页 |
·CoMFA模型 | 第38页 |
·CoMFA系数等势图 | 第38-39页 |
·CoMSIA模型 | 第39-40页 |
·CoMSIA系数等势图 | 第40页 |
·小结 | 第40-42页 |
第三章 1,2-萘醌类化合物作用的分子动力学模拟 | 第42-54页 |
·实验材料 | 第42页 |
·计算平台 | 第42页 |
·分子动力学模拟的实验建立过程 | 第42-45页 |
·化合物分子构型的优化 | 第43页 |
·初始构象的获得 | 第43页 |
·全局构象搜索 | 第43页 |
·有效活性构象的确定 | 第43页 |
·分子动力学模拟 | 第43-45页 |
·分子动力学过程 | 第43-44页 |
·一系列化合物结合能的计算 | 第44-45页 |
·结果分析 | 第45-50页 |
·1,2-萘醌类化合物-蛋白质复合物的柔性 | 第45-46页 |
·一系列化合物的结合能 | 第46-49页 |
·结构分析 | 第49-50页 |
·小结 | 第50-54页 |
第四章 新型化合物分子的初步设计 | 第54-63页 |
·药物分子设计中的相似性原理和方法 | 第54-55页 |
·实验材料 | 第55-56页 |
·硬件平台 | 第55-56页 |
·软件平台 | 第56页 |
·先导化合物的设计 | 第56-60页 |
·活性位点的探索 | 第56-57页 |
·文献支持 | 第57页 |
·3D-QSAR分析总结 | 第57页 |
·目标分子设计 | 第57-60页 |
·实验过程的建立 | 第60页 |
·化合物分子构型的建立和优化 | 第60页 |
·初始构象的获得 | 第60页 |
·全局构象搜索 | 第60页 |
·分子对接及构象筛选 | 第60页 |
·设计的结果及分析 | 第60-62页 |
·小 结 | 第62-63页 |
第五章 结论和展望 | 第63-64页 |
·结论 | 第63页 |
·展望 | 第63-64页 |
参考文献 | 第64-69页 |
发表论文和参加科研情况说明 | 第69-70页 |
附录 | 第70-79页 |
致谢 | 第79页 |