| 中文摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-15页 |
| 1 文献综述 | 第15-34页 |
| ·猪基因组的研究现状 | 第15-16页 |
| ·cDNA文库在筛选新基因中的应用 | 第16页 |
| ·CA3基因的研究进展 | 第16-22页 |
| ·CA3基因的研究进展 | 第17-19页 |
| ·CA3基因的特征 | 第17-18页 |
| ·CA3基因的功能 | 第18-19页 |
| ·CA家族其它成员的研究进展 | 第19-22页 |
| ·HUMMLC2B基因的研究进展 | 第22-24页 |
| ·分离的其它基因的研究进展 | 第24-27页 |
| ·与微管组装有关的基因 | 第24-25页 |
| ·核糖体蛋白基因 | 第25-26页 |
| ·其它基因 | 第26-27页 |
| ·实时荧光定量PCR的原理及应用 | 第27-32页 |
| ·实时荧光定量PCR相关的概念 | 第27-28页 |
| ·实时荧光定量PCR的原理 | 第28-30页 |
| ·实时荧光定量PCR的方法 | 第30-31页 |
| ·实时荧光定量PCR的应用 | 第31-32页 |
| ·亚细胞定位在基因功能研究中的地位及定位方法 | 第32-34页 |
| 2 本研究的目的和意义 | 第34-35页 |
| 3 材料与方法 | 第35-54页 |
| ·材料 | 第35-39页 |
| ·样品 | 第35-36页 |
| ·DNA样品 | 第35-36页 |
| ·组织样品 | 第36页 |
| ·载体和菌株 | 第36-37页 |
| ·试剂盒及酶 | 第37页 |
| ·主要试剂及配制 | 第37-39页 |
| ·主要试剂 | 第37页 |
| ·试剂的配制 | 第37-39页 |
| ·主要仪器设备 | 第39页 |
| ·主要分子生物学软件 | 第39页 |
| ·主要数据库 | 第39页 |
| ·方法 | 第39-54页 |
| ·候选基因cDNA全长序列的分离方法 | 第39-40页 |
| ·候选基因基因组全长序列的分离方法 | 第40-43页 |
| ·引物设计 | 第40页 |
| ·PCR扩增的条件 | 第40页 |
| ·PCR产物的纯化回收和克隆测序 | 第40-43页 |
| ·DNA序列同源性检索鉴定 | 第43页 |
| ·基因染色体定位的SCHP和RH法 | 第43-45页 |
| ·基因定位的引物设计 | 第43页 |
| ·PCR分型方法 | 第43-44页 |
| ·数据分析方法 | 第44-45页 |
| ·目的基因表达谱分析 | 第45-47页 |
| ·总RNA的提取 | 第45页 |
| ·cDNA的合成 | 第45页 |
| ·Real-time PCR引物和TaqMan探针的设计 | 第45-46页 |
| ·目的基因的组织表达谱分析 | 第46页 |
| ·目的基因在骨骼肌发育不同时期的表达谱分析 | 第46页 |
| ·表达谱的数据分析 | 第46-47页 |
| ·融合蛋白的亚细胞定位 | 第47-50页 |
| ·CA3和HUMMLC2B基因真核表达载体的构建 | 第47-49页 |
| ·细胞培养和转染 | 第49-50页 |
| ·细胞染色和融合蛋白的观察 | 第50页 |
| ·猪基因的多态性检测 | 第50-52页 |
| ·用PCR-RFLP方法检测基因多态 | 第50-51页 |
| ·用DHPLC方法检测基因多态 | 第51-52页 |
| ·猪基因与性状的关联分析 | 第52-54页 |
| 4 结果 | 第54-93页 |
| ·分离基因的全长cDNA序列结果 | 第54-61页 |
| ·猪CA3基因的序列分析结果 | 第54-59页 |
| ·猪CA3基因的序列特征 | 第54-58页 |
| ·猪CA3基因的进化树分析 | 第58-59页 |
| ·猪HUMMLC2B基因的序列分析结果 | 第59页 |
| ·分离的其它新基因的序列分析结果 | 第59-61页 |
| ·分离基因的染色体定位 | 第61-64页 |
| ·猪CA3基因的定位结果 | 第62-63页 |
| ·分离的其它新基因的定位结果 | 第63-64页 |
| ·目的基因的基因组序列分析结果 | 第64-67页 |
| ·猪CA3基因的基因组DNA序列分析结果 | 第64-66页 |
| ·猪HUMMLC2B基因的基因组DNA序列分析结果 | 第66-67页 |
| ·表达谱分析结果 | 第67-71页 |
| ·总RNA的提取和检测结果 | 第67页 |
| ·猪CA3基因的时空表达谱分析结果 | 第67-69页 |
| ·猪CA3基因的组织表达谱分析结果 | 第67-68页 |
| ·猪CA3基因在骨骼肌发育不同时期的表达谱分析结果 | 第68-69页 |
| ·猪HUMMLC2B的时空表达谱分析结果 | 第69-71页 |
| ·HUMMLC2B基因的组织表达谱分析结果 | 第69-70页 |
| ·HUMMLC2B基因在骨骼肌不同发育时期的表达谱分析结果 | 第70-71页 |
| ·融合蛋白的亚细胞定位 | 第71-75页 |
| ·猪CA3融合蛋白的亚细胞定位结果 | 第71-73页 |
| ·猪HUMMLC2B融合蛋白的亚细胞定位结果 | 第73-75页 |
| ·基因的多态性检测 | 第75-88页 |
| ·猪CA3基因的遗传多态性检测 | 第75-79页 |
| ·CA3基因G8603A位点的遗传多态性检测 | 第75-77页 |
| ·CA3基因G8370A位点的遗传态性检测 | 第77-78页 |
| ·G8371A和G8603A多态位点组成的单倍型分析 | 第78-79页 |
| ·猪HUMMLC2B基因的遗传多态性检测 | 第79-88页 |
| ·G1876A和T2005G位点的遗传多态性检测结果 | 第79-83页 |
| ·T1513C位点的遗传多态性检测结果 | 第83-85页 |
| ·G1094A位点的遗传多态性检测结果 | 第85-86页 |
| ·T1513C、G1876A和T2005G位点组成单倍型的分析结果 | 第86-87页 |
| ·C2672T、C2691T、C2731T和C2840T位点多态性检测结果 | 第87-88页 |
| ·猪基因多态与部分性状的关联分析 | 第88-93页 |
| ·CA3基因多态性与部分性状的关联分析 | 第90-91页 |
| ·CA3基因G8603A位点多态与部分性状的关联分析 | 第90页 |
| ·CA3基因G8371A位点多态与部分性状的关联分析 | 第90-91页 |
| ·猪HUMMLC2B基因多态.与部分性状的关联分析 | 第91-93页 |
| ·T2005G位点不同基因型与部分性状的关联分析 | 第91-92页 |
| ·G1876A位点不同基因型与部分性状的关联分析 | 第92页 |
| ·T1513C和G1094A位点多态与部分性状的关联分析 | 第92-93页 |
| 5 讨论 | 第93-102页 |
| ·关于新基因定位 | 第93页 |
| ·关于SNPs检测 | 第93-95页 |
| ·关于Real—time PCR技术 | 第95-96页 |
| ·PCR引物及TaqMan探针的设计 | 第95-96页 |
| ·扩增条件的优化 | 第96页 |
| ·表达谱的数据分析 | 第96页 |
| ·关于基因的表达谱分析 | 第96-98页 |
| ·猪CA3基因的表达谱分析 | 第97页 |
| ·猪HUMMLC2B基因的表达谱分析 | 第97-98页 |
| ·关于亚细胞定位 | 第98页 |
| ·细胞的染色 | 第98页 |
| ·HUMMLC2B融合蛋白在细胞中的位置 | 第98页 |
| ·关于猪CA3基因的分析 | 第98-99页 |
| ·关于HUMMLC2B的基因组结构分析 | 第99页 |
| ·关于基因与性状的关联分析 | 第99-101页 |
| ·猪CA3基因多态与性状的关联分析 | 第100-101页 |
| ·猪HUMMLC2B基因多态与性状的关联分析 | 第101页 |
| ·SNPs分型技术用于近交程度的检测 | 第101-102页 |
| 6 小结 | 第102-104页 |
| 参考文献 | 第104-120页 |
| 附录 | 第120-122页 |
| 附录1 缩略词表 | 第120-121页 |
| 附录2 主要性状的中英文对照和缩写 | 第121-122页 |
| 在读期间发表论文题录 | 第122-124页 |
| 致谢 | 第124-125页 |
